西北部分地區(qū)豬蛔蟲(chóng)形態(tài)學(xué)觀(guān)察及其種群遺傳變異分析
本文關(guān)鍵詞:西北部分地區(qū)豬蛔蟲(chóng)形態(tài)學(xué)觀(guān)察及其種群遺傳變異分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:豬蛔蟲(chóng)(Ascaris suum)是寄生在小腸的主要寄生線(xiàn)蟲(chóng)之一,在集約化及散養(yǎng)豬場(chǎng)廣泛存在,呈世界性分布。該寄生蟲(chóng)不僅嚴(yán)重造成豬只的增重及飼料回報(bào)率降低、肉品質(zhì)下降,而且還能引起臨床癥狀和病理?yè)p傷,如乳斑肝、嗜酸性粒細(xì)胞肺炎及免疫抑制等。已有研究表明,豬蛔蟲(chóng)還能夠感染猩猩及人類(lèi)。因此,找到消除豬蛔蟲(chóng)的辦法對(duì)養(yǎng)豬業(yè)及人類(lèi)健康具有重要意義。為了更為有效的防控豬蛔蟲(chóng)病,就必須準(zhǔn)確鑒定豬蛔蟲(chóng)。長(zhǎng)期以來(lái),動(dòng)物寄生蟲(chóng)的分類(lèi)主要是依據(jù)形態(tài)學(xué)特征。但是,有關(guān)豬蛔蟲(chóng)形態(tài)學(xué)的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)以及分子分類(lèi)鑒定資料還不夠完善。本研究擬對(duì)豬蛔蟲(chóng)成蟲(chóng)進(jìn)行剖解并測(cè)量其內(nèi)部器官,利用石蠟包埋切片法制作豬蛔蟲(chóng)各個(gè)部分的組織切片,觀(guān)察其內(nèi)部形態(tài)結(jié)構(gòu),同時(shí)對(duì)豬蛔蟲(chóng)線(xiàn)粒體cox1、nad1和nad4部分基因及核糖體(rDNA)內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)進(jìn)行序列測(cè)定和分析并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),探討西北部分地區(qū)豬蛔蟲(chóng)的遺傳情況。結(jié)果如下:1.對(duì)豬蛔蟲(chóng)體長(zhǎng)、周長(zhǎng)及假體腔內(nèi)主要器官的長(zhǎng)度數(shù)據(jù)進(jìn)行了測(cè)量,發(fā)現(xiàn)雄性豬蛔蟲(chóng)的體長(zhǎng)為18.6±2.3 cm、周長(zhǎng)為1.2±0.2 cm、食管長(zhǎng)度為0.6±0.1 cm、貯精囊長(zhǎng)度為4.9±1.0 cm、輸精管長(zhǎng)度為63.8±16.4 cm、睪丸長(zhǎng)度為42.6±12.3 cm。雌性豬蛔蟲(chóng)的體長(zhǎng)為26.8±2.7 cm、周長(zhǎng)為1.7±0.2 cm、食管長(zhǎng)為0.8±0.1 cm、單側(cè)子宮長(zhǎng)度為17.7±3.4 cm、單側(cè)輸卵管長(zhǎng)度為105.6±19.6 cm、單側(cè)卵巢長(zhǎng)度為59.0±12.2 cm。經(jīng)單因素方差分析后,雄性豬蛔蟲(chóng)與雌性豬蛔蟲(chóng)之間在體長(zhǎng)、周長(zhǎng)及食管長(zhǎng)存在顯著差異(P0.01)。并且通過(guò)制作組織切片,經(jīng)HE染色后在光學(xué)顯微鏡下觀(guān)察,獲得了豬蛔蟲(chóng)較為完整的組織結(jié)構(gòu)圖。2.采用引物NC5/NC2,擴(kuò)增西北部分地區(qū)23條豬蛔蟲(chóng)的ITS基因,對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行克隆、測(cè)序,依據(jù)GenBank上公布的ITS序列將測(cè)序結(jié)果截為ITS1、5.8S及ITS2三段,分析比對(duì)各段序列的差異性。結(jié)果顯示,所有樣品ITS序列長(zhǎng)約1000 bp,其中ITS1、5.8S和ITS2的長(zhǎng)度分別為450 bp~453 bp、159 bp、272 bp,種內(nèi)差異分別為0~0.2%、0、0;贗TS1的種系發(fā)育分析表明,23個(gè)豬蛔蟲(chóng)樣品均位于同一分支,而與貝屬蛔蟲(chóng)分屬兩個(gè)不同分支。結(jié)果表明,ITS1序列不能作為區(qū)分西北不同地區(qū)豬蛔蟲(chóng)的種內(nèi)分子標(biāo)記,但可以作為區(qū)分蛔屬蛔蟲(chóng)與貝蛔屬蛔蟲(chóng)的種間分子標(biāo)記。3.以西北部分地區(qū)24個(gè)豬蛔蟲(chóng)樣品為研究對(duì)象,分別擴(kuò)增nad1、cox1和、nad4部分基因并進(jìn)行序列變異分析,成功擴(kuò)增出了豬蛔蟲(chóng)的pnad1,pcox1和pnad4基因,其長(zhǎng)度分別為480 bp、787 bp和811 bp,基因的A+T含量分別為69.69%~71.12%、65.54%~65.96%和68.46%~69.29%,其種內(nèi)變異分別為0~2.9%、0~2.1%和0~3.1%;趐nad1、pcox1和pnad4序列的種系發(fā)育分析表明,中國(guó)西北地區(qū)豬蛔蟲(chóng)與美國(guó)豬蛔蟲(chóng)是兩個(gè)不同的地理株,該基因可以作為區(qū)分中國(guó)西北地區(qū)豬蛔蟲(chóng)與美國(guó)地區(qū)豬蛔蟲(chóng)的分子標(biāo)記,但不能作為區(qū)分西北部分地區(qū)之間豬蛔蟲(chóng)樣品的分子標(biāo)記。綜上所述,本研究完善了豬蛔蟲(chóng)的形態(tài)學(xué)數(shù)據(jù),并基于ITS及線(xiàn)粒體部分基因(nad1、cox1、nad4)研究了西北部分地區(qū)豬蛔蟲(chóng)種群變異情況,為豬蛔蟲(chóng)的流行病學(xué)調(diào)查及豬蛔蟲(chóng)的鑒定分類(lèi)提供了基礎(chǔ)資料。
