宮頸癌是全球女性癌癥死亡的主要原因之一,其發(fā)病率在女性中居第二位。高危型HPV （Human papilloma virus,人乳頭狀瘤病毒）是導(dǎo)致宮頸癌發(fā)生的主要危險(xiǎn)因素。HPV的DNA可以在超過90%的宮頸鱗癌和超過50%的宮頸腺癌中檢測到。HPV是雙鏈環(huán)狀DNA病毒,高危型的HPV編碼的病毒蛋白E6和E7在癌癥發(fā)生發(fā)展的過程起重要作用,影響細(xì)胞周期進(jìn)程和細(xì)胞凋亡的過程。盡管多價(jià)HPV預(yù)防性疫苗早已研發(fā)成功且目前已在中國大陸上市,但對于已經(jīng)感染或免疫力低下的人效果有限。高危型HPV的致病機(jī)制尚未完全闡明,因此深入理解HPV的致病機(jī)制仍然是有效防治宮頸癌及其相關(guān)癌癥的重要前提。為了探索高危型HPV的致病機(jī)制,本研究通過對TCGA （The Cancer Genome Atlas - Cancer Genome）公共數(shù)據(jù)庫中宮頸癌樣本的生物信息學(xué)分析,建立了宮頸癌高表達(dá)基因譜及相關(guān)基因啟動子DNA甲基化狀態(tài)分值表;通過液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜（LC-MS/MS）技術(shù)對E7表達(dá)的細(xì)胞與對照細(xì)胞細(xì)胞核蛋白組進(jìn)行非標(biāo)記定量分析,發(fā)現(xiàn)了E7穩(wěn)定表達(dá)的細(xì)胞與對照細(xì)胞相比差異表達(dá)的蛋白組;并對TCGA數(shù)據(jù)... 

【文章來源】：山東大學(xué)山東省211工程院校985工程院校教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：142 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖１－２．?ＴＣＧＡ數(shù)據(jù)及ＲＮＡ－ｓｅｑ數(shù)據(jù)共有上調(diào)蛋白的互作網(wǎng)絡(luò)及通路分析

?生存率低于ＵＨＲＦ１低表達(dá)組，表明ＵＨＲＦ１高表達(dá)的患者可能預(yù)后不良，提示??ＵＨＲＦ１的促癌作用（圖１－３Ｃ）。??圉??Ｃ??〇??Ｉ?；．??差?：．；??爸?丨丨?；：：?＇??＾?ｉ?ｍ?：，Ｌｔ?／ｊｆ?ｌ?．」」卜！?］）?４?ｉ；〇?ｊ?．?ｉ」／）?｝ｊ?）一」ａ』／：．??ｍ聚游您潑效客％徽您效銳夠效駿微微戮夠效微竣軟微??Ｂ?Ｃ??Ｃａｎｃｅｒ?Ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ???Ｄｉｓｅａｓｅ?Ｆｒｅｅ?Ｓｕｒｖｉｖａｌ???２?＇ｌｙ．?——Ｌｏｗ?ＵＨＲＦ１／ＧＡＰＤＨ?ＴＰＭ??ＴＡ?——Ｈｉｇｈ?ＵＨＲＦ１／ＧＡＰＤＨ?ＴＰＭ??＇ｖ?Ｌｏｇｒａｎｋ?ｐ＝０．５５??ｃ〇?Ｖ｜，｜ｌｉｒｉｎ，ｉ?■，?｜?，?，?．?ＨＲ（ｈｉａｈ）＝ｌ．２??ｕ?°?ｐ（ＨＲ）＝０．５６??ｆ??Ｍ??ｌｌｌＨｌｌｌｌｌｌｌｌｌｌ．．．．??ｇ！……丨??Ｍｏｎｔｈｓ??圖１－３．?ＵＨＲＦ１與宮頸癌的關(guān)聯(lián)分析。（Ａ）?ＵＨＲＦ１在成對腫瘤樣本與正常樣本中的表達(dá)。??每組點(diǎn)代表其在相應(yīng)樣本的表達(dá)量。（Ｂ）?ＵＨＲＦ１與癌癥的相關(guān)性分析，其對于宮頸癌的??影響位居第五。（Ｃ）?ＵＨＲＦ１差異表達(dá)組的生存曲線。ＵＨＲＦ１高表達(dá)組的生存時(shí)間更短。??Ｆｉｇｕｒｅ?１－３．?ＵＨＲＰ１?ａｎｄ?ｃｅｒｖｉｃａ

