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耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌同源性分析及傳播機(jī)制研究

發(fā)布時(shí)間:2020-10-21 13:44
   背景肺炎克雷伯菌是腸桿菌科中的最常見的細(xì)菌之一,也是醫(yī)院內(nèi)和社區(qū)感染的重要致病源。近年來臨床上檢出多重耐藥肺炎克雷伯菌日益增多,而碳青霉烯類抗生素是治療多重耐藥肺炎克雷伯菌的最常用的抗生素之一,因此肺炎克雷伯菌對(duì)碳青霉烯類抗生素耐藥率也逐年提高。然而不同國(guó)家和地區(qū)間耐碳青霉烯類的肺炎克雷伯菌流行病學(xué)特征存在較大差異,因此通過研究此類耐藥菌株的同源性及其傳播機(jī)制,對(duì)控制本地區(qū)菌株耐藥性傳播擴(kuò)散具有重要意義。目的通過系統(tǒng)的收集及研究我院耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌的臨床分布特征及耐藥性傳播機(jī)制,為臨床治療此類菌株引起的感染及控制耐藥性的傳播提供初步的實(shí)驗(yàn)室依據(jù)。方法采用WHONET軟件收集2012-2017年由莆田學(xué)院附屬醫(yī)院臨床分離的腸桿菌科細(xì)菌資料及分析。采用法國(guó)梅里埃VITEK 2-compact分析儀進(jìn)行菌株鑒定和藥敏試驗(yàn),改良Hodge試驗(yàn)和EDTA協(xié)同試驗(yàn)檢測(cè)耐藥表型,ERIC-PCR法及MLST法進(jìn)行同源性分析及分子分型。PCR法擴(kuò)增檢測(cè)碳青霉烯酶基因和膜孔蛋白基因,采用菌株耐藥性接合實(shí)驗(yàn)對(duì)細(xì)菌的質(zhì)粒進(jìn)行轉(zhuǎn)移,使用質(zhì)粒提取試劑盒對(duì)接合實(shí)驗(yàn)成功的接合子進(jìn)行質(zhì)粒提取,采用PCR法擴(kuò)增檢測(cè)質(zhì)粒DNA的碳青霉烯酶類基因。采用PCR法對(duì)接合實(shí)驗(yàn)成功的供體菌插入序列ISCR1、ISEcp1、IS2、IS26及Ⅰ類整合子基因int11、int12、int13等周圍可移動(dòng)元件進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果2012-2017年共收集到腸桿菌科9968株,分離出來的腸桿菌主要以肺炎克雷伯菌為主,共有5596株,占56.1%(5596/9968)。進(jìn)一步統(tǒng)計(jì)分析顯示耐碳青霉烯類的腸桿菌有1326,其中肺炎克雷伯菌1276株,占96.47%(1276/1326)。本研究選取的33株耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌細(xì)菌藥敏檢測(cè)顯示除了米諾環(huán)素外,對(duì)其他15種抗生素的耐藥率均在70%以上;耐藥表型結(jié)果顯示32株改良Hodge試驗(yàn)結(jié)果陽(yáng)性和1株EDTA協(xié)同試驗(yàn)陽(yáng)性;ERIC-PCR法及MLST法結(jié)果顯示29株為ST11/A型,2株ST15/B型、ST11/C和ST2193/D各1株,經(jīng)PCR擴(kuò)增法檢測(cè)結(jié)果顯示32株攜帶KPC基因,30株攜帶SHV基因,1株攜帶NDM-1基因,1株ompk35膜孔蛋白基因缺失和3株ompk36膜孔蛋白基因缺失未檢測(cè)出VIM、IMP、OXA-48、GES、GIM等其他耐藥基因;。細(xì)菌耐藥性接合實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示33株受試菌株有1株接合實(shí)驗(yàn)成功,PCR法擴(kuò)增供體菌和接合子質(zhì)粒結(jié)果均為NDM-1基因陽(yáng)性。未檢測(cè)到供體菌的插入序列ISCR1、ISEcp1、IS2、IS26和Ⅰ類整合子基因int11、int12、int13等周圍可移動(dòng)元件存在。結(jié)論本院耐碳青霉烯類腸桿菌以肺炎克雷伯菌為主,且對(duì)多種β-內(nèi)酰胺類抗生素耐藥,耐藥機(jī)制以產(chǎn)KPC酶為主,分子分型以ST11型為主,主要流行株為A克隆群,同源性程度高。1株肺炎克雷伯菌耐藥性接合實(shí)驗(yàn)成功,進(jìn)一步研究顯示該菌株耐藥性接合成功主要由質(zhì)粒介導(dǎo)完成,未發(fā)現(xiàn)插入序列ISCR1、ISEcp1、IS2、IS26及Ⅰ類整合子基因int11、int12、int13參與。
【學(xué)位單位】:南方醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:R446.5;R378
【部分圖文】:

