牛源A型多殺性巴氏桿菌三聚體自轉(zhuǎn)運蛋白功能研究
本文關鍵詞:牛源A型多殺性巴氏桿菌三聚體自轉(zhuǎn)運蛋白功能研究
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【摘要】:多殺性巴氏桿菌(Pasteurella multocida,Pm)屬于革蘭氏陰性菌,根據(jù)其莢膜抗原不同分為A、B、E、D、F 5種血清型,根據(jù)其菌體抗原不同分為16個血清型。P.Multocida能夠感染多種動物,引起牛出血性敗血癥、牛肺炎、禽霍亂、豬萎縮性鼻炎等,給養(yǎng)殖業(yè)帶來了嚴重的經(jīng)濟損失。細菌感染機體過程中,細菌的定殖和繁殖與其粘附素有著密切關系。近年來研究發(fā)現(xiàn)一種新的非菌毛粘附素-三聚體自轉(zhuǎn)運粘附素(TAAs),被認為是一種重要的毒力因子,它主要由頭部、莖部和錨定部三部分組成,其中頭部和莖部是其主要功能區(qū),參與細菌的粘附、侵襲、生物膜形成,與其自身凝集和抗血清作用也有一定關系;錨定部是TAAs家族特有的結構,具有三聚化作用,可以抑制SDS變性作用。來源于不同細菌TAAs的錨定部序列具有高度同源性,不同的氨基酸個數(shù)決定了TAAs的多樣性。此外TAAs也可以作為研究新型亞單位疫苗的候選靶標。目前國內(nèi)外對TAAs的研究比較少,只對副豬嗜血桿菌和胸膜肺炎放線桿菌的TAAs有相關研究,但是關于巴氏桿菌還未見報道。本實驗室前期通過生物信息學分析得到一個牛源A型多殺性巴氏桿菌的假定三聚體自轉(zhuǎn)運蛋白編碼基因pm1g0001。本實驗將其作為研究對象,通過分子生物學相關技術從理論和試驗方面證明其編碼的pm1g0001蛋白是YadA屬三聚體自轉(zhuǎn)運蛋白;并通過免疫反應原性分析、粘附活性分析、生物膜形成方面來研究該蛋白具有的部分TAAs生物學功能。具體研究結果如下:1、三聚體自轉(zhuǎn)運粘附素編碼基因pm1g0001的生物信息學分析根據(jù)本試驗室建立的牛源A型多殺性巴氏桿菌PmCQ2株基因數(shù)據(jù)庫,利用生物信息學在線分析軟件SignalP-3.0 server、TMHMM Server v.2.0、SMART對假定三聚體自轉(zhuǎn)運粘附素Pm1g0001基因的信號肽、跨膜結構域進行分析;利用三聚體自轉(zhuǎn)運黏附素分析軟件daTAA分析蛋白的黏附基序。結果顯示,該蛋白編碼基因Pm1g0001的1-22aa為信號肽區(qū)域、1-84aa為跨膜域、211-411aa為TAAs部分,其中taas的ylhead頭部基序主要位于n端211-284aa處,莖部主要位于295-341aa,c端錨定部基序主要位于323-411aa處,說明該蛋白含有三聚體典型的頭-莖-錨結構,從理論上證明該假定蛋白是三聚體自轉(zhuǎn)運蛋白家族的成員。利用bcepredserver在線軟件對蛋白pm1g0001的b抗原表位進行線性化的預測;利用bepipred1.0server在線軟件和dnastar軟件包分析蛋白的二級結構、抗原指數(shù)、親水性、可極性等,預測蛋白pm1g0001的b抗原表位,綜合分析表明,pm1g0001的抗原表位主要位于21-315aa。2、三聚體自轉(zhuǎn)運蛋白編碼基因的分段表達及其表達產(chǎn)物western-blot分析生物信息學分析結果發(fā)現(xiàn),三聚體部分主要位于pm1g0001基因編碼蛋白的211-411aa。根據(jù)分析結果,將pm1g0001分為整個pm1g0001基因(pm1g0001)、整個功能區(qū)(頭部和頸部:pm1g0001-1)、錨定部(pm1g0001-2)、整個三聚體部分(pm1g0001-3)、非三聚體部分(pm1g0001-4)、頭部(pm1g0001-5)和莖部(pm1g0001-6)7段,分別設計特異性引物并進行pcr擴增,擴增產(chǎn)物經(jīng)純化后,以pet-30a(+)或pet-32a(+)為載體,轉(zhuǎn)入dh5α感受態(tài)中構建重組質(zhì)粒,再將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)入bl21(de3)感受態(tài)細胞,經(jīng)誘導表達后得到重組蛋白。