第一部分生物信息學(xué)方法比較正常及先兆子癇胎盤組織樣本的基因表達(dá)譜血管發(fā)生和廣泛的血管生成對于胎盤發(fā)育至關(guān)重要。先兆子癇（pre-eclampsia,PE）的發(fā)生是胎盤血管異常發(fā)育的結(jié)果之一。在本部分研究中,旨在通過比較正常發(fā)育情況下胎盤的基因表達(dá)譜及PE發(fā)生條件下的胎盤基因表達(dá)譜,從中找到在兩者中具有共性的特征基因。從Gene Expression Omnibus數(shù)據(jù)庫中下載不同孕齡的正常人胎盤（GSE9984）和先兆子癇人胎盤微陣列數(shù)據(jù)（GSE6573）的基因表達(dá)譜。差異表達(dá)基因（differentially expressed genes,DEGs）分析由GE02R進(jìn)行�；蚪M富集分析（gene set enrichment analysis,GSEA）使用GSEA v3.0軟件進(jìn)行。TargetScanHuman數(shù)據(jù)庫、miRTarBase數(shù)據(jù)庫及mirRDB數(shù)據(jù)庫用于分析可靠的miR-203作用靶基因。MiR-203與靶標(biāo)基因的互作網(wǎng)絡(luò)可視化由Cytoscape構(gòu)建。比較兩組基因表達(dá)譜后得到共同基因10個,包括LNPEP、AKNA、SLC9A7、VEGFA、FUT9、STRBP... 

【文章來源】：武漢大學(xué)湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：79 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１．１?Ａ．．?ＧＳＥ６５７３和ＧＳＥ９９８４數(shù)據(jù)集價(jià)值分布的箱形圖；Ｂ：?ＧＳＥ６５７３和ＧＳＥ９９８４中ＤＥＧｓ６令重??疊元素；Ｃ：?ＧＳＥ６５７３和ＧＳＥ９９８４共同ＤＥＧｓ的熱圖??

１１１沁１＇〇１＾八５祀向數(shù)據(jù)庫�。睬桑１８〇＆１１１�?郟保保保保蓿保薄ⅲ保保必?保倍。Τ觶常擔(dān)都埃保保必?海�？１�?保常?鈧輾直鷦げ猓崳?出ｍｉＲ－２０３的｜Ｅ標(biāo)基因?yàn)椋梗担�，３１�?及７１１?個（表１．１）。運(yùn)用Ｄｒａｗ?Ｖｅｎｎ?Ｄｉａｇｒａｍ分別??對ＴａｒｇｅｔＳｃａｎＨｕｍａｎ、ｍｉＲＴａｒＢａｓｅ及ｍｉｒＲＤＢ中的兀素進(jìn)行比較，篩選三個數(shù)據(jù)??庫均有重疊的特殊基因其３８個（圖１．２Ａ＆表１．２）。最后在Ｃｙｔｏｓｃａｐｅ中構(gòu)建ｍｉＲ－２０３??與３８個重疊靶向基因的互作圖（圖１．２Ｂ）。??表１．１通過ＴａｒｇｅｔＳｃａｎＨｕｍａｎ、ｍｉＲＴａｒＢａｓｅ和ｍｉｒＲＤＢ數(shù)據(jù)庫預(yù)測ｍｉＲ－２０３的把向基因??名稱?基因數(shù)目?可識別基因數(shù)目??Ｔａｒｇｅｔｓ?ｃａｎＨｕｍ?ａｎ?９５４?９５３??ｍｉＲＴａｒＢａｓｅ?３１１?３１１??ｍｉｒＲＤＢ?７１１?７１１??總計(jì)基因數(shù)?１５８７???表１．２數(shù)據(jù)庫預(yù)測ｍｉＲ－２０３的靶向基因的重疊基因???名稱?總數(shù)?重疊基因名稱??ＮＵＦＩＰ２?ＲＡＰ１Ａ?ＺＥＢ１?ＺＮＦ１４８?Ｓ０ＣＳ６?ＬＣＯＲ?ＩＬ２４?ＤＵＳＰ５??ＴａｒｇｅｔＳｃａｎＨｕｍａｎ?ＫＩＦ２ＡＮＦＹＡＲＡＰＧＥＦ１?ＡＢＣＥ１?ＳＬＣ３９Ａ９?ＢＣＬ７ＡＡＴ?

?ＭｉＲ－２０３通過抑制ＶＥＧＦＡ介導(dǎo)胎盤發(fā)育的機(jī)制研究???ＨＡＬＬＭＡＲＫ＿ＰＩ３Ｋ＿ＡＫＴ＿ＭＴ０Ｒ＿ＳＩＧＮＡＬＩＮＧ?９８?－０．２１７０９??ＨＡＬＬＭＡＲＫ＿ＵＶ＿ＲＥＳＰＯＮＳＥ＿ＵＰ?１５０?－０．２６６３３??ＨＡＬＬＭＡＲＫ＿ＥＰＩＴＨＥＬＩＡＬ＿ＭＥＳＥＮＣＨＹＭＡＬ＿ＴＲＡＮＳＩＴＩＯＮ?１９２?－０．３７６９１??ＨＡＬＬＭＡＲＫ＿ＡＰＯＰＴＯＳＩＳ?１５９?－０．２９７９３??ＨＡＬＬＭＡＲＫ＿ＮＯＴＣＨ＿ＳＩＧＮＡＬＩＮＧ?２９?－０．２６０７５???ＨＡＬＬＭＡＲＫ＿ＡＬＬＱＧＲＡＦＴ＿ＲＥＪＥＣＴＩＯＮ?１９１?－０．３４６１??ＥＳ：?ｅｎｒｉｃｈｍｅｎｔ?ｓｃｏｒｅｓ．??Ａ?Ｂ??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]胎盤發(fā)育過程中的表觀遺傳學(xué)改變及其相關(guān)疾病[J]. 劉福林,周瑾,張蔚,汪暉.  遺傳. 2017(04)
[2]孕中期血絨毛膜促性腺激素水平異常改變與不良妊娠結(jié)局的關(guān)系[J]. 劉國成,謝文娟,張秀蘭,俞秀美,姚煥春.  中華圍產(chǎn)醫(yī)學(xué)雜志. 2002(01)



本文編號：3536233