【關(guān)鍵詞】:豬蛔蟲(chóng) 形態(tài)學(xué) 內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū) 線(xiàn)粒體基因 種群變異
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類(lèi)號(hào)】:S852.7
【目錄】:
- 摘要5-7
- ABSTRACT7-11
- 文獻(xiàn)綜述11-19
- 第一章 豬蛔蟲(chóng)研究概況11-19
- 1.1 豬蛔蟲(chóng)11-13
- 1.1.1 分類(lèi)地位、寄生部位、宿主及分布11-12
- 1.1.2 形態(tài)學(xué)與生活史12-13
- 1.2 豬蛔蟲(chóng)病13-15
- 1.2.1 流行病學(xué)特點(diǎn)、臨床癥狀及危害13-14
- 1.2.2 豬蛔蟲(chóng)病的診斷14
- 1.2.3 豬蛔蟲(chóng)病的預(yù)防及治療14-15
- 1.3 PCR技術(shù)及其在寄生蟲(chóng)研究中的應(yīng)用15-16
- 1.4 分子標(biāo)記在寄生蟲(chóng)種群遺傳結(jié)構(gòu)研究中的應(yīng)用16-18
- 1.4.1 ITS簡(jiǎn)介及其在寄生蟲(chóng)分類(lèi)中的研究進(jìn)展16-17
- 1.4.2 線(xiàn)粒體DNA簡(jiǎn)介及其在寄生蟲(chóng)分類(lèi)中的研究17-18
- 1.5 本研究的目的和意義18-19
- 實(shí)驗(yàn)研究19-44
- 第二章 豬蛔蟲(chóng)形態(tài)學(xué)觀(guān)察及其解剖學(xué)測(cè)量19-27
- 2.1 材料與方法19-21
- 2.1.1 蟲(chóng)體樣本19
- 2.1.2 主要儀器、試劑和溶液19-20
- 2.1.3 蟲(chóng)體解剖并測(cè)量20
- 2.1.4 蟲(chóng)體石蠟切片的制備20-21
- 2.1.5 蟲(chóng)體石蠟切片的HE染色與觀(guān)察21
- 2.2 結(jié)果21-25
- 2.2.1 解剖測(cè)量結(jié)果21-23
- 2.2.2 HE染色觀(guān)察結(jié)果23-25
- 2.3 討論25-26
- 2.4 小結(jié)26-27
- 第三章 西北部分地區(qū)豬蛔蟲(chóng)ITS基因的遺傳變異分析27-37
- 3.1 材料與方法27-32
- 3.1.1 蟲(chóng)體樣本27-28
- 3.1.2 主要儀器設(shè)備和試劑28-29
- 3.1.3 引物的合成與稀釋29
- 3.1.4 蟲(chóng)體基因組DNA的提取29-30
- 3.1.5 核糖體rDNA ITS基因擴(kuò)增30-31
- 3.1.6 ITS基因的純化、克隆、轉(zhuǎn)化鑒定及測(cè)序31-32
- 3.1.7 ITS基因的序列分析及遺傳變異分析32
- 3.2 結(jié)果32-35
- 3.2.1 PCR擴(kuò)增結(jié)果32-33
- 3.2.2 遺傳變異分析33-34
- 3.2.3 種群遺傳結(jié)構(gòu)分析34-35
- 3.3 討論35-36
- 3.4 小結(jié)36-37
- 第四章 西北部分地區(qū)豬蛔蟲(chóng)nad1、cox1和nad4基因的遺傳變異分析37-44
- 4.1 材料與方法37-40
- 4.1.1 蟲(chóng)體樣本37-38
- 4.1.2 主要儀器設(shè)備和試劑38
- 4.1.3 引物的合成及稀釋38-39
- 4.1.4 蟲(chóng)體基因組DNA的提取39
- 4.1.5 PCR反應(yīng)及測(cè)序39
- 4.1.6 序列分析及進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建39-40
- 4.2 結(jié)果40-43
- 4.2.1 PCR擴(kuò)增結(jié)果40-41
- 4.2.2 序列變異分析41-42
- 4.2.3 種群遺傳結(jié)構(gòu)分析42-43
- 4.3 討論43
- 4.4 小結(jié)43-44
- 結(jié)論44-45
- 參考文獻(xiàn)45-53
- 致謝53-54
- 作者簡(jiǎn)介54
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,本文編號(hào):391170
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