分布圖,腸桿菌科細(xì)菌,碳青霉烯類,分布圖


1、2)??2012年-2017年腸桿菌科細(xì)菌分布情況??■?1.90J5-1?H1.669S??□?1.?90K-i?j??■?2.47SS-i?/??□?4.12?^?\?1?/?|?■肺炎克雷伯菌??^?')、?□陰溝腸桿菌??^■^■44.?94SS?]?f?氣腸桿菌??■苛異變形菌??.?84SS?■產(chǎn)酸克雷伯菌??■其他腸桿菌??圖1:?2012-2017年臨床分離的腸桿菌科細(xì)菌分布圖??2012年-2017年砑碳青梅春烯類揚(yáng)桿菌分布,況??

趨勢(shì)圖,碳青霉烯類,肺炎克雷伯菌,檢出率


2013年2月為19.2%,2013年2月至2014年2月為23.8%,2014年2月至2015??年2月為28.5%,2015年2月至2016年2月為25.0%及2016年2月至2017年??2月為17.5%。(趨勢(shì)如圖3)??2012年-2017年耐碳青霉稀類肺炎克雷伯菌檢出率趨勢(shì)圖??30.00%?2S.50%??25.00%?23.80%??|?■??■?■?■?■?|??_■■■■■??0.00%??2012.02-2013.02?2013.02-2014.02?2014.02-2015.02?2015.02-201S.02?2018.02-2017.02??圖3:?2012-2017年的耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌檢出率趨勢(shì)圖??2.2?33株CRKP臨床資料分析結(jié)果??2.2.1?33株CRKP菌株來源:33株菌株中有14株來源于肺泡灌洗液,13??株來源于上呼吸道的痰液,3株來源于尿液,1株來源于血液,1株來源于腦脊??液及1株來源于各類導(dǎo)管標(biāo)本。??2.2.2?33株CRKP菌株科室分布:33株菌株中來源于7個(gè)不同的科室,其??中重癥監(jiān)護(hù)病區(qū)17株,呼吸內(nèi)科7株,神經(jīng)外科3株,神級(jí)內(nèi)科2株,心胸外??科2株,泌尿外科及肝膽外科各1株。??2.2.3?33名患者患病情況:33例患者患有肺部感染及肺部相關(guān)的基礎(chǔ)病得??18??

菌株,試驗(yàn)結(jié)果,碳青霉烯類,碳青霉烯


?第二章?耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌耐藥表型檢測(cè)及同源性分析???呋喃妥因?當(dāng)32?64?蓋128?33?0?0?100??復(fù)方新諾明?含?2/3?8?-?§4/76?22?1?10?69.7??左旋氧氟沙星?含2?4?差8?33?0?0?100??優(yōu)立新?S8?16?S32?33?0?0?100??2.4改良Hodge試驗(yàn)結(jié)果??改良Hodge試驗(yàn)陽(yáng)性的菌株30株,陽(yáng)性率為90.?9%?(30/33),提示可能??產(chǎn)碳青霉烯酶。(如圖4)??
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本文編號(hào):2850189

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