鴨綠殼蛋表型與候選基因族及主選SLCO2B1基因關(guān)聯(lián)功效研究
發(fā)布時間:2024-01-24 14:04
家禽蛋殼顏色作為現(xiàn)代家禽育種的重要性狀之一廣受業(yè)界關(guān)注。試驗以鴨綠殼蛋為研究素材,利用轉(zhuǎn)錄組學和候選基因研究兩種技術(shù)手段分析鴨蛋的綠殼表型關(guān)鍵基因突變,為闡明鴨蛋綠殼表型形成的分子機理提供依據(jù)。試驗一鴨綠殼蛋表型調(diào)控候選基因與功能分析試驗分別從35周齡的2個金定鴨種群中,每個群隨機選取3只產(chǎn)綠殼蛋和3只產(chǎn)白殼蛋的鴨,共12只,利用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)對蛋殼腺組織進行轉(zhuǎn)錄組測序分析。結(jié)果表明:(1)轉(zhuǎn)錄組測序共得到41000000個有效reads,其中55.9%的reads能夠匹配到鴨參考基因組,并且組裝成31542個轉(zhuǎn)錄本,平均長度為1839±86 bp。(2)綠殼表型候選基因共464個,其中230個基因在綠殼蛋性狀形成中表達下調(diào),234個基因表達上調(diào)。(3)候選基因中,有359個基因被富集到1515條生物學過程,363個基因注釋到250條細胞組分,339個基因注釋到469條分子功能GO富集條目中;蜻^度表達分析表明,其中9條生物學過程、6條細胞組分和1條分子功能條目顯著過度表達(P<0.05)。(4)候選基因中,有13個Ca2+,10個Na+,8個K+,5個H+,1個Cl-轉(zhuǎn)運蛋白...
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學位級別】:碩士
本文編號:3883944
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圖1-1血紅素代謝通路(Bonkovskyetal.2013)
圖1-2OATP基因家族系統(tǒng)進化樹
圖1-3人OATP1B1基因跨膜結(jié)構(gòu)域(HagenbuchandGui2008)
圖2-112個轉(zhuǎn)錄本平均測序深度分布情況
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