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遺傳性肥胖兒童營(yíng)養(yǎng)干預(yù)后腸道內(nèi)優(yōu)勢(shì)菌的分離鑒定及生理功能的探究

發(fā)布時(shí)間:2017-07-18 20:09

  本文關(guān)鍵詞:遺傳性肥胖兒童營(yíng)養(yǎng)干預(yù)后腸道內(nèi)優(yōu)勢(shì)菌的分離鑒定及生理功能的探究


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【摘要】:人和動(dòng)物的腸道內(nèi)棲息著數(shù)量龐大且種類豐富的微生物。腸道菌群通過(guò)代謝、營(yíng)養(yǎng)、免疫等作用影響宿主健康。以乳桿菌和雙歧桿菌為代表的益生菌對(duì)人體具有多種重要的生理功能。失衡的腸道菌群對(duì)膳食誘導(dǎo)的肥胖的重要作用已得到證實(shí)。而腸道菌群在人類遺傳性肥胖中的作用還有待研究。小胖威利癥(Prader-Willi syndrome,PWS)由父源15號(hào)染色體的缺失、突變或基因印記導(dǎo)致,是最常見(jiàn)的基因缺陷導(dǎo)致的肥胖;颊咴趦和瘯r(shí)期表現(xiàn)出暴食癥并發(fā)展為重度肥胖。本研究中的PWS肥胖兒童接受了為期105天的富含碳水化合物和復(fù)合益生元的營(yíng)養(yǎng)干預(yù)后,體重顯著降低,糖、脂代謝相關(guān)的指標(biāo)顯著改善。其腸道內(nèi)的乳桿菌和雙歧桿菌顯著增加并成為優(yōu)勢(shì)菌。本研究首先采用MRS瓊脂選擇性培養(yǎng)基從該P(yáng)WS肥胖兒童營(yíng)養(yǎng)干預(yù)后的糞便樣品中進(jìn)行乳桿菌和雙歧桿菌的分離。使用變性梯度凝膠電泳技術(shù)、ERIC-PCR指紋圖譜技術(shù)、16S rRNA基因測(cè)序技術(shù)等分子生物學(xué)方法對(duì)分離物進(jìn)行分型和鑒定。94個(gè)分離物屬于乳桿菌,74個(gè)分離物屬于雙歧桿菌。其中88株粘膜乳桿菌分為4種ERIC類型;3株卷曲乳桿菌僅一種ERIC類型;3株格氏乳桿菌僅一種ERIC類型。73株假小鏈雙歧桿菌分為5種eric類型;1株長(zhǎng)雙歧桿菌為1種eric類型。為了進(jìn)一步研究pws兒童營(yíng)養(yǎng)干預(yù)后腸道內(nèi)優(yōu)勢(shì)菌的生理功能,測(cè)定了分離株的短鏈脂肪酸產(chǎn)生能力、發(fā)酵液的抑菌能力和降解利用碳水化合物的能力,究發(fā)現(xiàn),所有分離株都只產(chǎn)乙酸,不產(chǎn)其他揮發(fā)性脂肪酸。而分離株的發(fā)酵液對(duì)pws兒童營(yíng)養(yǎng)干預(yù)前腸道內(nèi)的大腸桿菌分離株、標(biāo)準(zhǔn)菌株escherichiacolimg1655和enterobactercloacaeb29無(wú)明顯的抑菌作用。研究菌株降解利用復(fù)雜碳水化合物的能力發(fā)現(xiàn),分離株bifidobacteriumpseudocatenulatumc95對(duì)低聚果糖和中長(zhǎng)鏈菊粉的利用能力優(yōu)于bacteroidesthetaiotaomicronatcc29148和eschrichiacolid45;對(duì)formulano.3(兒童膳食干預(yù)成份之一)的利用能力優(yōu)于bacteroidesthetaiotaomicronatcc29148、anaerostipeshadrusbpb5和eschrichiacolid45。綜上所述,本研究成功分離得到了一名pws兒童營(yíng)養(yǎng)干預(yù)后腸道內(nèi)的優(yōu)勢(shì)細(xì)菌——乳桿菌和雙歧桿菌。發(fā)現(xiàn)腸道中同一類型的細(xì)菌具有豐富的菌株多樣性。與腸道中其他常見(jiàn)共生菌的代表菌株相比,分離株bifidobacteriumpseudocatenulatumc95具有更強(qiáng)的碳水化合物利用能力。該菌株的全基因組信息在cog和kegg兩大數(shù)據(jù)庫(kù)中的基因注釋結(jié)果顯示,菌株自身具有豐富的代謝碳水化合物的相關(guān)基因。雙歧桿菌分離株降解利用碳水化合物的能力,或許能夠一定程度地解釋該名兒童營(yíng)養(yǎng)干預(yù)后腸道內(nèi)雙歧桿菌顯著增加并成為優(yōu)勢(shì)菌的這一現(xiàn)象。雙歧桿菌bifidobacteriumpseudocatenulatumc95是以志愿者健康效應(yīng)為指導(dǎo)分離得到的關(guān)鍵菌,具有成為益生菌的極大潛力。
【關(guān)鍵詞】:遺傳性肥胖 腸道菌群 乳酸菌 短鏈脂肪酸 復(fù)雜碳水化合物 全基因組測(cè)序
【學(xué)位授予單位】:上海交通大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R723.14
【目錄】:
  • 摘要3-6
  • ABSTRACT6-12
  • 第一章 前言12-31
  • 1.1 腸道菌群背景介紹12-18
  • 1.1.1 腸道菌群的組成12
  • 1.1.2 腸道菌群的功能12-14
  • 1.1.3 腸道菌群與單純性肥胖及相關(guān)代謝綜合征的關(guān)系14-16
  • 1.1.4 腸道菌群與遺傳性肥胖的關(guān)系16-17
