新生兒壞死性小腸結(jié)腸炎腸道微生物群落多樣性變化的相關研究
本文選題:新生兒 + 壞死; 參考:《重慶醫(yī)科大學》2016年博士論文
【摘要】:第一部分早產(chǎn)兒壞死性小腸結(jié)腸炎腸道菌群多樣性變化的研究【目的】通過16S r DNA PCR產(chǎn)物的高通量測序技術,探討早產(chǎn)兒壞死性小腸結(jié)腸炎腸道微生物的群落結(jié)構!痉椒ā恳2011年6月至2015年6月在重慶醫(yī)科大學附屬深圳市兒童醫(yī)院和重慶醫(yī)科大學附屬兒童醫(yī)院住院的32例早產(chǎn)兒為研究對象,分為NEC組和對照組,每組各16例;對照組患兒在胎齡、出生方式、日齡(以診斷NEC時患兒日齡為準)等均與相應NEC組患兒相匹配。根據(jù)胎齡又分為2個亞組:晚期早產(chǎn)兒組(35W-36+6W)和中期早產(chǎn)兒組(30W-34+6W)。糞便樣本盡可能的在診斷NEC后的24小時內(nèi)采集,提取糞便DNA后,利用高通量測序技術進行測序,所得數(shù)據(jù)進行生物信息學分析!窘Y(jié)果】32例早產(chǎn)兒的糞便樣本納入分析,NEC組和對照組各16例。NEC組和對照組的Shannon指數(shù)分別為0.77±0.60、0.97±0.34,simpson指數(shù)分別為0.67±0.22、0.53±0.15,兩組間差別接近差異(P分別=0.09、0.07),NEC組患兒腸道菌群多樣性有下降趨勢。同時利用生物信息學方法分析高通量數(shù)據(jù)結(jié)果顯示,在屬的水平,NEC早產(chǎn)兒腸道微生物中棒狀桿菌屬(Corynebacterium)比例增多和乳酸桿菌屬(Lactobacillus)比例減少。在各亞組中,與對照組相比,晚期早產(chǎn)兒NEC組的棒狀桿菌屬比例也顯著增高;而中期早產(chǎn)兒NEC組的志賀氏菌屬(Shigella)比例升高明顯。【結(jié)論】棒狀桿菌屬增多和乳酸桿菌屬減少與NEC的發(fā)生密切相關;棒狀桿菌改變可能參與了晚期早產(chǎn)兒的NEC發(fā)生;過度繁殖的志賀氏菌屬與中期早產(chǎn)兒NEC密切相關;中期早產(chǎn)兒和晚期早產(chǎn)兒發(fā)生NEC時的腸道菌群變化不完全一致。第二部分新生兒壞死性小腸結(jié)腸炎腸粘膜菌群多樣性變化的研究【目的】通過16S r DNA PCR產(chǎn)物的高通量測序技術,探討新生兒壞死性小腸結(jié)腸炎腸粘膜菌群的多樣性變化!痉椒ā吭2011年6月至2015年10月在重慶醫(yī)科大學附屬深圳市兒童醫(yī)院和重慶醫(yī)科大學附屬兒童醫(yī)院住院的14例新生兒為研究對象,分為NEC組和對照組,其中NEC組9例,對照組為腸道畸形患兒5例,所有病例均需要手術治療。腸粘膜菌群樣本提取糞便DNA后,利用高通量測序技術方法進行測序,所得數(shù)據(jù)進行生物信息學分析!窘Y(jié)果】15份新生兒的腸粘膜菌群樣本納入分析,NEC組10份(其中1例患兒采集了2份樣本)和對照組5份。NEC組和對照組Shannon指數(shù)分別為1.13±0.39,3.37±0.81,NEC組的Shannon指數(shù)明顯低于對照組,有顯著統(tǒng)計學差異(P0.001);NEC組和對照組simpson指數(shù)分別為0.47±0.19,0.12±0.04,NEC組的simpson指數(shù)明顯高于對照組,有顯著統(tǒng)計學差異(P0.001)。NEC組和對照組chao豐度分別為110.8±72.17和456.4±84.33,NEC組和對照組ace豐度分別為126.3±73.18和448.4±82.01,NEC組chao豐度和ace豐度較對照組顯著降低,兩組間有明顯統(tǒng)計學差異(P均0.001)。同時利用生物信息學方法分析高通量數(shù)據(jù)結(jié)果顯示,在屬的水平,與對照相比,外科NEC時腸道微生物中棒狀桿菌屬(Corynebacterium)和不動桿菌屬(Acinetobacter)比例增多,擬桿菌屬(Bacteroides)、志賀菌屬(Escherichia_Shigella)、Erysipelatoclostridium和彎曲菌屬(Campylobacter)比例減少。【結(jié)論】腸粘膜菌群豐度和多樣性下降與外科NEC相關;棒狀桿菌屬增多和擬桿菌屬減少與外科NEC的發(fā)生密切相關;NEC時糞便樣本與腸粘膜樣本的菌群結(jié)構不完全一致。
[Abstract]:In the first part , 32 premature infants were divided into NEC group and control group . The results showed that the ratio of Corynebacterium and Lactobacillus in NEC group were significantly higher than those in the control group . Conclusion : The abundance and diversity of intestinal mucosal flora were associated with NEC , and the number of rod - like bacteria and the decrease of bacteroid were closely related to the occurrence of NEC . The stool samples were not completely consistent with the structure of intestinal mucosa samples .
【學位授予單位】:重慶醫(yī)科大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:R722.1
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,本文編號:1752852
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