牛乳蛋白過(guò)敏兒童腸道菌群結(jié)構(gòu)及短鏈脂肪酸分析
發(fā)布時(shí)間:2021-10-10 22:11
牛乳蛋白過(guò)敏(cow milk protein allergy,CMPA)是嬰兒及兒童中常見的食物過(guò)敏之一,一般情況下兒童的過(guò)敏癥狀會(huì)在5歲左右逐漸減輕,直至消失,但仍有10%左右的過(guò)敏兒童不能自動(dòng)康復(fù),會(huì)持續(xù)過(guò)敏癥狀且日益嚴(yán)重。腸道菌群作為人體最大的“微生物器官”與健康息息相關(guān),正常情況下腸道菌群處于動(dòng)態(tài)平衡的狀態(tài)。當(dāng)這種平衡被破壞,可能引起過(guò)敏疾病等疾病的發(fā)生。短鏈脂肪酸(short-chain fatty acids,SCFA)作為腸道中微生物代謝的最終產(chǎn)物,參與機(jī)體免疫調(diào)節(jié)和發(fā)育。目前研究多集中于發(fā)生牛乳蛋白過(guò)敏的嬰兒的腸道菌群結(jié)構(gòu)及糞便中SCFAs的變化,針對(duì)5-10歲的CMPA兒童腸道菌群及SCFAs的研究還很少,因此,本研究選擇5-8歲CMPA兒童的腸道菌群和糞便中SCFAs及乳酸的變化進(jìn)行探究。本研究選取了2016年6月至2016年12月經(jīng)哈爾濱兒童醫(yī)院確診為牛乳蛋白過(guò)敏的5-8歲兒童共6例,并在同一時(shí)間段選取了8例哈爾濱地區(qū)相同年齡段的健康兒童作為對(duì)照。采集所有兒童的糞便樣品用于試驗(yàn)。試驗(yàn)主要分為兩部分,第一部分為通過(guò)16S rDNA擴(kuò)增子測(cè)序?qū)λ械募S便樣品進(jìn)行分析...
【文章來(lái)源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:55 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
兒童糞便中細(xì)菌DNA的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物質(zhì)量分析
圖 3-2 OTU 獲得情況分析Figure 3-2 Analysis of OTU accepted3.3 樣品復(fù)雜度分析3.3.1 Alpha 多樣性指數(shù)分析通常情況下,同一個(gè)種的序列指的是在 97%以上的序列都一致的條件下,可聚類成一個(gè)OTU 的序列[90]。通過(guò)使用 Qiime 軟件(Version 1.7.0)對(duì)不同樣品在 97%一致性閾值下的 alpha多樣性分析指數(shù)(Chao 1 指數(shù)、Shannon 指數(shù)、Simpson 指數(shù)和 ACE 指數(shù))進(jìn)行統(tǒng)計(jì)[91],進(jìn)而可以分析兩組兒童的腸道菌群的豐度及多樣性的差異。表 3-1 為兩組樣品的 alpha 多樣性分析指數(shù)的統(tǒng)計(jì)結(jié)果,兩組樣品的 4 個(gè)指數(shù)在統(tǒng)計(jì)學(xué)上都沒有顯著的的差異(P > 0.05),這表明兩組兒童的腸道菌群在豐度和多樣性上都沒有明顯的差異。一般在嬰幼兒時(shí)期,不同個(gè)體的腸道菌群會(huì)有顯著性的差異[92]。當(dāng)兒童年齡達(dá)到 3 歲左右,其腸道菌群基本達(dá)到了一個(gè)動(dòng)態(tài)的平衡,結(jié)構(gòu)類似于成人的腸道菌群結(jié)構(gòu)[93]。由于本研究中的兒童年齡在 5-8 歲,且都生活在一個(gè)環(huán)境中,所以不同個(gè)體的腸道菌群的結(jié)構(gòu)沒有顯著性的差異也是合理的。表 3-1 Alpha 多樣性指數(shù)分析
3.2 物種多樣性曲線分析3.2.1 稀釋曲線分析稀釋曲線是指在所有的樣品中通過(guò)隨機(jī)抽取獲得部分?jǐn)?shù)據(jù),進(jìn)而分析它們所代表的Us 數(shù)目[94]。由稀釋曲線可看出數(shù)據(jù)是否安排合理且能間接地看出樣品中物種的豐度情 3-3 為 14 個(gè)兒童樣品的稀釋曲線圖,health 1-health 8 表示健康組的 8 個(gè)樣品,cmpa 1- c示過(guò)敏組中的 6 個(gè)樣品。由圖可看出,cmpa 6、health 4、health 5、health 6、health 7alth 8 這六個(gè)樣本隨著測(cè)序條數(shù)的增多,曲線基本平行,這表明所用的數(shù)據(jù)已經(jīng)足夠,表驗(yàn)取樣合理。而其他的八個(gè)樣本隨著測(cè)序條數(shù)的增多還沒有進(jìn)入平臺(tái)期,這也意味著當(dāng)數(shù)量逐漸變大時(shí),新的物種也會(huì)逐漸增多。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]腸道微生物與過(guò)敏性疾病關(guān)系研究進(jìn)展[J]. 李海亮,毛紹名,鄧穎,尹業(yè)師. 中國(guó)微生態(tài)學(xué)雜志. 2017(11)