  • 1.1.5 腸道菌群中的關(guān)鍵細(xì)菌的作用17-18
  • 1.2 乳桿菌和雙歧桿菌的背景介紹18-20
  • 1.2.1 乳桿菌18
  • 1.2.2 雙歧桿菌18-19
  • 1.2.3 雙歧桿菌發(fā)酵利用碳水化合物的能力19-20
  • 1.3 研究腸道菌群的相關(guān)技術(shù)20-21
  • 1.3.1 變性梯度凝膠電泳指紋圖譜技術(shù)20
  • 1.3.2 ERIC-PCR指紋圖譜技術(shù)20-21
  • 1.3.3 16S rRNA基因測(cè)序技術(shù)21
  • 1.3.4 腸道內(nèi)乳桿菌和雙歧桿菌的分離技術(shù)21
  • 1.4 本論文的研究背景介紹21-24
  • 參考文獻(xiàn)24-31
  • 第二章 遺傳性肥胖兒童營(yíng)養(yǎng)干預(yù)后腸道內(nèi)優(yōu)勢(shì)菌的分離和鑒定31-47
  • 引言31
  • 2.1 材料和方法31-34
  • 2.1.1 PWS兒童營(yíng)養(yǎng)干預(yù)105天的糞便樣品中優(yōu)勢(shì)菌的分離31-32
  • 2.1.2 單菌分離物DNA的提取32
  • 2.1.3 單菌分離物16S rRNA基因V3區(qū)PCR擴(kuò)增和DGGE分析32-33
  • 2.1.4 單菌分離物ERIC-PCR指紋圖譜分析33
  • 2.1.5 單菌分離物16S rRNA基因序列的測(cè)定和序列分析33-34
  • 2.2 結(jié)果34-41
  • 2.2.1 PWS兒童營(yíng)養(yǎng)干預(yù)105天糞便樣品中優(yōu)勢(shì)菌的分離結(jié)果34
  • 2.2.2 單菌分離物與原始糞便樣品 16S rRNA V3區(qū)PCR-DGGE圖譜比對(duì)結(jié)果34-36
  • 2.2.3 單菌分離物ERIR-PCR指紋圖譜分型結(jié)果36-37
  • 2.2.4 單菌分離物16S rRNA基因序列的分析結(jié)果37-40
  • 2.2.5 乳桿菌分離物16S rRNA基因V3區(qū)PCR-DGGE圖譜多條帶現(xiàn)象的探究40-41
  • 2.3 討論41-43
  • 本章小結(jié)43-44
  • 參考文獻(xiàn)44-47
  • 第三章 遺傳性肥胖兒童營(yíng)養(yǎng)干預(yù)后腸道內(nèi)優(yōu)勢(shì)菌生理功能的探究47-73
  • 引言47
  • 3.1 材料和方法47-50
  • 3.1.1 PWS兒童營(yíng)養(yǎng)干預(yù)后腸道內(nèi)優(yōu)勢(shì)菌生長(zhǎng)曲線的測(cè)定47-48
  • 3.1.2 PWS兒童營(yíng)養(yǎng)干預(yù)后腸道內(nèi)優(yōu)勢(shì)菌上清發(fā)酵液p H的測(cè)定48
  • 3.1.3 PWS兒童營(yíng)養(yǎng)干預(yù)后腸道內(nèi)優(yōu)勢(shì)菌短鏈脂肪酸產(chǎn)生能力的測(cè)定48
  • 3.1.4 PWS兒童營(yíng)養(yǎng)干預(yù)后腸道內(nèi)優(yōu)勢(shì)菌上清發(fā)酵液抑菌能力的測(cè)定48-49
  • 3.1.5 PWS兒童營(yíng)養(yǎng)干預(yù)后腸道內(nèi)雙歧桿菌分離株碳水化合物利用能力的研究49-50
  • 3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果50-65
  • 3.2.1 PWS兒童營(yíng)養(yǎng)干預(yù)后腸道內(nèi)優(yōu)勢(shì)菌的生長(zhǎng)曲線50-51
  • 3.2.2 PWS兒童營(yíng)養(yǎng)干預(yù)后腸道內(nèi)優(yōu)勢(shì)菌的短鏈脂肪酸產(chǎn)生能力51-53
  • 3.2.3 PWS兒童營(yíng)養(yǎng)干預(yù)后腸道內(nèi)優(yōu)勢(shì)菌上清發(fā)酵液的抑菌能力53-55
  • 3.2.4 PWS兒童營(yíng)養(yǎng)干預(yù)后腸道內(nèi)雙歧桿菌分離株利用碳水化合物的能力55-65
  • 3.3 討論65-68
  • 本章小結(jié)68-69
  • 課題總結(jié)69-70
  • 參考文獻(xiàn)70-73
  • 附錄 1:PWS兒童營(yíng)養(yǎng)干預(yù)后腸道內(nèi)優(yōu)勢(shì)菌假小鏈雙歧桿菌C95菌株全基因組序列的測(cè)定73-84
  • 引言73
  • 4.1 方法73-75
  • 4.1.1 菌株的全基因組DNA的提取73
  • 4.1.2 菌株的全基因組序列的測(cè)定及分析73-75
  • 4.2 菌株全基因組的測(cè)定結(jié)果75-81
  • 4.2.1 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)和質(zhì)控結(jié)果75-76
  • 4.2.2 樣品reads的組裝結(jié)果76-78
  • 4.2.3 基因注釋78-81
  • 討論81-83
  • 參考文獻(xiàn)83-84
  • 附錄 2:培養(yǎng)基和溶液試劑的配制84-85
  • 附錄 3:實(shí)驗(yàn)所用的主要儀器85-86
  • 致謝86-88

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