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一種基于新型再測(cè)序芯片的不明原因呼吸道感染樣品檢測(cè)方法的建立

發(fā)布時(shí)間:2019-12-03 23:17
【摘要】:再測(cè)序芯片(Resequencing Pathogen Microarray,RPM)是一種新的基于微陣列DNA芯片的病原體檢測(cè)與鑒定技術(shù)。為了將RPM應(yīng)用于不明原因呼吸道感染的檢測(cè),提高應(yīng)對(duì)傳染病暴發(fā)的能力,本研究建立了基于一種新型RPM的呼吸道多病原檢測(cè)方法。該方法可以同時(shí)檢測(cè)19種常見呼吸道病毒、9種甲型流感(Flu A)和11種鼻病毒(HRV)、28種腸病毒、18種少見呼吸道病毒。選取已驗(yàn)證的16種常見呼吸道病毒感染陽(yáng)性的樣本評(píng)價(jià)RPM的特異性,用克隆質(zhì);蝮w外轉(zhuǎn)錄的RNA梯度稀釋液來(lái)檢驗(yàn)RPM的靈敏度,在10~103拷貝/反應(yīng)水平時(shí)RPM仍能檢測(cè)和分辨出相近的病毒亞型。將8份不明原因的咽拭子樣品提取的核酸合并,用新建立的方法進(jìn)行檢測(cè),根據(jù)RPM結(jié)果再以普通PCR加測(cè)序作為驗(yàn)證,同時(shí)和Abbott公司的質(zhì)譜測(cè)序(PLEX-ID)結(jié)果進(jìn)行比較,除RPM檢出假陽(yáng)性PIV1外,三者的其余檢測(cè)結(jié)果一致。結(jié)果表明,這種基于新型RPM的方法具有高靈敏度、高通量的優(yōu)點(diǎn),對(duì)應(yīng)對(duì)新發(fā)和突發(fā)傳染病具有重要意義。

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本文編號(hào):2569353

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