目的:統(tǒng)計(jì)PIK3CA突變?cè)谧訉m內(nèi)膜樣腺癌(EEC)中的發(fā)生情況,研究PIK3CA突變與預(yù)后的關(guān)系,探索PIK3CA突變相關(guān)的分子機(jī)制,嘗試以PIK3CA突變及突變相關(guān)的基因構(gòu)建子宮內(nèi)膜樣腺癌的預(yù)后預(yù)測(cè)模型,用生信方法和實(shí)驗(yàn)方法驗(yàn)證模型的效能,開(kāi)發(fā)模型應(yīng)用于臨床的工具,并且探索模型的分子機(jī)制。內(nèi)容:從TCGA獲取EEC患者相關(guān)信息,將患者分為PIK3CA突變組和野生組,比較兩組患者的總生存(OS)和無(wú)進(jìn)展生存(PFS)。篩選突變相關(guān)的差異表達(dá)基因(DEGs),再用卡普蘭-邁耶(KM)生存分析和最小絕對(duì)值收斂和選擇算子(LASSO)回歸分析篩出預(yù)后相關(guān)的DEGs。將患者隨機(jī)分為訓(xùn)練集和驗(yàn)證集。在訓(xùn)練集中建立COX回歸模型,將患者分為高危組和低危組,對(duì)其進(jìn)行生存分析、繪制時(shí)間受試者工作特征(ROC)曲線并計(jì)算曲線下面積(AUC),再在驗(yàn)證集驗(yàn)證。將風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分模型與其它分子分型工具進(jìn)行比較。對(duì)模型進(jìn)行單因素和多因素cox回歸分析,開(kāi)發(fā)臨床應(yīng)用工具并驗(yàn)證。通過(guò)加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析,探索模型相關(guān)的分子機(jī)制,進(jìn)行免疫細(xì)胞浸潤(rùn)分析,完成模型驗(yàn)證的部分實(shí)驗(yàn)。方法:所有的處理均通過(guò)R語(yǔ)言實(shí)現(xiàn)。數(shù)據(jù)的下載...

【文章頁(yè)數(shù)】：60 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
Abstract
縮略語(yǔ)
前言
    研究現(xiàn)狀、成果
    研究目的、方法
對(duì)象和方法
    1.對(duì)象
    2.方法
        2.1 通過(guò)R語(yǔ)言篩選構(gòu)建預(yù)后模型的基因
        2.2 通過(guò)R語(yǔ)言構(gòu)建、驗(yàn)證預(yù)后模型
        2.3 通過(guò)WGCNA和 GSVA探索模型的分子機(jī)制
        2.4 通過(guò)分子實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證模型
    3 統(tǒng)計(jì)分析
結(jié)果
    1.PIK3CA突變影響EEC患者的預(yù)后
    2.PIK3CA突變影響EEC患者的基因表達(dá)
    3.篩選出6個(gè)影響預(yù)后的DEGs
    4.構(gòu)建和驗(yàn)證預(yù)后預(yù)測(cè)模型
    5.預(yù)后預(yù)測(cè)模型的臨床應(yīng)用及評(píng)價(jià)
    6.預(yù)后預(yù)測(cè)模型與TCGA分子分型方法的比較
    7.預(yù)后預(yù)測(cè)模型的WGCNA分析
    8.預(yù)后預(yù)測(cè)模型的免疫浸潤(rùn)分析
    9.預(yù)后預(yù)測(cè)模型的部分實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證
討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述 PIK3CA突變?cè)谧訉m內(nèi)膜癌中的研究進(jìn)展
    綜述參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷



本文編號(hào)：3789440