[2]乳酸菌與健康[J]. 溫曉慶,王奇. 農(nóng)業(yè)開發(fā)與裝備. 2017(09)
[3]腸道菌群功能與影響因素研究進(jìn)展[J]. 郭亮,陳國(guó)薇,謝曼曼,丁承超,劉武康,董慶利,劉箐. 微生物學(xué)雜志. 2017(04)
[4]過(guò)敏性紫癜患兒糞便細(xì)菌代謝相關(guān)產(chǎn)物短鏈脂肪酸水平測(cè)定及其意義[J]. 胡紅衛(wèi),潘媛,趙波,劉梅,熊晶晶,廖亞彬,吉曉菲,張婷婷,張麗芝,黃永坤. 中國(guó)實(shí)用兒科雜志. 2017(07)
[5]高通量測(cè)序分析老年血液透析患者腸道菌群的改變[J]. 胡建廣,鐘小仕,閆靜,覃丹平,鄭媛媛,譚榮韶,劉巖. 中國(guó)中西醫(yī)結(jié)合腎病雜志. 2017(02)
[6]長(zhǎng)雙歧桿菌BBMN68誘導(dǎo)的樹突狀細(xì)胞對(duì)小鼠牛乳β-乳球蛋白過(guò)敏的緩解作用[J]. 楊景,羅緒剛,任發(fā)政. 現(xiàn)代食品科技. 2016(07)
[7]牛奶蛋白過(guò)敏診斷方法的研究現(xiàn)狀[J]. 黃秋香,金玉. 檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)與臨床. 2016(08)
[8]壯族人群腸道菌群多樣性分析[J]. 鄭藝,張家超,喬健敏,霍東雪,黃衛(wèi)強(qiáng),侯強(qiáng)川,張和平. 中國(guó)食品學(xué)報(bào). 2016(01)
[9]熒光定量RT-PCR檢測(cè)PRRSV方法的建立及初步應(yīng)用[J]. 周一媚,勞秀杰,黃巧蓮,徐露凝,鄭悅,葉笑,王曉杜,邵春艷,楊永春,宋厚輝. 畜牧與獸醫(yī). 2016(01)
[10]短鏈脂肪酸的作用及其調(diào)控機(jī)理[J]. 劉虎,任傲,方熱軍. 中國(guó)豬業(yè). 2015(11)
博士論文
[1]16S rRNA高通量測(cè)序分析條銹菌侵染對(duì)小麥根部菌群影響及新種放線菌鑒定[D]. 趙軍偉.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
碩士論文
[1]新生兒腸道菌群分布特征及其影響因素[D]. 胡潤(rùn)芳.上海交通大學(xué) 2015
[2]B-LACTOGLOBULIN致敏性降低的免疫學(xué)機(jī)制[D]. 段翠翠.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
本文編號(hào):3429242
【文章來(lái)源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:55 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
兒童糞便中細(xì)菌DNA的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物質(zhì)量分析
圖 3-2 OTU 獲得情況分析Figure 3-2 Analysis of OTU accepted3.3 樣品復(fù)雜度分析3.3.1 Alpha 多樣性指數(shù)分析通常情況下,同一個(gè)種的序列指的是在 97%以上的序列都一致的條件下,可聚類成一個(gè)OTU 的序列[90]。通過(guò)使用 Qiime 軟件(Version 1.7.0)對(duì)不同樣品在 97%一致性閾值下的 alpha多樣性分析指數(shù)(Chao 1 指數(shù)、Shannon 指數(shù)、Simpson 指數(shù)和 ACE 指數(shù))進(jìn)行統(tǒng)計(jì)[91],進(jìn)而可以分析兩組兒童的腸道菌群的豐度及多樣性的差異。表 3-1 為兩組樣品的 alpha 多樣性分析指數(shù)的統(tǒng)計(jì)結(jié)果,兩組樣品的 4 個(gè)指數(shù)在統(tǒng)計(jì)學(xué)上都沒有顯著的的差異(P > 0.05),這表明兩組兒童的腸道菌群在豐度和多樣性上都沒有明顯的差異。