本文關(guān)鍵詞：生物信息學(xué)輔助克隆和分析人GLUT-9基因啟動(dòng)子

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【摘要】：目的:對(duì)人GLUT-9基因5′-非翻譯區(qū)進(jìn)行克隆,并對(duì)其啟動(dòng)子和轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)進(jìn)行生物信息學(xué)分析,為后續(xù)的GLUT-9基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究奠定基礎(chǔ)。方法:通過(guò)搜索網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(kù),得到GLUT-9基因翻譯起始點(diǎn)上游約2 kb的序列。以人總DNA為模板,采用PCR方法進(jìn)行序列克隆。運(yùn)用BDGP:Neural Network Promoter Prediction軟件對(duì)上述序列進(jìn)行分析,預(yù)測(cè)出該段序列可能的啟動(dòng)子區(qū)域;運(yùn)用TFSEARCH軟件分析潛在的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)。結(jié)果:人GLUT-9基因的啟動(dòng)子可能位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游反義鏈的-550到-503區(qū),序列上存在包括CdxA、SRY和Lyf-1等12個(gè)轉(zhuǎn)錄因子的潛在結(jié)合位點(diǎn)。結(jié)論:克隆得到人GLUT-9基因5′-非翻譯區(qū)2 kb的序列,對(duì)人GLUT-9基因啟動(dòng)子和5′-非翻譯區(qū)調(diào)控區(qū)序列進(jìn)行了初步的生物信息學(xué)分析,為后續(xù)試驗(yàn)提供了研究基礎(chǔ)。
【作者單位】： 南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科;
【基金】：廣東省科技計(jì)劃項(xiàng)目(編號(hào):2011B061300004) 廣東省自然科學(xué)基金(編號(hào):S2011010002975)
【分類號(hào)】：R346
【正文快照】： 葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白-9(facilitated glucose trans-porter 9,GLUT-9)基因位于4p15.3-p16,全長(zhǎng)214 025 bp,含1個(gè)非編碼區(qū)外顯子和13個(gè)編碼區(qū)外顯子,編碼葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)體9(glucose transporter9,GLUT9)[1]。對(duì)多個(gè)國(guó)家的白種人群運(yùn)用基因芯片進(jìn)行全基因組掃描分析發(fā)現(xiàn)GLUT-9基因的遺傳

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

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【相似文獻(xiàn)】

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中國(guó)重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條

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2 錢錚;人類DNA上啟動(dòng)子數(shù)量可能超過(guò)19萬(wàn)個(gè)[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報(bào);2006年

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中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

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5 宋斐;胚乳特異性ALP type-B基因啟動(dòng)子的克隆及其功能分析[D];華中科技大學(xué);2012年

6 姜安麗;人同源盒基因NKX3.1啟動(dòng)子的克隆及其調(diào)控區(qū)的鑒定[D];山東大學(xué);2005年

7 岳揚(yáng)波;AAV-2 P5啟動(dòng)子功能的分子基礎(chǔ)研究[D];復(fù)旦大學(xué);2009年

8 聶秀玲;化學(xué)誘導(dǎo)啟動(dòng)子的克隆、定點(diǎn)突變及功能分析[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué);2003年

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中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 何文s，

本文編號(hào)：1248940