Sp110基因rs1135791、rs722555多態(tài)性與結(jié)核病的相關(guān)性研究
發(fā)布時(shí)間:2021-01-10 17:23
[目的]研究Sp110基因rs1135791、rs722555多態(tài)性與肺結(jié)核易感性的關(guān)系。[方法]采用病例對(duì)照研究,選取重慶地區(qū)100例肺結(jié)核患者和106例健康對(duì)照,運(yùn)用嵌套式等位基因特異性引物PCR技術(shù)檢測(cè)Sp110基因rs1135791C/T位點(diǎn)和rs722555A/G位點(diǎn)基因型,運(yùn)用χ2檢驗(yàn)分析其基因型頻率和等位基因頻率與肺結(jié)核的相關(guān)性。[結(jié)果]病例組rs1135791CT基因型、C等位基因頻率均高于對(duì)照組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P﹤0.05),OR值分別為1.9795和1.6951;病例組rs722555GG基因型、G等位基因頻率均高于對(duì)照組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P﹤0.05),OR值分別為2.0235和1.5874。[結(jié)論]Sp110基因rs1135791、rs722555多態(tài)性可能是重慶地區(qū)漢族人群肺結(jié)核遺傳易感性的危險(xiǎn)因素。
【文章來(lái)源】:現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2008,(03)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:4 頁(yè)
【部分圖文】:
NASP- PCR 引物設(shè)計(jì)原理模式圖
Vol.35, NO.3見表 3, 運(yùn)用 Mastercycler PCR 擴(kuò)增儀 ( 德國(guó) Eppendorf 公司)進(jìn)行PCR 擴(kuò)增分析。信息(GenBank No.AC009950.6.[gi: 13435267] ) , 利用Primer5. 0軟件設(shè)計(jì)符合研究需要的引物 ( 表 1) , 利用嵌套式等位基因特異性引物 PCR 技術(shù) ( Nested allele- specific primer, NASP-PCR) 檢測(cè)其多態(tài)性。所有引物均由上海生物工程技術(shù)有限公司合成。· 417·
2.2.2 rs722555 位點(diǎn)經(jīng) PCR 擴(kuò)增后產(chǎn)生 3 種基因型 純合子AA ( 221 bp 與 558 bp) , 純合子 GG ( 378 bp 與 558 bp) , 雜合子 AG (221 bp、378 bp 與 558 bp) , 見圖 3。2.3 rs1135791、rs722555 位點(diǎn)多態(tài)性與肺結(jié)核發(fā)病相關(guān)性分析2.3.1 Hardy- Weinberg 平衡檢驗(yàn) 對(duì)對(duì)照組的各位點(diǎn)基因型頻率進(jìn)行了平衡檢驗(yàn), 結(jié)果顯示這兩個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)的基因型分布符合 Hardy- Weinberg 平衡 (P﹥0.05) 。2.3.2 基因型與肺結(jié)核發(fā)病相關(guān)性分析 rs1135791 位點(diǎn)的 TT和 CT 基因型在病例組和對(duì)照組的分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=5.49, P = 0.019 2) , 病 例 組 CT 基 因 型 頻 率 高 于 對(duì) 照 組 。rs722555 位點(diǎn)的 AA、AG 和 GG 基因型在病例組和對(duì)照組的分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義 ( χ2= 6.468 9, P = 0.039 4) 。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn), 病例組 GG 基因型頻率高于對(duì)照組, 差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)果見表 4。2.3.3 等位基因頻率與肺結(jié)核發(fā)病相關(guān)性分析 從 rs1135791、rs722555 位點(diǎn)各等位基因在病例組和對(duì)照組的分布來(lái)看, 病例組 rs1135791C 等位基因和 rs722555G 等位基因頻率都高于對(duì)照組
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]漢族人群NOS2 C-1173T、G-954C單核苷酸多態(tài)性及其等位基因頻率與組合分布特征研究[J]. 馬厚勛,謝正祥,牛永紅,李章勇. 重慶醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2005(01)
本文編號(hào):2969108
【文章來(lái)源】:現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2008,(03)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:4 頁(yè)
【部分圖文】:
NASP- PCR 引物設(shè)計(jì)原理模式圖
Vol.35, NO.3見表 3, 運(yùn)用 Mastercycler PCR 擴(kuò)增儀 ( 德國(guó) Eppendorf 公司)進(jìn)行PCR 擴(kuò)增分析。信息(GenBank No.AC009950.6.[gi: 13435267] ) , 利用Primer5. 0軟件設(shè)計(jì)符合研究需要的引物 ( 表 1) , 利用嵌套式等位基因特異性引物 PCR 技術(shù) ( Nested allele- specific primer, NASP-PCR) 檢測(cè)其多態(tài)性。所有引物均由上海生物工程技術(shù)有限公司合成。· 417·
2.2.2 rs722555 位點(diǎn)經(jīng) PCR 擴(kuò)增后產(chǎn)生 3 種基因型 純合子AA ( 221 bp 與 558 bp) , 純合子 GG ( 378 bp 與 558 bp) , 雜合子 AG (221 bp、378 bp 與 558 bp) , 見圖 3。2.3 rs1135791、rs722555 位點(diǎn)多態(tài)性與肺結(jié)核發(fā)病相關(guān)性分析2.3.1 Hardy- Weinberg 平衡檢驗(yàn) 對(duì)對(duì)照組的各位點(diǎn)基因型頻率進(jìn)行了平衡檢驗(yàn), 結(jié)果顯示這兩個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)的基因型分布符合 Hardy- Weinberg 平衡 (P﹥0.05) 。2.3.2 基因型與肺結(jié)核發(fā)病相關(guān)性分析 rs1135791 位點(diǎn)的 TT和 CT 基因型在病例組和對(duì)照組的分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=5.49, P = 0.019 2) , 病 例 組 CT 基 因 型 頻 率 高 于 對(duì) 照 組 。rs722555 位點(diǎn)的 AA、AG 和 GG 基因型在病例組和對(duì)照組的分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義 ( χ2= 6.468 9, P = 0.039 4) 。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn), 病例組 GG 基因型頻率高于對(duì)照組, 差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)果見表 4。2.3.3 等位基因頻率與肺結(jié)核發(fā)病相關(guān)性分析 從 rs1135791、rs722555 位點(diǎn)各等位基因在病例組和對(duì)照組的分布來(lái)看, 病例組 rs1135791C 等位基因和 rs722555G 等位基因頻率都高于對(duì)照組
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]漢族人群NOS2 C-1173T、G-954C單核苷酸多態(tài)性及其等位基因頻率與組合分布特征研究[J]. 馬厚勛,謝正祥,牛永紅,李章勇. 重慶醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2005(01)
本文編號(hào):2969108
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