本文關鍵詞：巴曲酶的線性和構象型B細胞抗原表位的預測

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【摘要】：目的:預測巴曲酶的B細胞線性表位和構象型表位,本項目的預期成果可為該藥物的安全化應用提供新思路。方法:基于巴曲酶的蛋白質序列,采用DNAStar軟件和ABCpred、BCPREDS、BcePred和BepiPred 1.0服務器預測巴曲酶的線性表位。以蝮蛇毒蛋白C激活劑蛋白的晶體結構為模板,利用MODELLER9.10軟件中的Pythonwin程序進行該酶的同源模建,并利用PROCHECK、ERRAT及PROSA程序進行合理化評價。根據(jù)巴曲酶的模建三維結構并結合DiscoTope和cons PPISP網絡數(shù)據(jù)庫預測構象型抗原表位。結果:得到肽端AA3~9、19~31、57~82、93~101、106~114、127~142、171~183、196~208、223~230區(qū)域為巴曲酶的B細胞線性表位優(yōu)勢區(qū)域。然后得到蛋白的N端41~48、57~71、76~82、93~100、109~115、127~133、146~152、194~203區(qū)段為B細胞構象型表位區(qū)域。結論:這些B細胞抗原表位可為降低巴曲酶的免疫原性提供實驗依據(jù)。
【作者單位】： 大連理工大學生命科學與技術學院;
【基金】：國家自然科學基金項目(81102378) 中央高�；究蒲袠I(yè)務費專項資金資助(DUT11SM02)
【分類號】：R392
【正文快照】： 1963年Klobusitzi和Konig從美洲矛頭蝮蛇(Bothrops atrox moojenii)毒液中分離得到一種絲氨酸蛋白水解酶,即巴曲酶(Batroxobin,EC 3.4.21.29)。該酶的基因已經被克隆,并在畢赤酵母系統(tǒng)里進行了重組表達,其部分生化性質也得到研究[1,2]。它能特異性裂解纖維蛋白原α鏈中Arg16-G

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本文編號：1154453