肺結(jié)核患者外周γδT細(xì)胞Vδ2-CDR3序列特征及其合成多肽結(jié)合抗原肽的篩選和鑒定
發(fā)布時間:2019-05-20 00:47
【摘要】:研究背景:許多研究已證實γδ T細(xì)胞在抗結(jié)核分枝桿菌(Mycobacteriumtuberculosis, Mtb)感染免疫中發(fā)揮重要作用。人γδ T細(xì)胞受體(TCRγδ)主要由Vγ9和Vδ2組成,在健康人外周血γδ T細(xì)胞中約80%為Vγ9δ2T細(xì)胞,已發(fā)現(xiàn)活動性結(jié)核。═B)患者的外周Vγ9δ2T細(xì)胞數(shù)量和對Mtb抗原刺激的增殖活性均有明顯降低。但是這類Vγ9δ2T細(xì)胞亞群在抗原識別以及克隆特征方面在TB患者和健康人之間有何不同,至今了解尚不完全。鑒于TCRγδ的γ或δ鏈V區(qū)的互補決定簇區(qū)3(CDR3)是識別抗原表位的關(guān)鍵位點,而目前對于TCRγδ所識別的Mtb抗原多肽表位也不完全清楚。因此從檢測和分析TB患者γδ T細(xì)胞Vδ-CDR3基因譜型和序列特征,有助于理解γδ T細(xì)胞在抗原識別方面的克隆特征。另外根據(jù)TB患者的優(yōu)勢CDR3片段序列合成的肽片段,從噬菌體多肽展示庫中篩選出Mtb相關(guān)性性的抗原表位。將有助于揭示γδ T細(xì)胞識別Mtb抗原表位的機制,為Mtb感染的診斷和防治提供新的方法。 目的:檢測和分析活動性肺TB患者外周血γδT細(xì)胞受體Vδ2鏈CDR3片段基因譜型和序列特征,應(yīng)用Vδ2-CDR3優(yōu)勢片段序列合成肽在噬菌體多肽展示庫中篩選Mtb抗原相關(guān)的多肽表位,并對合成的Mtb抗原多肽表位的激活人γδ T細(xì)胞活性進行初步鑒定。為闡明TB患者的T細(xì)胞免疫應(yīng)答機制以及免疫診斷和治療研究提供新的科學(xué)依據(jù)。 方法:1.采集肺TB患者(n=27)和健康人(n=25)外周血分離PBMC提取RNA,用RT-PCR方法擴增TCRγδ的Vδ2基因CDR3片段,PCR產(chǎn)物通過基因掃描分析CDR3片段長度的多樣性變化。 2. Vδ2-CDR3的PCR產(chǎn)物純化后連接PMD18-T載體重組質(zhì)粒,轉(zhuǎn)化及陽性篩選后用菌落PCR法對重組陽性質(zhì)粒進行鑒定,并對陽性質(zhì)粒PCR產(chǎn)物進行基因掃描分析確定其CDR3長度; 3.對Vδ2-CDR3的PCR產(chǎn)物基因掃描優(yōu)勢峰對應(yīng)的大部分重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化陽性克隆,以及部分非優(yōu)勢峰對應(yīng)克隆的CDR3基因片段,測定DNA序列,并分析和比較其編碼氨基酸的特征。 4.從TB患者新鮮PBMC和正常人PBMC經(jīng)Mtb耐熱性抗原刺激增殖的T細(xì)胞擴增Vδ2-CDR3的最優(yōu)勢序列,合成多肽片段包被平板,加噬菌體7肽庫溫育后,先洗去未結(jié)合的噬菌體,然后洗脫并收獲特異結(jié)合的噬菌體擴增。經(jīng)3-4輪結(jié)合-淘選-擴增循環(huán),富集特異性結(jié)合噬菌體,并經(jīng)過DNA測序分析和ELISA驗證陽性噬菌體,通過BLAST生物信息學(xué)分析和比對噬菌體展示多肽序列與Mtb抗原的相關(guān)性。 5.從特異性富集噬菌體的多肽序列中尋找到的與Mtb相關(guān)的肽表位序列,合成7肽片段后作為抗原刺激正常人和TB患者的外周血PBMC,用流式細(xì)胞術(shù)檢測γδ T細(xì)胞的增殖活性。 結(jié)果:1對PBMC中TCRγδ的Vδ2-CDR3片段基因掃描結(jié)果顯示:TB患者組(n=27)優(yōu)勢峰占總峰的比率(0.2755±0.0619)較正常人組(n=25)(0.1979±0.0346)高,TB患者組的長度變化范圍為(25.11±5.52)較正常人為(19.87±3.52)高,差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(p0.0和p0.0)。 2TB患者TCRγδ的Vδ2-CDR3的片段數(shù)和最優(yōu)勢峰長度,與正常人比較無顯著變化。 3基因掃描分析顯示CDR3轉(zhuǎn)化陽性菌落PCR峰與CDR3的RT-PCR產(chǎn)物中的掃描峰有很好的對應(yīng)關(guān)系;有意義的是最高頻率菌落(占40%)的CDR3片段長度與PBMC的RT-PCR產(chǎn)物的基因掃描優(yōu)勢峰長度完全相同。 