EGF對hAMSCs基因表達譜影響及生物信息學分析
本文關鍵詞:EGF對hAMSCs基因表達譜影響及生物信息學分析
更多相關文章: 表皮生長因子 人羊膜間充質干細胞 基因表達譜 測序 生物信息學
【摘要】:目的探討表皮生長因子(EGF)對人羊膜間充質干細胞(hAMSCs)基因表達譜影響及分子機制。方法采用基因表達譜測序(Illumina RNA-Seq)技術和生物信息學分析方法,對100 ng/mL EGF干預前后的hAMSCs基因表達測序比對,確定hAMSCs基因表達譜,RT-PCR檢測進行驗證。結果篩選出差異表達基因104個(FDR≤0.001和|log2Ratio|≥1),其中上調差異表達基因56個,下調差異表達基因48個;GO生物學過程富集分析26個生物學過程具有顯著性差異(P≤0.05);KEGG信號通路富集分析細胞因子與細胞因子相互作用信號通路具有顯著性差異(Q≤0.05),RT-PCR檢測驗證與基因表達譜結果一致。結論 EGF干預hAMSCs引起基因表達譜的變化,顯著差異表達的基因和信號通路可能在hAMSCs增殖和遷移及促進創(chuàng)傷修復過程中具有重要作用。
【作者單位】: 中國醫(yī)科大學
【關鍵詞】: 表皮生長因子 人羊膜間充質干細胞 基因表達譜 測序 生物信息學
【基金】:國家重點基礎研究發(fā)展規(guī)劃(2012CB518103) 國家自然科學基金(81370883) 遼寧省科學技術計劃(2012225080) 沈陽市科學技術計劃(F11-262-9-01)
【分類號】:R329.28
【正文快照】: 表皮生長因子(epidermal growth factor,EGF)是細胞有絲分裂的刺激原,可以加快細胞分裂、促進增值、改變細胞的趨化性、增加細胞的遷移;應用EGF可以明顯增加創(chuàng)面內膠原和細胞DNA含量,加速創(chuàng)面愈合[1],已在皮膚創(chuàng)傷和眼部等疾病的治療中應用[2]。人羊膜間充質干細胞(human amni
【參考文獻】
中國期刊全文數據庫 前1條
1 李彩虹;施萍;龐希寧;;表皮生長因子影響人羊膜間充質干細胞遷移的機制[J];中國醫(yī)學科學院學報;2011年06期
【共引文獻】
中國期刊全文數據庫 前8條
1 郎宏鑫;龐希寧;;人羊膜對皮膚創(chuàng)傷修復作用的研究進展[J];基礎醫(yī)學與臨床;2013年11期
2 龐希寧;王竟;施萍;孟濤;霍雙枝;張殿寶;譚麗萍;;人羊膜間充質干細胞的超微結構觀察[J];基礎醫(yī)學與臨床;2013年11期
3 張濤;龐希寧;施萍;王竟;王喜良;;水通道蛋白1促進人羊膜間充質干細胞的遷移[J];基礎醫(yī)學與臨床;2013年11期
4 龐希寧;劉曉玉;施萍;王竟;林學文;張殿寶;譚麗萍;;人羊膜間充質干細胞儲備庫的構建[J];基礎醫(yī)學與臨床;2013年11期
5 繆黃泰;吳星欣;辛毅;王曉;甄雷;聶紹平;;細胞生長因子對正常氧和低氧條件下犬骨髓間充質干細胞遷移的影響[J];中國醫(yī)藥生物技術;2013年05期
6 余洪松;凌琳;謝峻;姜宏;施廣飛;;丹參注射液對小鼠急性心肌梗死后心臟成體干細胞移植的影響[J];中國中西醫(yī)結合雜志;2013年11期
7 姜磊;胡祥;王文俊;康新;王小周;;趨化因子受體CXCR1及CXCR2在胃癌腹膜轉移中的表達及意義[J];中國腫瘤外科雜志;2013年05期
8 張小杰;曹麗娟;楊磊;余琳;沈yN玨;楊克;劉艷;;糖基化終末產物抑制骨髓間充質干細胞增殖的機制研究[J];診斷學理論與實踐;2013年05期
中國博士學位論文全文數據庫 前5條
1 張明慧;人骨髓間充質干細胞對肺癌細胞增殖轉移及自噬凋亡的調控作用研究[D];第三軍醫(yī)大學;2013年
2 左偉;脂聯素對骨關節(jié)炎滑膜細胞及軟骨干細胞作用的研究[D];北京協和醫(yī)學院;2013年
3 季茹;肝臟脫細胞生物支架的制備及誘導骨髓間充質干細胞肝向分化的研究[D];第四軍醫(yī)大學;2013年
4 王俊普;CXCR1/2在胃癌細胞增殖、遷移和侵襲中的作用及機制[D];中南大學;2013年
