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基因芯片篩選新疆維吾爾婦女宮頸癌差異表達基因

發(fā)布時間:2018-07-12 21:37

  本文選題:基因芯片 + 宮頸癌。 參考:《中國生物化學與分子生物學報》2015年06期


【摘要】:新疆南部維吾爾族聚居區(qū)是宮頸癌高發(fā)區(qū).本文旨在利用基因芯片技術篩選與維吾爾族婦女宮頸癌發(fā)生相關的基因.首先,分別提取5例新疆維吾爾婦女宮頸癌和5例子宮肌瘤組織(對照)的m RNA,逆轉錄成c DNA,并用Cy3-d UTP標記子宮肌瘤組織的cDNA,用Cy5-d UTP標記宮頸癌組織的c DNA,制成芯片雜交探針.為篩選出宮頸癌組織中差異表達的基因,上述標記探針分別與含有20 000條人類基因的Affymetrix基因芯片進行雜交,雜交信號用Gene Chip Scanner 3000掃描儀掃描,并用芯片圖像分析軟件(SAM software)分析掃描結果.篩選出的差異表達基因經GO(Gene Ontology)分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)信號通路分析,確定其在宮頸癌中的作用.基因芯片篩選結果顯示,在宮頸癌組織中發(fā)現(xiàn)2 758個差異表達基因,其中1 326個上調基因,1 432個下調基因.GO分析和KEGG信號通路分析表明,表達差異在兩倍以上的基因涉及168個信號通路,包括細胞粘附分子、細胞周期以及MAPK和mTOR信號通路等.上述結果表明,基因芯片技術篩選出大量與宮頸癌發(fā)生相關的基因,其中表達差異顯著的基因涉及細胞粘附分子、細胞周期和m TOR等信號通路.
[Abstract]:The Uygur area in southern Xinjiang has a high incidence of cervical cancer. The purpose of this study was to screen the genes associated with cervical cancer in Uygur women by gene chip technique. Firstly, the mRNAs of 5 cases of cervical cancer in Xinjiang Uygur women and 5 cases of uterine leiomyoma tissue (control group) were extracted, and then the cDNA of uterine leiomyoma tissue was labeled with Cy3-d UTP. The cDNA of cervical cancer tissue was labeled with Cy5-d UTP, and the microarray hybridization probe was made. In order to screen differentially expressed genes in cervical cancer tissues, the above labeled probes were hybridized with Affymetrix gene chip containing 20 000 human genes. The hybridization signals were scanned by Gene Chip Scanner 3000 scanner. The scan results were analyzed by chip image analysis software (Sam software). The differentially expressed genes were analyzed by go (Gene Ontology) and KEGG (Kyoto Encyclopedia of genes and genomes) to determine their role in cervical cancer. The results of gene chip screening showed that 2 758 differentially expressed genes were found in cervical cancer tissues, among which 1 326 up-regulated genes were identified by .go analysis and KEGG signal pathway analysis. The differentially expressed genes involved 168 signaling pathways, including cell adhesion molecules, cell cycle, MAPK and mTOR signaling pathways. These results suggest that a large number of genes related to cervical carcinogenesis were screened by gene chip technique, among which the differentially expressed genes were involved in cell adhesion molecules, cell cycle and m TOR signaling pathways.
【作者單位】: 新疆大學生命科學與技術學院;新疆維吾爾自治區(qū)腫瘤醫(yī)院;新疆維吾爾自治區(qū)人民醫(yī)院;
【基金】:國家自然科學基金(No.31060025) 新疆生物資源基因工程重點實驗室開放課題(No.XJDX0201-2013-01)~~
【分類號】:R737.33

【共引文獻】

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【二級參考文獻】

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本文編號:2118533

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