本文關鍵詞：高通量測序分析20株禽流感病毒全基因

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【摘要】：為探索使用高通量測序測定和分析禽流感病毒全基因的方法,使用Ion Torrent PGM測序儀對20株自華東地區(qū)分離的禽流感病毒進行全基因測序,分析該方法的優(yōu)缺點,以及此20株病毒的基因組特性和進化特征。結果顯示,應用Ion Torrent PGM測序儀能夠測出全部20株病毒的全基因,確定其均為H9亞型h9.4.2.5分支的低致病性毒株,NA基因均為N2亞型,并分析了其6個內部基因分子演化關系。說明高通量測序可用于禽流感病毒全基因分析。
【作者單位】： 中國動物衛(wèi)生與流行病學中心;
【關鍵詞】： 高通量測序 禽流感 全基因 分子演化
【基金】：中國動物衛(wèi)生與流行病學中心創(chuàng)新基金(2015IF-0004FF)
【分類號】：S852.65
【正文快照】： 禽流行性感冒病毒(avian influenza virus,AIV)簡稱禽流感病毒,屬于正黏病毒科、甲型流感病毒屬。甲型流感病毒粒子表面有血凝素(hemag-glutinin,HA)和神經氨酸酶(neuraminidase,NA)兩種表面結構蛋白,根據(jù)HA和NA的抗原性差異可分別將其分為18種H亞型(H1~H18)和11種N亞型(N1~N1

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本文編號：802013