一般在嬰幼兒時(shí)期,不同個(gè)體的腸道菌群會(huì)有顯著性的差異[92]。當(dāng)兒童年齡達(dá)到 3 歲左右,其腸道菌群基本達(dá)到了一個(gè)動(dòng)態(tài)的平衡,結(jié)構(gòu)類似于成人的腸道菌群結(jié)構(gòu)[93]。由于本研究中的兒童年齡在 5-8 歲,且都生活在一個(gè)環(huán)境中,所以不同個(gè)體的腸道菌群的結(jié)構(gòu)沒有顯著性的差異也是合理的。表 3-1 Alpha 多樣性指數(shù)分析
3.2 物種多樣性曲線分析3.2.1 稀釋曲線分析稀釋曲線是指在所有的樣品中通過(guò)隨機(jī)抽取獲得部分?jǐn)?shù)據(jù),進(jìn)而分析它們所代表的Us 數(shù)目[94]。由稀釋曲線可看出數(shù)據(jù)是否安排合理且能間接地看出樣品中物種的豐度情 3-3 為 14 個(gè)兒童樣品的稀釋曲線圖,health 1-health 8 表示健康組的 8 個(gè)樣品,cmpa 1- c示過(guò)敏組中的 6 個(gè)樣品。由圖可看出,cmpa 6、health 4、health 5、health 6、health 7alth 8 這六個(gè)樣本隨著測(cè)序條數(shù)的增多,曲線基本平行,這表明所用的數(shù)據(jù)已經(jīng)足夠,表驗(yàn)取樣合理。而其他的八個(gè)樣本隨著測(cè)序條數(shù)的增多還沒有進(jìn)入平臺(tái)期,這也意味著當(dāng)數(shù)量逐漸變大時(shí),新的物種也會(huì)逐漸增多。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]腸道微生物與過(guò)敏性疾病關(guān)系研究進(jìn)展[J]. 李海亮,毛紹名,鄧穎,尹業(yè)師. 中國(guó)微生態(tài)學(xué)雜志. 2017(11)
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[4]過(guò)敏性紫癜患兒糞便細(xì)菌代謝相關(guān)產(chǎn)物短鏈脂肪酸水平測(cè)定及其意義[J]. 胡紅衛(wèi),潘媛,趙波,劉梅,熊晶晶,廖亞彬,吉曉菲,張婷婷,張麗芝,黃永坤. 中國(guó)實(shí)用兒科雜志. 2017(07)
[5]高通量測(cè)序分析老年血液透析患者腸道菌群的改變[J]. 胡建廣,鐘小仕,閆靜,覃丹平,鄭媛媛,譚榮韶,劉巖. 中國(guó)中西醫(yī)結(jié)合腎病雜志. 2017(02)
[6]長(zhǎng)雙歧桿菌BBMN68誘導(dǎo)的樹突狀細(xì)胞對(duì)小鼠牛乳β-乳球蛋白過(guò)敏的緩解作用[J]. 楊景,羅緒剛,任發(fā)政. 現(xiàn)代食品科技. 2016(07)
[7]牛奶蛋白過(guò)敏診斷方法的研究現(xiàn)狀[J]. 黃秋香,金玉. 檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)與臨床. 2016(08)
[8]壯族人群腸道菌群多樣性分析[J]. 鄭藝,張家超,喬健敏,霍東雪,黃衛(wèi)強(qiáng),侯強(qiáng)川,張和平. 中國(guó)食品學(xué)報(bào). 2016(01)
[9]熒光定量RT-PCR檢測(cè)PRRSV方法的建立及初步應(yīng)用[J]. 周一媚,勞秀杰,黃巧蓮,徐露凝,鄭悅,葉笑,王曉杜,邵春艷,楊永春,宋厚輝. 畜牧與獸醫(yī). 2016(01)
[10]短鏈脂肪酸的作用及其調(diào)控機(jī)理[J]. 劉虎,任傲,方熱軍. 中國(guó)豬業(yè). 2015(11)
博士論文
[1]16S rRNA高通量測(cè)序分析條銹菌侵染對(duì)小麥根部菌群影響及新種放線菌鑒定[D]. 趙軍偉.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
碩士論文
[1]新生兒腸道菌群分布特征及其影響因素[D]. 胡潤(rùn)芳.上海交通大學(xué) 2015
[2]B-LACTOGLOBULIN致敏性降低的免疫學(xué)機(jī)制[D]. 段翠翠.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
本文編號(hào):3429242
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