發(fā)布時(shí)間：2018-06-17 11:55

  本文選題：隨機(jī)生存森林 + 偏Cox回歸　； 參考：《中國(guó)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)》2013年06期

【摘要】：目的探討隨機(jī)生存森林(RSF)在高維基因組數(shù)據(jù)生存分析中的應(yīng)用和適用性。方法通過(guò)模擬實(shí)驗(yàn)和實(shí)際數(shù)據(jù)分析,對(duì)隨機(jī)生存森林、生存支持向量機(jī)(SSVM)和偏Cox回歸(PCR)三種方法進(jìn)行比較,并用生存預(yù)測(cè)的一致性錯(cuò)誤率對(duì)其進(jìn)行評(píng)價(jià)。結(jié)果模擬實(shí)驗(yàn)表明,在有交互作用的情況下,RSF的log-rank和logrankscore方法的預(yù)測(cè)效果均優(yōu)于SSVM和PCR方法;實(shí)際數(shù)據(jù)分析結(jié)果顯示,隨機(jī)生存森林與生存支持向量機(jī)和偏Cox回歸的預(yù)測(cè)效果相近,應(yīng)用RSF方法篩選變量后建立的RSF模型能夠在一定程度上提高預(yù)測(cè)效果。結(jié)論隨機(jī)生存森林方法適用于高維生存數(shù)據(jù)的研究,對(duì)疾病的生存時(shí)間預(yù)測(cè)和預(yù)后因素分析具有實(shí)用價(jià)值。
[Abstract]:Objective to investigate the application and applicability of RSFs in survival analysis of high dimensional genomic data. Methods through simulation experiments and actual data analysis, the three methods of random survival forest, survival support vector machine (SSVM) and partial Cox regression (PCR) were compared, and the consistency error rate of survival prediction was evaluated. Results the simulation results show that the prediction effect of log-rank and logrankscore methods is better than that of SSVM and logrankscore methods in the case of interaction, and the actual data analysis results show that, The prediction effect of random survival forest is similar to that of survival support vector machine and partial Cox regression. The RSF model established by RSF method can improve the prediction effect to some extent. Conclusion the random survival forest method is suitable for the study of high dimensional survival data and has practical value in predicting the survival time of disease and analyzing the prognostic factors.
【作者單位】： 哈爾濱醫(yī)科大學(xué)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)教研室;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金資助(81172767) 高等學(xué)校博士學(xué)科專(zhuān)項(xiàng)基金(20122307110004) 伍連德青年科學(xué)基金(WLD-QN1105)
【分類(lèi)號(hào)】：R341

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 武曉巖;李康;;隨機(jī)森林方法在基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析中的應(yīng)用及研究進(jìn)展[J];中國(guó)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì);2009年04期

【共引文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前3條

1 李放歌;王志鵬;戶(hù)國(guó);李輝;;全基因組關(guān)聯(lián)研究中的交互作用研究現(xiàn)狀[J];遺傳;2011年09期

2 陳金甌;柳青;;DNA微陣列數(shù)據(jù)判別的旋轉(zhuǎn)森林方法[J];中國(guó)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì);2012年04期

3 孫鳳宇;李貞子;侯艷;李康;;基于小波變換的代謝組色譜指紋圖譜的判別分析[J];中國(guó)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì);2013年02期

相關(guān)會(huì)議論文 前1條

1 張濤;李貞子;武曉巖;李康;;隨機(jī)森林回歸分析方法及在代謝組學(xué)中的應(yīng)用[A];2011年中國(guó)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)年會(huì)會(huì)議論文集[C];2011年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前2條

1 任曉衛(wèi);上海地區(qū)人群甲型流感HA抗原進(jìn)化與基因進(jìn)化關(guān)系研究及H1N1流感潛在免疫顯性位點(diǎn)的篩選[D];復(fù)旦大學(xué);2010年

2 邱智軍;蛋白質(zhì)結(jié)合位點(diǎn)預(yù)測(cè)方法研究與應(yīng)用[D];大連理工大學(xué);2012年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前2條

1 惠娜;近紅外光譜分析技術(shù)在黨參及復(fù)方丹參片質(zhì)量控制中的應(yīng)用[D];蘭州大學(xué);2011年

2 朱晶晶;高維病例—對(duì)照研究中交互作用的隨機(jī)森林分析方法探討[D];南京醫(yī)科大學(xué);2012年

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 李民;楊連娟;涂宏剛;李佳琳;鞠強(qiáng);李莉;章強(qiáng)強(qiáng);;小鼠播散性馬爾尼菲青霉菌感染模型的建立及其生存率分析[J];中國(guó)皮膚性病學(xué)雜志;2010年06期

2 何培芳,何川,吳天清,劉鴻蓮,胡新珉,李正國(guó),何倫德,辛浩洋,袁支潤(rùn),張子彬,羅德誠(chéng);人體心臟舒張最大吸力的模擬實(shí)驗(yàn)研究[J];中國(guó)醫(yī)學(xué)物理學(xué)雜志;2004年01期

3 熊林平,曹秀堂,孟岳良,郭祖超;臨床隨訪資料的Markov模型構(gòu)建與應(yīng)用研究[J];第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào);1999年06期

4 梁正東,王開(kāi)發(fā),楊旭;Breslow算法非容許誤差校正[J];第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào);2003年18期

5 范志民,鄒本榮,劉國(guó)津,邱吉慶,張吉斌;鼠移植膠質(zhì)瘤手術(shù)加光敏治療的實(shí)驗(yàn)研究[J];中國(guó)激光醫(yī)學(xué)雜志;1996年03期

6 賀憲民,賀佳,范思昌;徑向基網(wǎng)絡(luò)及用于生存預(yù)測(cè)的探討[J];醫(yī)學(xué)信息;2001年08期

7 蘇景銘, 趙守軍;“最小”C＿p法一一多元回歸中變量篩選的一種算法[J];山西醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);1994年02期

8 趙耐青;生存分析的最小樣本含量計(jì)算[J];上海醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);1994年05期

9 蔡泳;病例隨訪資料的統(tǒng)計(jì)分析方法——生存分析[J];上�？谇会t(yī)學(xué);2004年04期

10 趙耐青,高峻;多結(jié)局Cox模型在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用和Stata實(shí)現(xiàn)[J];中國(guó)醫(yī)院統(tǒng)計(jì);2004年04期

相關(guān)會(huì)議論文 前1條

1 劉納新;管敏強(qiáng);陳通克;施紅旗;姚建高;張啟瑜;;兩種大鼠急性壞死性胰腺炎模型的比較和改良[A];2007年浙江省外科學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2007年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前6條

1 韓棟;生存分析中非劣效臨床試驗(yàn)樣本量估計(jì)方法研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2013年

2 任曉衛(wèi);半?yún)?shù)加速失效時(shí)間模型及其在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用[D];山西醫(yī)科大學(xué);2007年

3 趙景義;長(zhǎng)期生存者資料的參數(shù)混合模型[D];山西醫(yī)科大學(xué);2008年

4 李艷芳;飲食限制對(duì)雌性老齡大鼠抗衰老效應(yīng)的實(shí)驗(yàn)研究[D];山西醫(yī)科大學(xué);2010年

5 王印;人類(lèi)細(xì)胞周期及凋亡網(wǎng)絡(luò)的模型建立與模擬分析研究[D];哈爾濱工業(yè)大學(xué);2010年

6 龐裕;多位點(diǎn)基因關(guān)聯(lián)分析[D];華東師范大學(xué);2012年

，

本文編號(hào)：2030953