發(fā)布時間：2017-09-13 06:14

  本文關(guān)鍵詞：雞腳重性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析

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【摘要】：雞(Gallus gallus)腳重性狀為雞產(chǎn)業(yè)中的重要經(jīng)濟性狀。為了揭示雞腳重性狀的遺傳基礎(chǔ),尋找可用于雞腳改良的分子標(biāo)記,本研究以核心群京海黃雞為實驗動物,測定其腳重,利用簡化基因組測序技術(shù)在整個基因組范圍內(nèi)檢測與腳重相關(guān)的SNPs。共檢測到16個與腳重相關(guān)的SNPs位點,其中13個集中分布在4號染色體上72.8~77.9 Mb區(qū)域;2個SNP位點rs475641139和rs475548810達(dá)到5%Bonferroni全基因組顯著水平(P5.5E-07),其余位點達(dá)到全基因組潛在顯著水平(P1.1E-05)。篩選每個SNP周圍1 Mb區(qū)域內(nèi)的基因,共找到9個可能的候選基因,并使用基因本體論(Gene Ontology,GO)數(shù)據(jù)庫對9個候選基因的細(xì)胞組分、分子功能和參與的生物學(xué)進(jìn)程進(jìn)行了分析。結(jié)果表明二氫蝶啶還原酶(dihydropteridine deductase,QDPR)基因、LIM域結(jié)合蛋白2(LIM domain-binding protein 2,LDB2)基因、類184B家族(family with sequence similarity 184 member B,FAM184B)基因、復(fù)合信號免疫球蛋白J結(jié)合蛋白(recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region,RBPJ)基因、纖維母細(xì)胞生長因子結(jié)合蛋白2(fibroblast growth factor-binding protein 2,FGFBP2)基因、富亮氨酸重復(fù)蛋白5(F-box and leucine-rich repeat protein 5,FBXL5)基因、膽囊收縮素受體A(cholecystokinin receptor type A,CCK1R)基因、肌動蛋白互作蛋白1(WD repeat containing protein 1,WDR1)基因和類桶狀蛋白4(tubby like protein 4,TULP4)9個基因和4號染色體72.8~77.9 Mb區(qū)域可能為影響雞腳重性狀的重要候選基因和潛在功能區(qū)域。本研究為雞腳重性狀的標(biāo)記輔助選擇提供了理論依據(jù)。
【作者單位】： 江蘇農(nóng)牧科技職業(yè)學(xué)院寵物科技學(xué)院;宜春學(xué)院生命科學(xué)與資源環(huán)境學(xué)院;揚州大學(xué)動物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 簡化基因組測序 腳重 全基因組關(guān)聯(lián)分析 TASSEL模型
【基金】：國家肉雞產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(No.nycytx-42-G1-05)
【分類號】：S831.2
【正文快照】： 學(xué)院,揚州225009雞(Gallus gallus)腳即雞爪,又名雞掌、鳳爪、鳳足,雞爪作為一種食材,深受人們的的喜愛,且富含谷氨酸,膠原蛋白和鈣質(zhì),不但能軟化血管,同時具有美容功效。據(jù)相關(guān)統(tǒng)計,2010年鳳爪在我國的銷售額達(dá)到30~40億元,因此,找出能夠影響雞腳重的分子標(biāo)記,進(jìn)而對該性狀進(jìn)

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本文編號：841987