本文選題：目標(biāo)區(qū)域捕獲測序 + 單體型��； 參考：《實用婦產(chǎn)科雜志》2017年09期

【摘要】：目的:探索無創(chuàng)產(chǎn)前檢測(NIPT)脊髓性肌肉萎縮癥(SMA)在臨床應(yīng)用的可行性。方法:招募生育過SMA先證者且再次妊娠的24個家系,其家系中夫妻雙方及先證者致病突變經(jīng)多重連接探針擴(kuò)增技術(shù)(MLPA)測定。采集家系外周血及孕11周以后的孕婦血漿,通過目標(biāo)序列捕獲及高通量測序技術(shù),首先對夫妻雙方及先證者外周血DNA樣品進(jìn)行目標(biāo)區(qū)域捕獲測序,獲得與致病位點連鎖的親本單體型信息,再結(jié)合血漿測序數(shù)據(jù)中提供的單核苷酸多態(tài)性位點的分析結(jié)果,構(gòu)建隱馬爾可夫模型,推斷胎兒單體型,從而得到胎兒的基因型。同時利用有創(chuàng)產(chǎn)前診斷MLPA檢測驗證其準(zhǔn)確性。本次研究主要針對SMN1基因第7、8號外顯子的檢測。結(jié)果:24個家系通過NIPT檢測檢出患胎5例,攜帶者7例,余12例正常;MLPA檢測結(jié)果為5例患胎,8例攜帶者,11例正常。患胎均為SMN1基因第7、8號外顯子純合缺失。NIPT與MLPA檢測結(jié)果一致率為95.83%(23/24),兩種方法診斷結(jié)果差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.317)。結(jié)論:基于母體血漿目標(biāo)區(qū)域捕獲測序、單體型分析NIPT胎兒SMA風(fēng)險的方法準(zhǔn)確、安全,應(yīng)用于有先證者遺傳信息的SMA NIPT有一定可行性。
[Abstract]:Objective: to explore the feasibility of non-invasive prenatal examination (NIPT) in spinal muscular dystrophy (Spinal muscular dystrophy).Methods: a total of 24 families with SMA probands were recruited for further pregnancy. The pathogenic mutations of both husband and wife and proband were detected by multiplex probe amplification technique.The peripheral blood and maternal plasma after 11 weeks of gestation were collected. The target region of DNA samples from both husband and wife and proband were sequenced by target sequence capture and high-throughput sequencing technique.The haplotype information linked to the pathogenic loci was obtained. Combining with the analysis results of the single nucleotide polymorphism sites provided by plasma sequencing data, a hidden Markov model was constructed to infer the fetal haplotypes, and the fetal genotypes were obtained.At the same time, the accuracy of MLPA was verified by invasive prenatal diagnosis.This study focused on the detection of exons 7 and 8 of SMN1 gene.Results: 5 cases of infected fetus and 7 cases of carrier were detected by NIPT in 24 families.The rate of homozygous deletion of exon 7 and exon 8 of SMN1 gene. NIPT was consistent with that of MLPA was 95.833 / 24. There was no significant difference in diagnostic results between the two methods.Conclusion: based on maternal plasma target region capture and sequencing, haplotype analysis of fetal SMA risk in NIPT is accurate and safe. It is feasible to apply it to SMA NIPT with proband genetic information.
【作者單位】： 廣州醫(yī)科大學(xué)附屬第三醫(yī)院廣州婦產(chǎn)科研究所;深圳華大基因研究院;天津華大基因研究院翻譯組學(xué)中心;廣州華大基因研究院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(編號:81671470) 廣東省科技計劃項目(編號:2013B022000005) 廣東省自然科學(xué)基金(編號:2016A030313610)
【分類號】：R714.5

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本文編號：1750589