本文關(guān)鍵詞：利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序篩選與鴨青殼性狀形成相關(guān)的基因，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：青殼性狀是鴨(Anas platyrhynchos domesticus)重要的經(jīng)濟(jì)性狀,但其遺傳機(jī)制尚未揭曉。為研究鴨青殼性狀形成的轉(zhuǎn)錄組基礎(chǔ),本研究通過(guò)測(cè)交法選育出基因型為純合青殼以及純合白殼紹興鴨,并對(duì)兩種基因型個(gè)體子宮組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。本研究共獲得288 008 582個(gè)高質(zhì)量數(shù)據(jù),組裝出64 587個(gè)轉(zhuǎn)錄本,其中包括19 589個(gè)新轉(zhuǎn)錄本。鑒定20 302次可變剪切事件,其中外顯子跳躍是最主要的可變剪切類(lèi)型。表達(dá)分析發(fā)現(xiàn)1 768個(gè)基因在兩種基因型個(gè)體間差異表達(dá),其中包括與蛋殼主要色素物質(zhì)(原卟啉、膽綠素及其螯合物)相關(guān)的基因,例如膽綠素還原酶A基因(biliverdin reductase A,BLVRA)、尿卟啉原Ⅲ合酶基因(uroporphyrinogenⅢsynthase,UROS)、血紅蛋白α亞基基因(hemoglobin subunit alpha-1,HBA1)以及血紅素綁定蛋白1基因(heme binding protein 1,HEBP1)等。差異基因的基因本體(Gene Ontology,GO)注釋以及京都基因與基因組百科全書(shū)(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析表明這些基因涉及廣泛的生物功能及通路,其中與蛋殼顏色形成密切相關(guān)的有血紅素代謝功能(例如,血紅素綁定以及四吡咯綁定)及膽汁代謝通路(例如,膽汁酸合成通路,膽汁分泌通路)。本研究首次探索了鴨蛋殼顏色形成的轉(zhuǎn)錄組基礎(chǔ),獲得了一批差異表達(dá)基因,這些基因?yàn)檫M(jìn)一步研究鴨蛋殼顏色形成的遺傳機(jī)制提供了有價(jià)值的信息。
【作者單位】： 浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所;
【關(guān)鍵詞】： 青殼 差異表達(dá)基因 血紅素 膽汁
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.31402065) “十二五”國(guó)家科技支撐計(jì)劃項(xiàng)目(No.2012BAD39B00) 國(guó)家水禽產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系專(zhuān)項(xiàng)(CARS-43-2)
【分類(lèi)號(hào)】：S834
【正文快照】： 禽類(lèi)的蛋殼根據(jù)其顏色主要分為褐殼、青殼、白殼三種,其中褐殼和白殼是兩種主要的蛋殼顏色。蛋殼顏色是衡量蛋品質(zhì)量的指標(biāo)之一,與其他兩種顏色相比目前普遍認(rèn)為青殼蛋蛋殼較厚,蛋殼強(qiáng)度較大,抗太陽(yáng)輻射、氧化以及破損能力較強(qiáng)(袁青妍,盧立志,2007),有利于增加蛋的儲(chǔ)藏時(shí)間以

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  本文關(guān)鍵詞：利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序篩選與鴨青殼性狀形成相關(guān)的基因，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號(hào)：454440