??圖１－４．?Ｅ７表達(dá)細(xì)胞差異表達(dá)核蛋白的基因本體（Ｇｅｎｅ?Ｏｎｔｏｌｏｇｙ，ＧＯ）和ＫＥＧＧ聚類分析。??（Ａ）差異表達(dá)核蛋白的生物過程富集分析。（Ｂ）差異表達(dá)核蛋白的ＫＥＧＧ細(xì)胞通路富集??分析。??Ｆｉｇｕｒｅ?１－４．?Ｇｅｎｅ?Ｏｎｔｏｌｏｇｙ?ａｎｄ?ＫＥＧＧ?ｐａｔｈｗａｙ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ?ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ?ｎｕｃｌｅａｒ?ｐｒｏｔｅｉｎ??ｉｎ?Ｅ７?ｅｘｐｒｅｓｓｉｎｇ?ｃｅｌｌｓ．?（Ａ）?Ｂｉｏｌｏｇｙ?ｐｒｏｇｒｅｓｓ?ｅｎｒｉｃｈｍｅｎｔ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ??ｎｕｃｌｅａｒ?ｐｒｏｔｅｉｎｓ．?（Ｂ）?ＫＥＧＧ?ｃｅｌｌ?ｐａｔｈｗａｙ?ｅｎｒｉｃｈｍｅｎｔ?ａｎａｌｙｓｉｓ?ｏｆ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｎｕｃｌｅａｒ??ｐｒｏｔｅｉｎｓ．??５．２差異表達(dá)蛋白的相互作用通路分析??通過ＳＴＲＩＮＧ在線數(shù)據(jù)庫分析顯著差異表達(dá)的核蛋白，從而構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)??絡(luò)及所在通路。研究顯示在蛋白互作網(wǎng)絡(luò)中，Ｅ７表達(dá)細(xì)胞上調(diào)的核蛋白集中在??病毒進(jìn)程（如圖１－５?Ａ中紅色圓點(diǎn)所示），ｍＲＮＡ代謝過程（如圖１－５?Ａ中紫色??圓點(diǎn)所示），而其在方向化合物代謝和雜環(huán)代謝通路中也有較高富集。??Ｅ７表達(dá)細(xì)胞下調(diào)的核蛋白集中在細(xì)胞組分和蛋白復(fù)合體亞基通路中（如圖??１－５Ｂ中紫色圓點(diǎn)所示），而其在分子功能方面，多富集于ＲＫＡ綁定、細(xì)胞骨架??蛋白綁定、細(xì)胞組分募集等通路中。??４Ｂ??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Epigenetic disruption of cell signaling in nasopharyngeal carcinoma[J]. Li-Li Li1,2,3,Xing-Sheng Shu2,Zhao-Hui Wang1,2,Ya Cao3,and Qian Tao1,2 1Shenzhen Key Laboratory of Cancer Nanotechnology,Institute of Biomedical and Health Engineering,Shenzhen Institutes of Advanced Technology,Chinese Academy of Sciences-CUHK,Shenzhen,Guangdong 518055,P.R.China;2Cancer Epigenetics Laboratory,Sir YK Pao Center for Cancer,Department of Clinical Oncology,The Chinese University of Hong Kong,Hong Kong and CUHK Shenzhen Research Institute,Shenzhen,Guangdong 518057,P.R.China;3Cancer Research Institute,Xiangya School of Medicine,Central South University,Changsha,Hunan 410078,P.R.China..  癌癥. 2011(04)



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