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雞蛋用性狀相關(guān)拷貝數(shù)變異位點(diǎn)篩選及作用機(jī)理研究

發(fā)布時(shí)間:2024-05-27 01:29
  雞作為重要的經(jīng)濟(jì)動(dòng)物,為人類提供雞蛋和雞肉等優(yōu)質(zhì)動(dòng)物性食品。雞的蛋用性狀包括產(chǎn)蛋性能和蛋品質(zhì),屬于數(shù)量性狀,由微效多基因控制。利用SNP芯片的方法進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析(Genome-wide association study,GWS)找到大量與蛋用性狀關(guān)聯(lián)的SNPs;然而一些SNPs在應(yīng)用上并不能維持良好的重復(fù)性,即應(yīng)用到其它群體或世代中重復(fù)不出所期望的效果。近年的研究發(fā)現(xiàn)CNV與SNP對(duì)基因組中遺傳變異的解釋是互補(bǔ)的。CNV屬于結(jié)構(gòu)變異,相比于堿基突變的遺傳效應(yīng),結(jié)構(gòu)變異屬于DNA序列的變異,遺傳效應(yīng)更大,因此CNV作為一種新型的分子標(biāo)記對(duì)蛋雞育種具有重要意義。本研究的目的是在雞基因組中篩選與蛋用性狀相關(guān)的CNVs并進(jìn)一步研究其對(duì)蛋用性狀的影響機(jī)理。根據(jù)雞蛋用性狀相關(guān)數(shù)量性狀基因座(quantitative trait loci,QTLs)與已發(fā)表的CNV圖譜選擇候選CNVs位點(diǎn),然后檢測(cè)其拷貝數(shù)變化,通過(guò)關(guān)聯(lián)分析鑒定影響雞蛋用性狀的CNVs,解釋這些CNVs對(duì)雞產(chǎn)蛋過(guò)程的影響,主要研究結(jié)果如下:(1)結(jié)合已發(fā)表的雞CNV圖譜及雞QTL數(shù)據(jù)庫(kù)選擇候選位點(diǎn),每個(gè)位點(diǎn)設(shè)計(jì)兩個(gè)探針進(jìn)行拷...

【文章頁(yè)數(shù)】:128 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

圖1-1結(jié)構(gòu)變異形成的四種機(jī)制(Bickhart&Liu,2014)

圖1-1結(jié)構(gòu)變異形成的四種機(jī)制(Bickhart&Liu,2014)

1-1結(jié)構(gòu)變異形成的四種機(jī)制(Bickhart&Liu,20rtypesofstructuralvariantionformation(Bickhart傳效應(yīng)及其作用機(jī)制NV主要是通過(guò)影響基因的表達(dá)來(lái)引起機(jī)體表型發(fā)生包含的基因表達(dá)量、通過(guò)順勢(shì)作用元件間接影響....


圖1-3與雞CNV有關(guān)的表型(a)豆冠;(b)蝴蝶冠;(c)V型冠;(d)玫瑰冠;(e)黑褐色(尾呈黑色,胸呈褐色)

圖1-3與雞CNV有關(guān)的表型(a)豆冠;(b)蝴蝶冠;(c)V型冠;(d)玫瑰冠;(e)黑褐色(尾呈黑色,胸呈褐色)

圖1-3與雞CNV有關(guān)的表型(a)豆冠;(b)蝴蝶冠;(c)V型冠;(d)玫瑰冠;(e)黑褐色(尾呈黑色,胸呈褐色型;(f)絲毛烏骨雞。Fig.1-3CNV-relatedphenotypes(a)Peacomb;(b)Buttercupcomb;(c)....


圖1-4MLPA的原理

圖1-4MLPA的原理

圖1-4MLPA的原理DNA變性后,短探針可以與單鏈DNA雜交,只有當(dāng)相鄰的兩個(gè)短探一起,接下來(lái)用于PCR擴(kuò)增(deBoerandWhite,2017)。Fig.1-4TheprincipleofMLPADNAisdenaturized,w....


圖2-1ABI3730XL測(cè)序儀上的原始數(shù)據(jù)示意圖

圖2-1ABI3730XL測(cè)序儀上的原始數(shù)據(jù)示意圖

圖2-1ABI3730XL測(cè)序儀上的原始數(shù)據(jù)示意圖Fig.2-1TherawcurvesfromABI3730XLinstrument



本文編號(hào):3982579

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