腸道菌群是人體生理、免疫系統(tǒng)發(fā)育、消化、發(fā)育和解毒反應(yīng)的重要場(chǎng)所,對(duì)人體健康有著深遠(yuǎn)的影響。腸道菌群的結(jié)構(gòu)和組成與多種疾病存在關(guān)聯(lián),越來越多研究證實(shí)腸道微生物群的失調(diào)與多種腸道疾病存在關(guān)聯(lián);不僅如此,最近的研究發(fā)現(xiàn)腸道微生物群與許多自身免疫性疾病,包括自身免疫性肝炎、脊柱炎、多發(fā)性硬化等都與腸道菌群有著千絲萬縷的聯(lián)系。已有研究表明,遺傳因素可以影響腸道菌群的組成。Williams Turpin等,關(guān)于宿主基因組與腸道菌群的關(guān)聯(lián)研究發(fā)現(xiàn),三分之一的腸道菌群受遺傳因素影響,他們鑒定出58個(gè)宿主SNP與33個(gè)細(xì)菌群豐度相關(guān)。Bonder等對(duì)荷蘭人群1514個(gè)樣本進(jìn)行研究,鑒定出影響人腸道微生物組的基因座,發(fā)現(xiàn)在MHC位點(diǎn)中,存在部分與腸道微生物組成相關(guān)的SNP,例如位于MUC22基因附近的SNP,提示HLA-II類分子可調(diào)控腸道菌群導(dǎo)致其結(jié)構(gòu)和功能的改變。在多種HLA轉(zhuǎn)基因小鼠模型中,均證實(shí)HLA等位與腸道菌群存在關(guān)聯(lián),例如有研究表明在HLA-DR3_AIH模型中,腸道微生物群發(fā)生了顯著改變,但在C57BL/6J小鼠中沒有改變,這意味著HLA等位的不同可能導(dǎo)致微生物群組成... 

【文章來源】：西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：67 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

實(shí)驗(yàn)方案

圖 4-3 序列有效長(zhǎng)度分布質(zhì)檢%的相似度對(duì)研究樣本進(jìn)行 OTU 分類，構(gòu)建稀釋曲線（ sobs（表征實(shí)際觀測(cè)到的物種數(shù)目），當(dāng)曲線趨向平坦，更多的數(shù)據(jù)量只會(huì)產(chǎn)生少量新的物種（如 OTU）。S趨向平坦時(shí)，說明測(cè)序數(shù)據(jù)量足夠大，可以反映樣本中信息圖 4-4 稀釋曲線 和 Shannon-Wiener 曲線

圖 4-3 序列有效長(zhǎng)度分布. 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)檢按照 97%的相似度對(duì)研究樣本進(jìn)行 OTU 分類，構(gòu)建稀釋曲線（圖 4-4）。多性指數(shù)為 sobs（表征實(shí)際觀測(cè)到的物種數(shù)目），當(dāng)曲線趨向平坦時(shí)，說明測(cè)序據(jù)量合理，更多的數(shù)據(jù)量只會(huì)產(chǎn)生少量新的物種（如 OTU）。Shannon-Wiene線，曲線趨向平坦時(shí)，說明測(cè)序數(shù)據(jù)量足夠大，可以反映樣本中絕大多數(shù)的微物多樣性信息


本文編號(hào)：2951696