甲型流感病毒不同亞型混合感染分析及N9亞型流感病毒NA基因進化分析
發(fā)布時間:2021-01-05 05:17
流感病毒可引起急性呼吸道傳染病并且該病毒每年都有不同規(guī)模的小流行,若干年一次全球范圍的大流行,給人類健康和經(jīng)濟的發(fā)展帶來負面影響。作為流感病毒表面包膜主要的兩種糖蛋白血凝素(hemagglutinin,HA)和神經(jīng)氨酸酶(neuraminidase,NA),不但與病毒的致病性有關(guān),同時HA和NA還要承受著外界環(huán)境的選擇壓力,在這些選擇壓力之下往往會引起HA和NA的變異,也會增加產(chǎn)生新型病毒的可能性。本研究共分為兩個方面對流感病毒不同亞型的共同感染及流感病毒的進化進行描述。希望借此為闡明流感病毒流行規(guī)律提供新的依據(jù)。第一部分目的:了解一例新甲型H1N1和季節(jié)性H3N2亞型流感混合感染病例中季節(jié)性H3N2亞型流感病毒和新甲型H1N1亞型流感病毒的HA和NA基因的變異情況。方法:鼻咽拭子的核酸樣本和細胞培養(yǎng)物100倍稀釋的核酸樣本經(jīng)實時熒光PCR方法鑒定流感病毒亞型。病毒經(jīng)MDCK細胞培養(yǎng)后進行紅細胞凝集試驗(HA)和紅細胞凝集抑制試驗(HI)。分離病毒毒株,提取核酸經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)方法擴增HA和NA基因,獲得測序結(jié)果與WHO推薦的疫苗株和疫苗相似毒株同源比對,使用生物信...
【文章來源】:天津醫(yī)科大學天津市 211工程院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
縮略語
前言
研究現(xiàn)狀、成果
研究目的、方法
一、流感不同亞型混合感染的檢測及HA和NA片段分析
1.1 對象和方法
1.1.1 資料來源
1.1.2 方法
1.2 結(jié)果
1.2.1 鼻咽拭子實時熒光PCR檢測結(jié)果
1.2.2 細胞培養(yǎng)檢測結(jié)果
1.2.3 季節(jié)性H3N2亞型流感病毒進化樹分析
1.2.4 氨基酸序列同源性分析
1.3 討論
1.4 小結(jié)
二、甲型N9亞型流感病毒神經(jīng)氨酸酶基因進化分析
2.1 對象和方法
2.1.1 資料來源
2.1.2 方法
2.2 結(jié)果
2.2.1 NA進化構(gòu)建結(jié)果
2.2.2 NA進化速率結(jié)果
2.2.3 進化選擇壓力和氨基酸置換熵值結(jié)果
2.3 討論
2.4 小結(jié)
結(jié)論
參考文獻
發(fā)表論文和參加科研情況說明
附錄
綜述 流感病毒NA結(jié)構(gòu)功能與耐藥性研究
綜述參考文獻
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]新型甲型H7N9流感病毒神經(jīng)氨酸酶基因進化分析[J]. 關(guān)蔚,林吉,李自雄,韓一芳,蘇彤,張宏偉,曹廣文. 第二軍醫(yī)大學學報. 2013(06)
[2]天津市2007—2010年流感監(jiān)測及H3亞型毒株HA1基因特性分析[J]. 孔梅,李曉燕,鄒明,蘇旭,郭麗茹,李琳,董曉春,徐文體. 環(huán)境與健康雜志. 2011(11)
[3]中國大陸季節(jié)性流感活動的時空分布特征[J]. 高燕,方立群,張勇,錢全,李亞品,徐翠玲,張燁,閆磊,楊華,柏延臣,楊紅,曹務(wù)春,舒躍龍. 中華流行病學雜志. 2009 (11)
[4]流感病毒神經(jīng)氨酸酶不同區(qū)域的作用[J]. 李向忠,方芳,陳則. 生命科學研究. 2005(S1)
[5]基于A*算法的啟發(fā)式算法求解多序列比對問題[J]. 袁激光,金人超,李紅濤. 華中科技大學學報(自然科學版). 2003(09)
[6]針對基因選擇性剪接的多序列比對算法研究[J]. 計宏凱,周晴,聞芳,季梁. 清華大學學報(自然科學版). 2001(09)
[7]甲型流感病毒抗原變異的機理[J]. 楊春,余佳. 國外醫(yī)學.病毒學分冊. 1999(03)
本文編號:2958097
【文章來源】:天津醫(yī)科大學天津市 211工程院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
縮略語
前言
研究現(xiàn)狀、成果
研究目的、方法
一、流感不同亞型混合感染的檢測及HA和NA片段分析
1.1 對象和方法
1.1.1 資料來源
1.1.2 方法
1.2 結(jié)果
1.2.1 鼻咽拭子實時熒光PCR檢測結(jié)果
1.2.2 細胞培養(yǎng)檢測結(jié)果
1.2.3 季節(jié)性H3N2亞型流感病毒進化樹分析
1.2.4 氨基酸序列同源性分析
1.3 討論
1.4 小結(jié)
二、甲型N9亞型流感病毒神經(jīng)氨酸酶基因進化分析
2.1 對象和方法
2.1.1 資料來源
2.1.2 方法
2.2 結(jié)果
2.2.1 NA進化構(gòu)建結(jié)果
2.2.2 NA進化速率結(jié)果
2.2.3 進化選擇壓力和氨基酸置換熵值結(jié)果
2.3 討論
2.4 小結(jié)
結(jié)論
參考文獻
發(fā)表論文和參加科研情況說明
附錄
綜述 流感病毒NA結(jié)構(gòu)功能與耐藥性研究
綜述參考文獻
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]新型甲型H7N9流感病毒神經(jīng)氨酸酶基因進化分析[J]. 關(guān)蔚,林吉,李自雄,韓一芳,蘇彤,張宏偉,曹廣文. 第二軍醫(yī)大學學報. 2013(06)
[2]天津市2007—2010年流感監(jiān)測及H3亞型毒株HA1基因特性分析[J]. 孔梅,李曉燕,鄒明,蘇旭,郭麗茹,李琳,董曉春,徐文體. 環(huán)境與健康雜志. 2011(11)
[3]中國大陸季節(jié)性流感活動的時空分布特征[J]. 高燕,方立群,張勇,錢全,李亞品,徐翠玲,張燁,閆磊,楊華,柏延臣,楊紅,曹務(wù)春,舒躍龍. 中華流行病學雜志. 2009 (11)
[4]流感病毒神經(jīng)氨酸酶不同區(qū)域的作用[J]. 李向忠,方芳,陳則. 生命科學研究. 2005(S1)
[5]基于A*算法的啟發(fā)式算法求解多序列比對問題[J]. 袁激光,金人超,李紅濤. 華中科技大學學報(自然科學版). 2003(09)
[6]針對基因選擇性剪接的多序列比對算法研究[J]. 計宏凱,周晴,聞芳,季梁. 清華大學學報(自然科學版). 2001(09)
[7]甲型流感病毒抗原變異的機理[J]. 楊春,余佳. 國外醫(yī)學.病毒學分冊. 1999(03)
本文編號:2958097
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