發(fā)布時(shí)間：2024-01-24 13:55

　　旨在探究基因Ⅰ型和Ⅲ型日本腦炎病毒(Japanese encephalitis virus, JEV)感染細(xì)胞產(chǎn)生的黃病毒亞基因組RNA(subgenomic flaviviral RNA, sfRNA)亞型與演化趨勢(shì)。應(yīng)用高分辨率Northern blot檢測(cè)Ⅰ型和Ⅲ型JEV感染細(xì)胞產(chǎn)生sfRNA亞型特征;對(duì)美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心(NCBI)收錄的99條JEV sfRNA序列通過(guò)Mega X軟件進(jìn)行多序列比對(duì)及遺傳演化分析,用Megalign軟件進(jìn)行核苷酸相似性比較及變異分析。結(jié)果表明:Ⅰ型和Ⅲ型JEV感染細(xì)胞產(chǎn)生特征相似的4種亞型sfRNA;JEV sfRNA序列10 440、10 673、10 853位核苷酸差異具有基因型特異性(位點(diǎn)說(shuō)明以JEV HEN0701為例,GenBank:FJ495189.1);Ⅰ型10 477位核苷酸的變化相較于Ⅲ型更有利于sfRNA PK1結(jié)構(gòu)的堿基配對(duì);Ⅰ型和Ⅲ型sfRNA組間核苷酸序列相似性為79.2%～100%,Ⅰ型sfRNA組內(nèi)核苷酸序列相似性為81.6%～100%,Ⅲ型sfRNA組內(nèi)核苷酸序列相似性為85.6%～100%;Ⅰ型和Ⅲ型sf...

【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 細(xì)胞與毒株
    1.2 主要試劑
    1.3 Northern blot檢測(cè)JEV sfRNA亞型
    1.4 RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
    1.5 JEV基因序列來(lái)源
    1.6 統(tǒng)計(jì)與分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 JEV sfRNA亞型特征
    2.2 JEV sfRNA基因結(jié)構(gòu)
    2.3 JEV sfRNA序列比對(duì)
    2.4 JEV sfRNA核苷酸相似性統(tǒng)計(jì)與變異趨勢(shì)分析
    2.5 JEV sfRNA系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)的構(gòu)建
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