【摘要】：背景及目的我國癌癥統(tǒng)計數(shù)據(jù)表明,近年來國內卵巢癌的發(fā)病和死亡均居女性惡性腫瘤前十位。卵巢癌的死亡率逐年增高,這與其在早期臨床癥狀不明顯有關。目前關于卵巢癌的研究重點是如何早期發(fā)現(xiàn)和診斷,而生物標志物是預測疾病風險和進展的關鍵一環(huán),可以提高卵巢癌的診斷精度,利于早期診斷。故而本文首先通過基因芯片研究篩選到了與卵巢癌有相關性的關鍵基因羥酰-CoA脫氫酶HADH和非受體酪氨酸激酶SRC,然后通過組織學實驗檢測這兩個基因在卵巢癌患者腫瘤組織和相應正常組織之間的差異,分析其表達含量和卵巢癌預后之間的關系,探討其作為卵巢癌預后和治療的分子標志物的可能。方法利用生物信息學方法確定差異基因。從GEO(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)數(shù)據(jù)庫下載并整理卵巢癌基因芯片數(shù)據(jù)。通過對差異表達基因進行數(shù)據(jù)分析,獲得差異基因。進行基因本體論(Gene Ontology)分析和信號通路分析(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)。最后利用Cytoscape對所有差異基因的編碼蛋白構建蛋白相互作用網(wǎng)絡(PPI)。收集2013年6月至2015年6月青州市人民醫(yī)院婦科72例卵巢癌患者的腫瘤組織和相對應的正常組織(距腫瘤邊緣=5cm)。使用Real-time PCR法檢測卵巢癌患者腫瘤組織與對應正常組織中HADH和SRC的表達含量,結合患者的臨床信息,以SPSS19.0分析它們表達含量與卵巢癌患者臨床病理特征之間的關系。使用ROC曲線法,評價HADH和SRC的診斷價值,明確其針對卵巢癌患者的診斷臨界點,并探討用ROC曲線法確定可疑值范圍。通過隨訪(截止時間為2017.12.31),分析HADH和SRC表達水平與患者生存預后之間的關系。結果經(jīng)過篩選與整理,將卵巢癌基因芯片GSE105437數(shù)據(jù)納入研究。篩選差異基因的限定條件為:p≤0.05,logFC≥2。卵巢癌基因芯片中共篩選出差異基因196個,其中上調基因149個,下調基因47個。生物信息學分析在這些差異基因中進行。對所有差異基因進行基因本體論富集分析,結果顯示差異基因富集B細胞增殖調節(jié)、細胞生長因子調節(jié)、化學致癌作用等因素與卵巢癌的發(fā)病相關。對這些差異基因功能的關系構建網(wǎng)絡。用Cytoscape分析差異基因蛋白之間的作用網(wǎng)絡,得分前五位的基因有ALDH6A1、HADH、FYN、SRC和TNF,這些基因是可能與卵巢癌高度相關的關鍵基因。HADH和SRC分別在卵巢癌腫瘤組織中的表達明顯高于相應的正常組織,其表達量的差異性具有統(tǒng)計學意義(P0.01)。HADH和SRC均與患者的年齡、腫瘤大小、病理類型無明顯關系(P0.05),而與患者淋巴結轉移情況和TNM分期等有相關性(P0.05)。PFS曲線分析顯示:與相應的低表達組相比,HADH和SRC高表達組的3年無進展生存率明顯下降,具有統(tǒng)計學意義(P0.05)。HADH和SRC的ROC曲線下面積分別為0.753和0.841,并有統(tǒng)計學意義(P0.05),說明這兩個基因可能有較高的診斷價值。結論HADH和SRC在卵巢癌腫瘤組織中的表達高于相應正常組織;HADH和SRC高表達的卵巢癌往往分期晚,且預后不良;HADH和SRC與卵巢癌的發(fā)生發(fā)展存在相關性,有可能成為卵巢癌早期診斷和治療的分子標志物。
【圖文】：

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在GEO數(shù)據(jù)庫下載卵巢癌芯片
【學位授予單位】：青島大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2018
【分類號】：R737.31

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本文編號：2591335