4對CDR3轉(zhuǎn)化的克。73個)的測序結(jié)果表明:TCR Vδ2 CDR3序列均由兩端保守的側(cè)翼序列和中間的多變序列組成;兩端保守的側(cè)翼序列由位于N端的“CACD”和位于C端的“KLIFGKG”組成,多變的中間序列97號位均含有疏水性氨基酸殘基。該其中TB患者優(yōu)勢取用DJ3片段。每位TB患者有自己的優(yōu)勢序列,患者間偶發(fā)現(xiàn)有共有序列。 5從TB患者新鮮PBMC中Vδ2-CDR3的優(yōu)勢序列挑選2個,和從正常人PBMC經(jīng)Mtb耐熱性抗原刺激增殖的T細(xì)胞中Vδ2-CDR3序列挑選2個,合成的4條多肽片段與噬菌體七肽庫經(jīng)4輪淘選后,得到特異性結(jié)合的噬菌體多肽序列47條,選擇其中最富集序列和有交叉序列的9條,經(jīng)GenBank BLAST比對分析,發(fā)現(xiàn)有4條7肽序列與某些Mtb抗原的序列高度重合。 6從4條與Mtb抗原相關(guān)性的噬菌體多肽序列挑選2條合成7肽片段,用于體外培養(yǎng)實驗發(fā)現(xiàn),對某些正常人和TB患者個體的γδ T細(xì)胞有刺激增殖活性。 結(jié)論: 1. TB患者外周血γδ T細(xì)胞中Vδ2CDR3片段優(yōu)勢峰所占總峰比率比正常人的高,表明正常人γδ T細(xì)胞受體呈高斯分布,具有多克隆特點,而TB患者的顯示寡克隆特點,提示TB患者的γδ T細(xì)胞經(jīng)歷了抗原特異性增殖。 2TCRδ2基因CDR3片段中間的多變序列含有疏水性氨基酸殘基,推測其與抗原肽結(jié)合的親和力有關(guān)。TB患者大多優(yōu)勢取用DJ3片段,提示其與Mtb抗原的特異性識別可能有關(guān)。 3.與健康人外周γδ T細(xì)胞經(jīng)Mtb耐熱抗原擴增后的Vδ2CDR3優(yōu)勢片段具有相同序列比較,TB患者的外周新鮮血γδ T細(xì)胞的Vδ2CDR3片段優(yōu)勢峰中序列呈多樣化,提示不同TB患者的γδ T細(xì)胞的不同克隆參與對Mtb抗原的免疫應(yīng)答。 4本研究鑒定了4個TB患者特異性γδT細(xì)胞Vδ2-CDR3序列,經(jīng)噬菌體七肽庫篩選獲得4條Mtb相關(guān)的抗原肽表位,并選擇其中2條合成7肽片段,初步證實對正常人和TB患者的γδ T細(xì)胞有刺激增殖活性。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:蚌埠醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2012
【分類號】:R521
本文編號:2481218
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:蚌埠醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2012
【分類號】:R521
【參考文獻】
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1 陳勇,呂合作,胡建國,李柏青;刺激人γδT細(xì)胞增殖的結(jié)核桿菌多肽抗原的生物學(xué)特性分析[J];細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志;2003年02期
2 陳勇,呂合作,胡建國,候彥強,張海峰,李柏青,何海輝;刺激人γδ~+ T細(xì)胞增殖的結(jié)核桿菌多肽抗原的純化與活性鑒定[J];細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志;2003年01期
3 陳勇,李柏青;人γδT細(xì)胞TCR分子與結(jié)核桿菌多肽抗原特異性結(jié)合的證據(jù)[J];中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志;2005年01期
4 李靜,何維,胡愉;自身免疫病患者外周血γδT細(xì)胞系的功能研究[J];中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志;2000年01期
,本文編號:2481218
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