本文關(guān)鍵詞：綠殼蛋雞LSm14A基因克隆與組織分布分析

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【摘要】：為探明綠殼蛋雞LSm14A分子序列特征與其在綠殼蛋雞體內(nèi)不同組織中的分布情況。本研究利用RT-PCR方法擴(kuò)增LSm14A基因編碼區(qū)全長(zhǎng)序列并進(jìn)行克隆測(cè)序。利用DNAStar軟件對(duì)LSm14A基因與鴨、人、鼠等其他13個(gè)物種的LSm14A基因核苷酸、氨基酸序列進(jìn)行比對(duì)分析,并對(duì)綠殼蛋雞LSm14A基因所編碼的蛋白進(jìn)行了二級(jí)結(jié)構(gòu)、B細(xì)胞表位、保守結(jié)構(gòu)域、跨膜結(jié)構(gòu)域和信號(hào)膚預(yù)測(cè)。同時(shí)采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法檢測(cè)綠殼蛋雞源LSm14A基因在綠殼蛋雞不同組織中的轉(zhuǎn)錄水平差異。綠殼蛋雞LSm14A基因克隆結(jié)果顯示:綠殼蛋雞LSm14A全長(zhǎng)CDS為1386 by,編碼461個(gè)氨基酸;與原雞源LSm14A相似性達(dá)99.6%,與鴨源的LSm14A相似性為94.7%,與人源、猴源、豬源、爪蟾的LSm14A相似性較低;系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)顯示其序列與原雞的親緣關(guān)系最近,且處于同一遺傳進(jìn)化分枝。綠殼蛋雞LSm14A基因編碼蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果顯示:綠殼蛋雞LSm14A基因編碼蛋白親水性較好,為非分泌蛋白,含有Sm1與Sm2基序和FDF結(jié)構(gòu)域,不存在跨膜結(jié)構(gòu),熒光定量結(jié)果顯示:LSm14A分子在綠殼蛋雞不同組織中均有分布且有不同程度的表達(dá),在免疫器官法氏囊、胸腺中表達(dá)較高,而在肝臟中表達(dá)最低。本研究結(jié)果說(shuō)明綠殼蛋雞LSm14A分子具有較高的保守性,在綠殼蛋雞不同組織中呈廣泛性表達(dá),在禽類中樞免疫器官中呈高水平表達(dá),將為研究LSm14A分子在天然免疫中的作用機(jī)制、防控禽類病毒性疾病奠定基礎(chǔ)。
【作者單位】： 貴州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院;貴州省動(dòng)物疫病與獸醫(yī)公共衛(wèi)生重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 綠殼蛋雞 LSmA 組織分布
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(No.31460668) 貴州省科學(xué)技術(shù)基金(No.(2015)2046) 貴州大學(xué)博士基金(No.(2013)12)、貴州大學(xué)研究生創(chuàng)新基金(No.研農(nóng)2015024)、貴州大學(xué)“本科教學(xué)工程”項(xiàng)目(No.JKSP2013004) 貴州省科技創(chuàng)新人才團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目[No.黔科合人才團(tuán)隊(duì)(2015)4016]共同資助
【分類號(hào)】：S831
【正文快照】： L Sm 1 4A最先在伊比利亞肋突(Newt Pleurodeleswaltl)與非洲爪蟾(Xenopus laevis)中發(fā)現(xiàn),主要結(jié)合在卵母細(xì)胞質(zhì)處理小體(processing bodies,P-bodies)上,在進(jìn)化上具有保守性(L ieb et al.,1 998)。人類的L Sm l4A位于P-body上,在病毒感染的早期,能夠與多種病毒核酸結(jié)合,并能

【相似文獻(xiàn)】

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