新的良性家族性嬰兒驚厥候選基因的突變分析
發(fā)布時(shí)間:2020-10-16 14:16
背景 良性家族性嬰兒驚厥(Benign familial infantile convulsions,BFIC或benign familial infantile seizures,BFIS)是一種較為罕見(jiàn)的呈常染色體顯性遺傳特發(fā)性癲癇綜合征。臨床特點(diǎn)為3~12個(gè)月出現(xiàn)的、2~5歲自行消失的、預(yù)后良好的無(wú)熱性癲癇發(fā)作,精神運(yùn)動(dòng)發(fā)育無(wú)異常,血生化檢查、發(fā)作間期腦電圖及神經(jīng)影像學(xué)檢查正常。分子遺傳學(xué)研究發(fā)現(xiàn)BFIC具有遺傳異質(zhì)性,目前已定位3個(gè)致病基因位點(diǎn),分別為19q12-13.1、16p12-q12及2q24,但其致病基因尚未克隆。前期工作中,我們通過(guò)對(duì)中國(guó)湖南省BFIC大家系進(jìn)行全基因組掃描、連鎖分析,將該家系的致病基因精確定位于1p36.12-35.1上D1S2864和D1S2830之間約12.4cM的區(qū)域內(nèi),為一個(gè)新的染色體位點(diǎn)。 目的 為了克隆這一新的BFIC致病基因,我們采用功能.候選克隆的方法,在該定位區(qū)間內(nèi)篩選5個(gè)候選基因進(jìn)行突變分析。 方法 根據(jù)癲癇的病理生理發(fā)病機(jī)制、已克隆特發(fā)性癲癇致病基因特點(diǎn),結(jié)合該區(qū)域內(nèi)各基因的生物學(xué)信息,篩選了GPATC3、SESN2、SFN、TAF12、TCEA3作為候選基因,應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)結(jié)合DNA直接測(cè)序的方法進(jìn)行基因突變分析。 結(jié)果 在該BFIC家系中,5個(gè)侯選基因的突變檢測(cè)未發(fā)現(xiàn)任何致病突變。共發(fā)現(xiàn)5個(gè)多態(tài),分別為:TCEA3基因的IVS3+174 C>A、IVS5-22C→A、IVS10-34T→C、C.980G→A;GPATC3基因的IVS1+138G>T;其中TCEA3基因的WS1-122C→A為新發(fā)現(xiàn)的多態(tài)。SESN2、SFN、TAF12基因未發(fā)現(xiàn)任何序列變異。 結(jié)論 1.排除了GPATC3、SESN2、SFN、TAF12、TCEA3這5個(gè)基因?yàn)樵揃FIC家系致病基因的可能,為進(jìn)一步功能候選克隆工作奠定了基礎(chǔ)。 2.共發(fā)現(xiàn)5個(gè)單核苷酸多態(tài),其中TCEA3基因的IVS1-122C→A為新發(fā)現(xiàn)的SNP。
【學(xué)位單位】:中南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2009
【中圖分類(lèi)】:R720.597
【部分圖文】:
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【參考文獻(xiàn)】
本文編號(hào):2843367
【學(xué)位單位】:中南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2009
【中圖分類(lèi)】:R720.597
【部分圖文】:
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【參考文獻(xiàn)】
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1 周軍衛(wèi),杜培潔,黃希順;良性家族性嬰兒驚厥疾病基因與染色體8q24的連鎖分析[J];陜西醫(yī)學(xué)雜志;2005年01期
2 尹景崗,章全偉,宋永釗,張鉞,李紅梅,呂冬苗,霍衛(wèi)紅,賈福軍,顧仁駿,李沖,趙惠琳,李智芳,梁秀齡;良性家族性嬰兒癲癇兩高發(fā)家系臨床特征及染色體研究[J];實(shí)用兒科臨床雜志;1997年04期
3 周軍衛(wèi),李曉文,黃希順,陳輝,宋國(guó)英,魏建科,盧宏;良性家族性嬰兒驚厥疾病基因的位點(diǎn)異質(zhì)性研究[J];中風(fēng)與神經(jīng)疾病雜志;2003年06期
4 向燕群,唐北沙,沈璐,施小六,江泓,嚴(yán)新翔,郭伍英,吳志國(guó),劉月娥;良性家族性嬰兒驚厥疾病基因定位的初步研究[J];中華神經(jīng)科雜志;2000年05期
5 楊露春,曹克勇,朱雷,楊金辰;中國(guó)農(nóng)村及少數(shù)民族地區(qū)癲癇流行病學(xué)調(diào)查[J];中華神經(jīng)外科雜志;1989年S1期
6 肖波,寧景春,楊曉蘇,吳志國(guó);良性家族性嬰兒驚厥一家系[J];中華醫(yī)學(xué)雜志;2001年20期
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1 李海燕;新的BFIC致病基因的定位、候選克隆及BFNC的KCNQ3基因突變檢測(cè)[D];中南大學(xué);2006年
本文編號(hào):2843367
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