發(fā)布時(shí)間：2021-03-11 21:34

　　目的利用生物信息學(xué)方法對(duì)羊布魯氏菌Omp25蛋白進(jìn)行分析,預(yù)測(cè)其T細(xì)胞以及B細(xì)胞的優(yōu)勢(shì)抗原表位。方法從NCBI數(shù)據(jù)庫中獲取羊布魯氏菌的Omp25蛋白的氨基酸序列。應(yīng)用ProtParam在線軟件分析Omp25蛋白的理化性質(zhì),應(yīng)用SOMPA在線軟件分析Omp25蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu),應(yīng)用Phyre2及SWISS-MODEL在線軟件構(gòu)建并分析Omp25蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu),應(yīng)用ABCpred和BepiPred等在線軟件預(yù)測(cè)Omp25蛋白的B細(xì)胞抗原表位,應(yīng)用SYFPEITHI和IEDB在線軟件預(yù)測(cè)Omp25蛋白的T細(xì)胞抗原表位。結(jié)果 Omp25蛋白含有23個(gè)強(qiáng)堿性氨基酸,含有21個(gè)強(qiáng)酸性氨基酸,歸類為親水性穩(wěn)定蛋白,Omp25蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)中α-螺旋占24.88%,β-折疊占25.35%,β-轉(zhuǎn)角占2.82%,無規(guī)則卷曲占46.95%。聯(lián)合不同軟件的預(yù)測(cè)結(jié)果分析后,最終獲得1段CD4⁺T細(xì)胞優(yōu)勢(shì)抗原表位、3段CD8⁺T細(xì)胞優(yōu)勢(shì)抗原表位以及3段B細(xì)胞優(yōu)勢(shì)抗原表位。結(jié)論通過生物學(xué)信息的方法較為全面地預(yù)測(cè)了羊布魯氏菌Omp25蛋白的優(yōu)勢(shì)T細(xì)胞以及B細(xì)胞抗原表位,為進(jìn)一步... 

【文章來源】：新疆醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,43(04)

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

SOPMA在線軟件分析Omp25蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)

SWISS-Model模型

Phyre2模型

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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