基于高通量測(cè)序的川崎病患兒腸道菌群研究
發(fā)布時(shí)間:2020-09-25 08:12
【研究目的】本研究旨在研究川崎病患兒腸道菌群紊亂情況,并分析腸道菌群的豐度、多樣性、組成和標(biāo)志微生物等特點(diǎn),以探討兒童川崎病與腸道菌群的潛在相關(guān)性。【研究方法】本研究共計(jì)納入61名兒童,包括2017年8月~2018年3月期間在濟(jì)南市兒童醫(yī)院確診的26例川崎病住院患兒以及同期在該院體檢合格的35名健康兒童。PCR擴(kuò)增川崎病患兒和健康兒童糞便樣本中16S rRNA基因的V1~V2可變區(qū),并在高通量測(cè)序后進(jìn)行細(xì)菌學(xué)分類。通過(guò)α多樣性、β多樣性、線性判別分析和LEfSe差異分析比較兩組間差異。【研究結(jié)果】卡方檢驗(yàn)結(jié)果顯示兩組間的男女性別比例沒(méi)有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.237)。川崎病組平均年齡(2.1±1.96歲)和健康對(duì)照組(2.0±2.1歲)相比沒(méi)有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.574)。兩組間腸道菌群的α多樣性分析結(jié)果顯示,川崎病組的Shannon指數(shù)和Ace指數(shù)均高于健康對(duì)照組,但只有后者具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.0001)。PCoA分析(UniFrac,未加權(quán))腸道菌群的結(jié)構(gòu)表明,川崎病患兒與健康兒童之間的腸道菌群結(jié)構(gòu)具有較大差異,ANOSIM分析進(jìn)一步明確兩組間的差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.01)。對(duì)各OTUs進(jìn)行聚類后分析發(fā)現(xiàn),在門(mén)水平,兩組均主要由厚壁菌門(mén)、擬桿菌門(mén)和變形菌門(mén)構(gòu)成。在屬水平,川崎病組主要成員(平均含量大于1%)包括擬桿菌屬、乳酸桿菌屬、韋榮球菌屬、糞桿菌屬、腸球菌屬、副桿菌屬、發(fā)光桿菌屬、雙歧桿菌屬、鏈球菌屬和薩特氏菌屬;對(duì)照組主要成員(平均含量大于1%)包括擬桿菌屬、乳酸桿菌屬、韋榮球菌屬、糞桿菌屬、梭菌屬、鏈球菌屬和薩特氏菌屬。為進(jìn)一步進(jìn)行區(qū)分,我們利用LEfSe技術(shù)對(duì)菌群組成差異進(jìn)行了對(duì)比分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),川崎病組在門(mén)水平可見(jiàn)擬桿菌門(mén)和放線菌門(mén)中的微生物數(shù)量增加,在屬水平可見(jiàn)擬桿菌屬、腸球菌屬、糞桿菌屬、發(fā)光桿菌屬、副桿菌屬、雙歧桿菌屬和薩特氏菌屬中的微生物數(shù)量增加(LDA3.0);對(duì)照組在門(mén)水平可見(jiàn)厚壁菌門(mén)中的微生物數(shù)量增加,在屬水平可見(jiàn)乳酸桿菌屬、韋榮球菌屬、梭菌屬和刺骨魚(yú)菌屬中的微生物數(shù)量增加(LDA3.0)!狙芯拷Y(jié)論】1.本研究結(jié)果表明,川崎病患兒存在腸道菌群紊亂。2.相對(duì)于健康兒童,川崎病患兒的腸道菌群豐度增加,并且在組成和結(jié)構(gòu)方面也均發(fā)生了改變,這可能與川崎病的病因或發(fā)病機(jī)制相關(guān)。3.該研究結(jié)果為后期開(kāi)發(fā)基于腸道微生態(tài)方向的預(yù)防干預(yù)或輔助診療提供了部分理論基礎(chǔ)。
【學(xué)位單位】:濟(jì)南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:R725.4
【部分圖文】:
第三章 結(jié)果與分析平均每個(gè)樣本的 HQ Reads 為 33,757 個(gè)。由于樣本品達(dá)到足夠的測(cè)序深度情況下對(duì)每個(gè)樣本進(jìn)行了標(biāo)線圖(如圖 1)。如圖顯示,在測(cè)序深度到達(dá) 1長(zhǎng)趨于平緩,表明測(cè)序結(jié)果滿足要求,可以進(jìn)行后病組的稀釋曲線相對(duì)高于對(duì)照組,說(shuō)明川崎病組的一步分析了川崎病患兒和健康兒童腸道菌群的 多on 和 Ace 指數(shù)均高于對(duì)照組,但只有 Ace 指數(shù)之間圖 2),即川崎病組的腸道菌群豐度顯著高于對(duì)照
基于未加權(quán)UniFrac距離的PCoA分析
濟(jì)南大學(xué)碩士學(xué)位論文,分別占據(jù)總比例的 18.8%、20.8%和 16.7%,然而為 25%、3.3%和 2.5%。此外,川崎病組中的相對(duì)屬(5.8%)、發(fā)光桿菌屬(5%)和雙歧桿菌屬(2.5
【學(xué)位單位】:濟(jì)南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:R725.4
【部分圖文】:
第三章 結(jié)果與分析平均每個(gè)樣本的 HQ Reads 為 33,757 個(gè)。由于樣本品達(dá)到足夠的測(cè)序深度情況下對(duì)每個(gè)樣本進(jìn)行了標(biāo)線圖(如圖 1)。如圖顯示,在測(cè)序深度到達(dá) 1長(zhǎng)趨于平緩,表明測(cè)序結(jié)果滿足要求,可以進(jìn)行后病組的稀釋曲線相對(duì)高于對(duì)照組,說(shuō)明川崎病組的一步分析了川崎病患兒和健康兒童腸道菌群的 多on 和 Ace 指數(shù)均高于對(duì)照組,但只有 Ace 指數(shù)之間圖 2),即川崎病組的腸道菌群豐度顯著高于對(duì)照
基于未加權(quán)UniFrac距離的PCoA分析
濟(jì)南大學(xué)碩士學(xué)位論文,分別占據(jù)總比例的 18.8%、20.8%和 16.7%,然而為 25%、3.3%和 2.5%。此外,川崎病組中的相對(duì)屬(5.8%)、發(fā)光桿菌屬(5%)和雙歧桿菌屬(2.5
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1 彭江峰;黃敏;;以神經(jīng)系統(tǒng)癥狀首發(fā)的不完全川崎病1例報(bào)告[J];柳州醫(yī)學(xué);2007年01期
2 顧愛(ài)蘭;;對(duì)川崎病患兒運(yùn)用追蹤延伸護(hù)理的效果觀察[J];中外女性健康研究;2018年23期
3 張紅艷;薛瑩瑩;;川崎病的觀察和護(hù)理[J];首都食品與醫(yī)藥;2019年02期
4 張永遠(yuǎn);溫曉紅;;嬰兒川崎病的早期臨床和血液學(xué)特點(diǎn)[J];臨床輸血與檢驗(yàn);2019年01期
5 肖
本文編號(hào):2826466
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