宮頸癌遺傳基因變異與放療敏感性及預(yù)后的研究
發(fā)布時間:2021-03-28 15:41
宮頸癌在全球女性惡性腫瘤中的發(fā)病率排名第四,是女性癌癥相關(guān)死亡的第二大主要原因。盡管近年來,各國逐漸完善了宮頸癌癌前病變系統(tǒng)性的篩查以及人們進行HPV疫苗的接種,但往往診斷時大多數(shù)已是中晚期。同步放化療是局部晚期宮頸癌的標(biāo)準(zhǔn)治療方案,部分宮頸癌患者表現(xiàn)出對輻射的抵抗,從而導(dǎo)致不良的預(yù)后,因此,如何提高宮頸癌放療療效,降低宮頸癌細胞放射抵抗性成為了如今研究的關(guān)鍵切入點。本研究將通過全外顯子組測序?qū)m頸癌放療敏感及預(yù)后相關(guān)基因進行分析研究。研究方法:(1)測序分析:篩選并收集2014年至2016年在四川省腫瘤醫(yī)院進行根治性放化療的宮頸鱗癌病例信息,經(jīng)過根治性放化療后3年內(nèi)未復(fù)發(fā)的病例歸為未復(fù)發(fā)組,即放射敏感組,反之,根治性放化療后3年內(nèi)局部復(fù)發(fā)的病例歸為復(fù)發(fā)組,即非放射敏感組。然后通過其年齡,分期以及治療前腫瘤大小進行一對一匹配。從中挑選匹配后的32例病例進行全外顯子測序,根據(jù)測序結(jié)果對其進行一系列生物信息學(xué)分析及與預(yù)后相關(guān)聯(lián)的分析,篩選與放射敏感性及預(yù)后相關(guān)的變異基因。(2)驗證分析:根據(jù)測序及分析所得的結(jié)果利用獨立樣本對測序的結(jié)果進行驗證分析。通過免疫組化分析,Sanger測序分析以及...
【文章來源】:電子科技大學(xué)四川省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
組織DNASNV與十大信號通路關(guān)聯(lián)統(tǒng)計圖
電子科技大學(xué)碩士學(xué)位論文16圖2-332例組織DNA中TRIM64基因突變結(jié)果示意圖圖2-4組織DNA中組間SNV差異基因結(jié)果2.3.3基因拷貝數(shù)變異結(jié)果(CNV)為了清楚顯示每個樣品中差異基因的表達,使用R-pheat圖對復(fù)發(fā)組和未復(fù)發(fā)組DNA中差異基因進行了聚類分析,結(jié)果顯示GOLGA6C、HRNR、MMP27、BIR3、YAP1及KCNK17等58個基因在復(fù)發(fā)組和未復(fù)發(fā)組間有顯著差異(秩和檢驗,p<0.05)(見圖2-5)。其中,MMP27、DPCR1、YAP1及BIRC3基因均在復(fù)發(fā)組發(fā)生拷貝數(shù)增加,且與未復(fù)發(fā)組有顯著差異(Fisher檢驗,p<0.05)(見圖2-6和圖2-7)。圖2-5差異基因表達熱圖
電子科技大學(xué)碩士學(xué)位論文16圖2-332例組織DNA中TRIM64基因突變結(jié)果示意圖圖2-4組織DNA中組間SNV差異基因結(jié)果2.3.3基因拷貝數(shù)變異結(jié)果(CNV)為了清楚顯示每個樣品中差異基因的表達,使用R-pheat圖對復(fù)發(fā)組和未復(fù)發(fā)組DNA中差異基因進行了聚類分析,結(jié)果顯示GOLGA6C、HRNR、MMP27、BIR3、YAP1及KCNK17等58個基因在復(fù)發(fā)組和未復(fù)發(fā)組間有顯著差異(秩和檢驗,p<0.05)(見圖2-5)。其中,MMP27、DPCR1、YAP1及BIRC3基因均在復(fù)發(fā)組發(fā)生拷貝數(shù)增加,且與未復(fù)發(fā)組有顯著差異(Fisher檢驗,p<0.05)(見圖2-6和圖2-7)。圖2-5差異基因表達熱圖
本文編號:3105816
【文章來源】:電子科技大學(xué)四川省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
組織DNASNV與十大信號通路關(guān)聯(lián)統(tǒng)計圖
電子科技大學(xué)碩士學(xué)位論文16圖2-332例組織DNA中TRIM64基因突變結(jié)果示意圖圖2-4組織DNA中組間SNV差異基因結(jié)果2.3.3基因拷貝數(shù)變異結(jié)果(CNV)為了清楚顯示每個樣品中差異基因的表達,使用R-pheat圖對復(fù)發(fā)組和未復(fù)發(fā)組DNA中差異基因進行了聚類分析,結(jié)果顯示GOLGA6C、HRNR、MMP27、BIR3、YAP1及KCNK17等58個基因在復(fù)發(fā)組和未復(fù)發(fā)組間有顯著差異(秩和檢驗,p<0.05)(見圖2-5)。其中,MMP27、DPCR1、YAP1及BIRC3基因均在復(fù)發(fā)組發(fā)生拷貝數(shù)增加,且與未復(fù)發(fā)組有顯著差異(Fisher檢驗,p<0.05)(見圖2-6和圖2-7)。圖2-5差異基因表達熱圖
電子科技大學(xué)碩士學(xué)位論文16圖2-332例組織DNA中TRIM64基因突變結(jié)果示意圖圖2-4組織DNA中組間SNV差異基因結(jié)果2.3.3基因拷貝數(shù)變異結(jié)果(CNV)為了清楚顯示每個樣品中差異基因的表達,使用R-pheat圖對復(fù)發(fā)組和未復(fù)發(fā)組DNA中差異基因進行了聚類分析,結(jié)果顯示GOLGA6C、HRNR、MMP27、BIR3、YAP1及KCNK17等58個基因在復(fù)發(fā)組和未復(fù)發(fā)組間有顯著差異(秩和檢驗,p<0.05)(見圖2-5)。其中,MMP27、DPCR1、YAP1及BIRC3基因均在復(fù)發(fā)組發(fā)生拷貝數(shù)增加,且與未復(fù)發(fā)組有顯著差異(Fisher檢驗,p<0.05)(見圖2-6和圖2-7)。圖2-5差異基因表達熱圖
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