旨在探究安格斯牛生長相關(guān)的受選擇基因,為肉牛生長相關(guān)主效基因的鑒定提供參考。本試驗共采集72頭南陽牛母牛和14頭黑安格斯牛母牛血樣并提取基因組DNA。利用SLAF-seq(specific-locus amplified fragment sequencing)技術(shù)獲得全基因組SNP標(biāo)記并對試驗個體基因型進行分型。通過計算各SNP位點的遺傳分化系數(shù)(Fst值)和核苷酸多態(tài)性(πratio)篩選兩品種間的差異基因組區(qū)域,并與動物QTL數(shù)據(jù)庫中牛生長性狀QTLs進行比對,重合區(qū)域作為候選區(qū)域。隨后對候選區(qū)域內(nèi)基因進行功能注釋以篩選候選基因,并根據(jù)"Expression Atlas"數(shù)據(jù)庫對候選基因的組織表達情況進行分析。經(jīng)篩選后,本試驗共得到69 762個SNPs,以Fst值和πratio值的99%分位數(shù)為閾值篩選得到33個兩品種間高度差異的基因組區(qū)域,其中16個基因組區(qū)域與生長性狀相關(guān)QTLs重合。這些區(qū)域共包含27個基因,其中4個基因(FXR1、ADAR、IGF1和MNF1)與骨生長、肌肉發(fā)育和生長調(diào)控有關(guān)。FXR1和MNF1均在骨骼肌組織中高表達,ADAR和IGF1分別在腦組織和肝臟...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗材料
    1.2 DNA提取
    1.3 簡化基因組測序
    1.4 選擇性清除分析
    1.5 候選基因篩選
2 結(jié) 果
    2.1 �；蚪MSNP標(biāo)記的開發(fā)與篩選
    2.2 兩品種牛的選擇性清除分析
    2.3 牛生長形狀相關(guān)候選基因篩選
3 討 論
4 結(jié) 論



本文編號：3876008