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馬鹿阿拉善亞種遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)

發(fā)布時(shí)間:2024-01-27 10:28
  馬鹿阿拉善亞種(Cervus elaphus alashanicus)又稱阿拉善馬鹿,目前僅分布于賀蘭山地區(qū),是我國(guó)馬鹿亞種分布范圍最狹窄的一個(gè)隔離種群。為了解阿拉善馬鹿的種群遺傳多樣性及遺傳變異情況,以對(duì)該種群的保護(hù)提供科學(xué)參考,對(duì)在賀蘭山采集的93個(gè)野生個(gè)體新鮮糞便樣本的線粒體控制區(qū)部分序列(991 bp)進(jìn)行擴(kuò)增和分析,共檢測(cè)到68個(gè)變異位點(diǎn),定義16種單倍型,平均單倍型多樣性為0.405,平均核苷酸多樣性為0.002 32,說(shuō)明種群遺傳多樣性水平較低。中性檢驗(yàn)和錯(cuò)配分布分析表明阿拉善馬鹿曾出現(xiàn)過(guò)種群擴(kuò)張,貝葉斯天際線分析(BSP)顯示擴(kuò)張時(shí)間約在末次冰盛期(0.028—0.010 Ma)。FST檢驗(yàn)表明阿拉善馬鹿種群內(nèi)存在顯著遺傳分化,系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)和單倍型網(wǎng)絡(luò)圖分析表明群體間沒(méi)有明顯的系統(tǒng)地理格局。本研究表明阿拉善馬鹿目前種群遺傳多樣性較低,建議加大對(duì)該亞種的關(guān)注和保護(hù)力度。

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圖1賀蘭山地區(qū)阿拉善馬鹿樣品采集位點(diǎn)

圖1賀蘭山地區(qū)阿拉善馬鹿樣品采集位點(diǎn)


圖2基于D-loop序列構(gòu)建的阿拉善馬鹿系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù).

圖2基于D-loop序列構(gòu)建的阿拉善馬鹿系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù).


圖3基于D-loop序列構(gòu)建的阿拉善馬鹿單倍型網(wǎng)絡(luò)圖.

圖3基于D-loop序列構(gòu)建的阿拉善馬鹿單倍型網(wǎng)絡(luò)圖.


圖4基于D-loop序列的阿拉善馬鹿種群的錯(cuò)配分布圖

圖4基于D-loop序列的阿拉善馬鹿種群的錯(cuò)配分布圖



本文編號(hào):3886794

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