利用his親和層析柱將7個重組蛋白進行大量純化,并將產(chǎn)物進行western-blot分析。結果發(fā)現(xiàn)7個重組蛋白都具有良好的反應原性;此外,重組蛋白rpm1g0001-2在78kda處有條帶,是單體重組蛋白(26kda)的3倍,說明該蛋白錨定部具有三聚化的作用,由此證明蛋白pm1g0001是三聚體自轉(zhuǎn)運蛋白家族的成員。3、三聚體自轉(zhuǎn)運蛋白pm1g0001的功能研究將純化后的重組蛋白rpm1g0001、rpm1g0001-1~rpm1g0001-6分別與佐劑混合后免疫小鼠,三免后,采集小鼠血液分離血清,采用elisa檢測其抗體效價;同時用6.8×105cfu的pmcq2肌肉注射攻毒小鼠,研究目的蛋白對小鼠的免疫保護效果。結果顯示,免疫組抗體效價范圍在1:51200~1:102400,說明重組蛋白可以刺激小鼠體內(nèi)產(chǎn)生高水平的免疫應答反應;其中重組蛋白rpm1g0001-3的抗體效價明顯高于其余6組,說明三聚體自轉(zhuǎn)運蛋白可以刺激機體產(chǎn)生高滴度的抗體。攻毒保護性試驗結果顯示,重組蛋白rpm1g0001-3的保護效果最好,保護率達到70%,說明三聚體自轉(zhuǎn)運粘附素對巴氏桿菌的感染具有很好的保護作用;重組蛋白rpm1g0001-5和rpm1g0001的保護率達到60%,rpm1g0001-1和rpm1g0001-6的保護率是40%,rpm1g0001-2保護率僅為10%,說明在整個rpm1g0001中起主要作用的是三聚體部分,而在三聚體中起主要作用的是功能區(qū),其中功能區(qū)頭部作用效果好于莖部。將純化后的重組蛋白rPm1g0001-1、rPm1g0001-3、rPm1g0001-5、rPm1g0001-6免疫小鼠,制備多克隆抗體。用制備好的抗體和陰性血清對C57BL/6小鼠巨噬細胞進行預處理后,加入PmCQ2感染4h,洗去未粘附的細菌,經(jīng)洗脫后進行粘附計數(shù),以研究重組蛋白抗體對巴氏桿菌粘附小鼠巨噬細胞的影響。結果表明,四種多克隆抗體都對PmCQ2粘附巨噬細胞有一定的抑制作用,且差異顯著;其中抗-Pm1g0001-3對細菌粘附的抑制效果明顯好于其余三組,說明三聚體自轉(zhuǎn)運蛋白抗體對巴氏桿菌粘附宿主細胞具有一定的抑制作用,其中起主要作用的是功能區(qū)。將PmCQ2(1×108 CFU)加入細胞培養(yǎng)板中分別培養(yǎng)24h、48h、72h,檢測生物膜形成情況,在此基礎上,將制備的多克隆抗體抗-Pm1g0001-1、抗-Pm1g0001-3、抗-Pm1g0001-5、抗-Pm1g0001-6與陰性血清分別對含細菌的細胞培養(yǎng)板進行預處理,并測定各組的吸光值A630,以研究重組蛋白抗體對細菌生物膜形成的影響。結果表明,多殺性巴氏桿菌PmCQ2可以形成細菌生物膜,48h時形成生物膜現(xiàn)象最明顯;經(jīng)抗體預處理的4個實驗組A630極顯著低于對照組,說明4種抗體都能夠抑制細菌生物膜的形成,且在48h時抑制效果最好;48h時,抗-Pm1g0001-1的抑制效果最佳,抗-Pm1g0001-3的抑制效果好于抗-Pm1g0001-5和抗-Pm1g0001-6,抗-Pm1g0001-6的抑制效果好于抗-Pm1g0001-5,說明三聚體自轉(zhuǎn)運蛋白抗體可以抑制細菌生物膜的形成,其中功能區(qū)起主要作用,且功能區(qū)中莖部抑制效果好于頭部。
【關鍵詞】:多殺性巴氏桿菌 TAAs 免疫保護 細胞粘附 生物膜形成
【學位授予單位】:西南大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:S852.61
【目錄】:
- 摘要6-9
- Abstract9-13
- 第1章 文獻綜述13-31
- 1.1 三聚體自轉(zhuǎn)運粘附素的研究進展13-19
- 1.1.1 三聚體自轉(zhuǎn)運粘附素的結構13-15
- 1.1.2 三聚體自轉(zhuǎn)運粘附素的分泌機制15-16