5 狄國虎;間充質干細胞(MSCs)用于腫瘤化療輔助治療及與腫瘤生長關系的實驗研究[D];天津大學;2012年
中國碩士學位論文全文數據庫 前5條
1 郝曉娟;缺氧高糖預處理hUC-MSCs誘導分化為內皮樣細胞的實驗研究[D];河北醫(yī)科大學;2013年
2 付生龍;C/EBPβ調控EPCs中SDF-1a表達對RAW264.7的趨化作用[D];第三軍醫(yī)大學;2013年
3 陳鵬;FGFR2功能增強在小鼠出生早期對軟骨內成骨的作用和機制研究[D];第三軍醫(yī)大學;2013年
4 王奇;慢病毒介導過表達CXCR4基因修飾臍帶間充質干細胞體外遷移研究[D];天津醫(yī)科大學;2013年
5 朱紅巖;石見穿多糖抑制人胃癌細胞系MGC-803細胞增殖、遷移的作用及其對人胃癌細胞系MGC-803細胞中白細胞介素-8表達的影響[D];承德醫(yī)學院;2013年
【二級參考文獻】
中國期刊全文數據庫 前1條
1 李彩虹;施萍;龐希寧;;表皮生長因子干預人羊膜間充質干細胞的增殖和遷移[J];中國組織工程研究與臨床康復;2011年23期
【相似文獻】
中國期刊全文數據庫 前10條
1 葉一秀,王穎,王安生,王巍;血清、唾液和尿液表皮生長因子的含量測定[J];標記免疫分析與臨床;1994年01期
2 歐陽春;表皮生長因子及其受體與腫瘤[J];國外醫(yī)學.消化系疾病分冊;1994年03期
3 曲伸,謝延俠,梁秋紅,趙麗榮,劉英;表皮生長因子口服液治療十二指腸球部潰瘍64例療效觀察[J];中國實用內科雜志;1995年07期
4 鄭磊,何淑芳,范忠義,韓傳貴;淚腺多形性腺瘤表皮生長因子受體表達與DNA含量的關系[J];中華眼科雜志;1996年02期
5 楊永秀,李潭,王秀華,張友南;表皮生長因子與三苯氧胺對兔子宮內膜細胞生長的影響[J];生殖醫(yī)學雜志;1997年01期
6 黎曼儂,唐向輝,周曾娣,湯國民,朱高紅;男性不育患者精漿中表皮生長因子含量測定[J];云南醫(yī)藥;1999年01期
7 林星,王芳,關國平;表皮生長因子及其受體與風濕病[J];醫(yī)學綜述;2003年08期
8 羅萍,鄒全明,王曉勤,馬穎;抗重組人表皮生長因子單克隆抗體的制備及生物學特性鑒定[J];免疫學雜志;2004年04期
9 張烽,陳向東,王友華,曹涌,祝勇,朱鳴鏑;外源性表皮生長因子與神經生長因子對鼠坐骨神經再生影響的比較研究[J];南通大學學報(醫(yī)學版);2004年04期
10 穆林菁,樓善賢,朱壽田,徐慶才;表皮生長因子受體在子宮內膜樣腺癌中的表達[J];實用腫瘤學雜志;2005年03期
中國重要會議論文全文數據庫 前10條
1 王琦;李雪;劉彥;朱志兵;薛英威;傅松濱;;應用基因表達譜芯片研究胃癌基因表達譜[A];中國的遺傳學研究——中國遺傳學會第七次代表大會暨學術討論會論文摘要匯編[C];2003年
2 蔡彥寧;溫玫;張愚;陳彪;;帕金森患者尾狀核中基因表達譜研究[A];中華醫(yī)學會第七次全國神經病學學術會議論文匯編[C];2004年
3 石文靜;陳超;胡寶洋;龔紅華;周國民;;新生小鼠視網膜病變的基因表達譜變化[A];2006(第三屆)江浙滬兒科學術會議暨浙江省兒科學術年會論文匯編[C];2006年
4 于英男;洪源;李燁;成軍;李燕;;刀豆素蛋白引起免疫性肝損傷小鼠肝臟基因表達譜變化[A];第十屆全國生化與分子藥理學術會議論文摘要匯編[C];2007年
5 孫開來;郝冬梅;孫秀菊;鄭志紅;富偉能;;胃癌發(fā)生發(fā)展過程中基因表達譜檢測[A];中國的遺傳學研究——中國遺傳學會第七次代表大會暨學術討論會論文摘要匯編[C];2003年
6 劉培強;謝青松;朱大銘;;用于基因表達譜數據聚類分析的貪心圖劃分算法研究[A];2006年全國理論計算機科學學術年會論文集[C];2006年
7 高瑞蘭;陳小紅;林筱潔;錢煦岱;徐衛(wèi)紅;吳超群;;三七皂苷誘導造血細胞基因表達譜的研究[A];2005年華東六省一市血液病學學術會議暨浙江省血液病學學術年會論文匯編[C];2005年
8 張進;肖波;吳志國;李國良;楊曉蘇;李靜;;顳葉癲癇大鼠模型海馬基因表達譜和蛋白表達譜的研究[A];中華醫(yī)學會第七次全國神經病學學術會議論文匯編[C];2004年
