子宮內(nèi)膜癌預(yù)后相關(guān)差異表達基因篩選及其生物信息學(xué)分析
發(fā)布時間:2025-01-06 00:28
目的篩選子宮內(nèi)膜癌(EC)預(yù)后相關(guān)的差異表達基因(DEGs),并對其進行生物信息學(xué)分析。方法從癌癥基因組圖譜(TCGA)收集臨床病理學(xué)參數(shù)及生存資料完整的EC患者140例,與基因表達綜合(GEO)數(shù)據(jù)庫聯(lián)合篩選DEGs。以各基因表達水平的中位數(shù)作為高低表達的截斷值,通過COX回歸和Kaplan-Meier曲線篩選預(yù)后相關(guān)DEGs,并比較不同臨床病理參數(shù)EC患者預(yù)后相關(guān)DEGs表達水平。使用基因本體論(GO)及基因組百科全書(KEGG)對預(yù)后相關(guān)DEGs進行功能通路富集分析。結(jié)果 TCGA聯(lián)合GEO數(shù)據(jù)庫共篩選出5個DEGs,即ASPA、MYBL2、TROAP、CCNB2和CDC25C(P均<0.05); 5個DEGs中,僅MYBL2基因高低表達EC患者總生存期和無病生存期差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P均<0.05),且組織低分化、Ⅱ型EC患者MYBL2基因高表達比例分別高于高分化、Ⅰ型患者(P均<0.05)。GO功能富集分析結(jié)果顯示,MYBL2基因在生物學(xué)過程層面主要參與細胞代謝、生物調(diào)節(jié)等過程,在細胞組成層面主要參與細胞膜、細胞核、大分子復(fù)合物等的形成,在分子功能層面主要參與...
【文章頁數(shù)】:4 頁
【文章目錄】:
1 資料與方法
1.1 數(shù)據(jù)庫及軟件
1.2 方法
1.2.1 數(shù)據(jù)來源
1.2.2 EC中DEGs的篩選從TCGA數(shù)據(jù)庫中
1.2.3 EC預(yù)后相關(guān)DEGs的篩選
1.2.4 不同臨床病理參數(shù)EC患者預(yù)后相關(guān)DEGs表達分析
1.2.5 EC預(yù)后相關(guān)DEGs的功能與通路富集分析
2 結(jié)果
2.1 EC中DEGs的篩選結(jié)果
2.2 EC預(yù)后相關(guān)DEGs的篩選結(jié)果
2.3 不同臨床病理參數(shù)EC患者MYBL2基因表達水平比較
2.4 MYBL2的GO和KEGG富集分析結(jié)果
3 討論
本文編號:4023506
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1 資料與方法
1.1 數(shù)據(jù)庫及軟件
1.2 方法
1.2.1 數(shù)據(jù)來源
1.2.2 EC中DEGs的篩選從TCGA數(shù)據(jù)庫中
1.2.3 EC預(yù)后相關(guān)DEGs的篩選
1.2.4 不同臨床病理參數(shù)EC患者預(yù)后相關(guān)DEGs表達分析
1.2.5 EC預(yù)后相關(guān)DEGs的功能與通路富集分析
2 結(jié)果
2.1 EC中DEGs的篩選結(jié)果
2.2 EC預(yù)后相關(guān)DEGs的篩選結(jié)果
2.3 不同臨床病理參數(shù)EC患者MYBL2基因表達水平比較
2.4 MYBL2的GO和KEGG富集分析結(jié)果
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