本文關鍵詞：云南大額牛瘤胃微生物多樣性分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：為研究云南大額牛瘤胃微生物多樣性,本研究通過對大額牛瘤胃微生物宏基因組測序(總數(shù)據(jù)產(chǎn)出3Gb)、分析、組裝,共獲得13 546 196個環(huán)境基因標簽(EGTs)。在微生物分析時隨機選用了10 387 566個EGTs(占總EGTs的76.68%)與NCBI的NR數(shù)據(jù)庫進行BLAST比對,進行物種注釋。結果顯示,在分析的EGTs中,主要由細菌域、真核生物域、古生菌域及部分不能確定域歸屬的未知微生物構成,其中微生物主要屬于10個門,94%的EGTs屬于擬桿菌門、厚壁菌門、變形桿菌門和放線菌門,擬桿菌門和厚壁菌門豐度最高,分別占總細菌的48%和42%。大額牛瘤胃中主要的纖維降解細菌為黃化瘤胃球菌、溶纖維丁酸弧菌、白色瘤胃球菌和產(chǎn)琥珀酸絲狀桿菌,分別占總細菌的1.60%、1.20%、0.86%和0.52%。本研究結果表明EGTs技術可用于分析環(huán)境微生物群落結構和解釋微生物群落功能,對研究特殊環(huán)境中的微生物的構成具有重要意義。
【作者單位】： 云南農(nóng)業(yè)大學動物營養(yǎng)與飼料科學重點實驗室;
【關鍵詞】： 云南大額牛 宏基因組測序 環(huán)境基因標簽 微生物群落
【基金】：國家自然科學基金(31160467、31360562、31160449、31260543)
【分類號】：S823
【正文快照】： 宏基因組測序分析技術已被證明是一種快速有效的分析環(huán)境微生物群落的方法,目前研究者已經(jīng)成功研究了污水、植物、人類唾液及動物胃腸道等多種環(huán)境中的微生物的多樣性[1-3]。宏基因組學結合高通量測序技術不僅避開了很多微生物不可培養(yǎng)的難題[4],可從基因?qū)用鎭韺φ麄�微生物群

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 李碧鳳;朱雅新;茍瀟;冷靜;毛華明;李清;馮勵;楊舒黎;;云南大額牛瘤胃宏基因組Fosmid文庫的構建與分析[J];中國畜牧獸醫(yī);2013年12期

2 毛華明,鄧衛(wèi)東,文際坤;大額牛的生物學特征及研究開發(fā)利用潛力[J];云南農(nóng)業(yè)大學學報;2005年02期

【共引文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 周熊艷;王松明;顧招兵;吳錫川;冷靜;毛華明;李清;馮勵;楊舒黎;;云南大額牛瘤胃微生物多樣性分析[J];中國畜牧獸醫(yī);2016年05期

2 丁小維;田文婷;張波;楊枝;趙瑩;朱京頡;涂敏;;鹽湖微生物Fosmid文庫纖維素酶克隆的篩選及產(chǎn)酶研究[J];陜西理工學院學報(自然科學版);2016年01期

3 王U，

本文編號：499649