- 1.1.3 三聚體自轉(zhuǎn)運粘附素的分類及功能16-19
- 1.2 多殺性巴氏桿菌的研究進展19-31
- 1.2.1 多殺性巴氏桿菌的概況19-21
- 1.2.2 多殺性巴氏桿菌的主要毒力因子21-25
- 1.2.3 多殺性巴氏桿菌的疫苗研究25-31
- 第2章 引言31-33
- 2.1 研究目的及意義31
- 2.2 研究的主要內(nèi)容31-32
- 2.2.1 三聚體自轉(zhuǎn)運蛋白編碼基因Pm1g0001的生物信息學分析31
- 2.2.2 三聚體自轉(zhuǎn)運粘附素編碼基因的分段表達及其表達產(chǎn)物Western-blot分析31-32
- 2.2.3 三聚體自轉(zhuǎn)運蛋白Pm1g0001的功能研究32
- 2.3 技術路線32-33
- 第3章 三聚體自轉(zhuǎn)運蛋白編碼基因Pm1g0001生物信息學分析33-43
- 3.1 生物信息分析軟件33-34
- 3.1.1 結構域和跨膜結構域預測33
- 3.1.2 信號肽預測33
- 3.1.3 理化性質(zhì)分析33-34
- 3.1.4 抗原表位預測34
- 3.1.5 粘附功能區(qū)預測34
- 3.2 結果34-41
- 3.2.1 結構域和跨膜域預測結果34-35
- 3.2.2 信號肽分析結果35
- 3.2.3 理化性質(zhì)分析35-36
- 3.2.4 抗原表位分析36-41
- 3.2.5 粘附基序分析41
- 3.3 討論41-43
- 第4章 三聚體自轉(zhuǎn)運粘附素編碼基因的分段表達及其表達產(chǎn)物Western-blot分析43-59
- 4.1 材料43-46
- 4.1.1 菌株及質(zhì)粒43
- 4.1.2 主要試劑盒43
- 4.1.3 酶及主要生物試劑43-44
- 4.1.4 主要試劑的配制44-46
- 4.2 方法46-52
- 4.2.1 引物設計與合成46-47
- 4.2.2 模板DNA的提取47
- 4.2.3 目的基因的擴增47-48
- 4.2.4 擴增產(chǎn)物回收純化48
- 4.2.5 重組載體的構建48-50
- 4.2.6 目的基因的原核表達50-51
- 4.2.7 重組蛋白的純化51
- 4.2.8 重組蛋白Western-blot分析51-52
- 4.3 結果52-56
- 4.3.1 目的基因的擴增52
- 4.3.2 重組質(zhì)粒酶切驗證52-53
- 4.3.3 重組蛋白的誘導表達53-54
- 4.3.4 表達蛋白的純化54-55
- 4.3.5 重組蛋白Western-blot分析55-56
- 4.4 討論56-59
- 第5章 三聚體自轉(zhuǎn)運蛋白Pm1g0001的功能研究59-71
- 5.1 材料59-61
- 5.1.1 菌種59
- 5.1.2 試驗動物59
- 5.1.3 試劑59
- 5.1.4 主要化學試劑的配制59-60
- 5.1.5 主要儀器60-61
- 5.2 方法61-63
- 5.2.1 小鼠攻毒保護試驗61-62
- 5.2.2 細胞粘附試驗62
- 5.2.3 生物膜試驗[193]62-63
- 5.3 結果63-68
- 5.3.1 抗體效價檢測63-64
- 5.3.2 小鼠免疫保護性試驗64-66
- 5.3.3 細胞粘附試驗66
- 5.3.4 生物膜形成試驗66-68
- 5.4 討論68-71
- 5.4.1 抗原表位與其免疫反應原性分析68-69
- 5.4.2 Pm1g0001蛋白功能區(qū)分析69-71
- 第6章 結論71-73
- 6.1 三聚體自轉(zhuǎn)運蛋白編碼基因Pm1g0001生物信息學分析71
- 6.2 三聚體自轉(zhuǎn)運蛋白編碼基因的分段表達及其表達產(chǎn)物Western-blot分析71
- 6.3 三聚體自轉(zhuǎn)運蛋白Pm1g0001蛋白功能研究71-73
- 參考文獻73-85
- 附表85-87
- 致謝87
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