用基因芯片技術(shù)篩選人子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞株中紫杉醇耐藥相關(guān)基因
本文選題:基因芯片技術(shù) + 子宮腫瘤。 參考:《山東醫(yī)藥》2015年19期
【摘要】:目的應(yīng)用基因芯片技術(shù)篩選人子宮內(nèi)膜癌細(xì)胞株中獲得性紫杉醇(TAX)耐藥相關(guān)基因。方法采用大劑量間歇誘導(dǎo)法,用TAX反復(fù)沖擊誘導(dǎo)培養(yǎng)人子宮內(nèi)膜癌Ishikawa細(xì)胞株,建成Ishikawa/TAX耐藥株。應(yīng)用Affymetrix Human Genome U133 Plus2.0表達(dá)譜芯片檢測(cè)Ishikawa/TAX與Ishikawa細(xì)胞株基因。通過(guò)Gene Ontology(GO)聚類(lèi)分析對(duì)差異表達(dá)的基因予以分類(lèi)。采用qRT-PCR對(duì)部分差異表達(dá)的基因進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果與Ishikawa細(xì)胞相比,Ishikawa/TAX細(xì)胞中有110條基因表達(dá)有顯著性差異(ratio比值3),包括87個(gè)上調(diào)基因、23個(gè)下調(diào)基因,GO分類(lèi)涉及細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)和調(diào)控、細(xì)胞黏附分子、細(xì)胞代謝及轉(zhuǎn)錄調(diào)控等;其中上調(diào)最明顯的基因?yàn)镾100A12,其次有CYP1B1、FUBP1、CEACAM6,下調(diào)基因有TNFAIP3、CD44、DKK1等。qRT-PCR檢測(cè)S100A12、CYP1B1在耐藥細(xì)胞中高表達(dá),TNFAIP3、CD44在耐藥細(xì)胞中低表達(dá),與基因芯片結(jié)果一致。結(jié)論采用基因芯片技術(shù)篩選出的人子宮內(nèi)膜癌獲得性TAX耐藥相關(guān)基因的上調(diào)基因有S100A12、CYP1B1、FUBP1、CEACAM6,下調(diào)基因有TNFAIP3、CD44、DKK1。
[Abstract]:Objective to screen acquired paclitaxel (TAX) resistance related genes in human endometrial cancer cell lines by gene chip technique. Methods Human endometrial carcinoma Ishikawa cell line was induced by high dose intermittent induction and repeated shock of TAX. Ishikawa/TAX resistant strain was established. Ishikawa/TAX and Ishikawa cell lines were detected by Affymetrix Human Genome U133 Plus2.0 expression microarray. The differentially expressed genes were classified by Gene ontology cluster analysis. Some differentially expressed genes were verified by qRT-PCR. Results the expression of 110 genes in Ishikawa / tat cells was significantly different from that in Ishikawa cells, including 87 up-regulated genes and 23 down-regulated genes involved in cell signal transduction and regulation, cell adhesion molecules, cell metabolism and transcriptional regulation. The most obvious up-regulated gene was S100A12, followed by CYP1B1FUBP1CEACAM6, and down-regulated gene was TNFAIP3pCD4DKK1. QRT-PCR was used to detect the high expression of S100A12CYP1B1 in resistant cells, which was consistent with the results of gene chip. Conclusion the up-regulated genes associated with acquired TAX resistance in human endometrial carcinoma screened by gene chip technique are S100A12CYP CYP1B1 FUBP1 CEACAM6, and down-regulated genes are TNFAIP3CD4DK1.
【作者單位】: 首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京世紀(jì)壇醫(yī)院;
【分類(lèi)號(hào)】:R737.33
【共引文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):1951748
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