9 高瑞蘭;陳小紅;林筱潔;錢煦岱;徐衛(wèi)紅;吳超群;;三七皂苷誘導造血細胞基因表達譜的研究[A];第三屆海峽兩岸中西醫(yī)結合學術研討會論文集[C];2005年
10 吳紅金;呂俊萍;馬增春;王升啟;;川芎嗪對培養(yǎng)人臍靜脈內皮細胞基因表達譜的影響[A];第六次全國中西醫(yī)結合血瘀證及活血化瘀研究學術大會論文匯編[C];2005年
中國重要報紙全文數據庫 前10條
1 曾繁玉 魏妍平;表皮生長因子研究獲突破[N];健康報;2004年
2 楊昆;表皮生長因子——修復健康與美麗[N];經濟參考報;2002年
3 楊昆;表皮生長因子[N];中國醫(yī)藥報;2002年
4 楊昆;神奇的表皮生長因子[N];山東科技報;2002年
5 記者 衣曉峰 通訊員 李小蓮;探尋“證”的基因表達譜[N];中國中醫(yī)藥報;2009年
6 ;聚類分析在自身免疫病基因表達譜研究中的初步應用[N];中國醫(yī)藥報;2003年
7 劉睿;脾胃虛弱不妨鼓漱叩齒[N];醫(yī)藥養(yǎng)生保健報;2007年
8 ;表皮生長因子受體抑制劑在治療非小細胞肺癌中的作用[N];醫(yī)藥經濟報;2005年
9 唐珍;老人多鼓腮有助消化[N];中國中醫(yī)藥報;2007年
10 記者 張學全 張建松;我人類功能基因研究獲重要進展[N];新華每日電訊;2000年
中國博士學位論文全文數據庫 前10條
1 田素禮;應用基因表達譜芯片探討Oxaliplatin誘導人結腸癌細胞凋亡分子機制的實驗研究[D];吉林大學;2005年
2 胡吉;垂體瘤組織基因表達譜及發(fā)病機制研究[D];復旦大學;2005年
3 黃志剛;應用腫瘤基因解剖工程數據庫及RNA干擾技術檢測大腸癌基因表達譜[D];復旦大學;2005年
4 黃靜;扶正增效方對非小細胞肺癌放射增敏的臨床及基因表達譜研究[D];北京中醫(yī)藥大學;2006年
5 姚實林;陽虛質理論及其外周血基因表達譜研究[D];北京中醫(yī)藥大學;2007年
6 馬麗娟;利用激光捕獲顯微切割及基因芯片技術構建喉鱗狀細胞癌基因組差異表達譜[D];中南大學;2008年
7 周美啟;針刺心經與小腸經干預急性心肌缺血大鼠心臟和下丘腦基因表達譜比較研究[D];廣州中醫(yī)藥大學;2005年
8 祝驥;人紅白血病K562細胞基因表達譜芯片制作及應用研究[D];華南理工大學;2002年
9 張騫;紅色毛癬菌孢子EST構建及基因表達譜分析[D];吉林大學;2007年
10 郭幫富;骨質疏松癥患者成骨細胞基因表達與中醫(yī)證型的相關性研究[D];廣州中醫(yī)藥大學;2008年
中國碩士學位論文全文數據庫 前10條
1 孫清;尿表皮生長因子水平變化對紫癲性腎炎早期診斷價值的探討[D];青島大學;2005年
2 楊郁;PI3K/Akt-PAK1信號通路在表皮生長因子誘導乳腺癌細胞遷移中作用機制的研究[D];南京醫(yī)科大學;2010年
3 韓雪冰;HCG調節(jié)先天性尿道下裂小鼠陰莖皮膚EGF含量的實驗研究[D];山西醫(yī)科大學;2005年
4 王煉煉;表皮生長因子EGF與未成熟卵母細胞體外成熟的相關研究[D];重慶醫(yī)科大學;2005年
5 卞英偉;表皮生長因子對豚鼠慢性鼓膜穿孔愈合的影響[D];大連醫(yī)科大學;2005年
6 鄭莉萍;原癌基因c-erbB2在表皮生長因子調控小鼠卵母細胞體外成熟中的作用[D];江西醫(yī)學院;2005年
7 吳鳳宇;人輸卵管上皮細胞共培養(yǎng)和表皮生長因子對小鼠受精卵體外發(fā)育影響[D];天津醫(yī)科大學;2006年
8 高竹娟;肝素對大鼠外傷性鼓膜穿孔愈合的影響[D];山西醫(yī)科大學;2009年
9 歐陽海峰;肺表面活性物質在哮喘大鼠氣道重塑中的作用及機制[D];第四軍醫(yī)大學;2005年
10 任于果;大鼠胚腦皮層源性神經干細胞體外培養(yǎng)及增殖分化特點[D];安徽醫(yī)科大學;2005年
,本文編號:1110006
本文鏈接:http://www.sikaile.net/yixuelunwen/jichuyixue/1110006.html