試驗旨在利用全基因組關聯(lián)分析(GWAS)定位影響鴨胸肌肉色性狀的候選基因及分子標記,探究肉色性狀的遺傳基礎。本研究中,共測定了555只北京鴨×野鴨F2代資源群體的3種胸肌肉色性狀(包括紅度a^*、黃度b^*、亮度L^*)。利用北京鴨×野鴨F2代資源群體胸肌肉色性狀數(shù)據(jù)并結(jié)合全基因組重測序數(shù)據(jù)進行全基因組關聯(lián)分析,檢測影響胸肌肉色性狀的相關基因及可能的因果變異位點。結(jié)果顯示,肌肉亮度L^*、紅度a^*、黃度b^*均屬于低遺傳力性狀,遺傳力分別為0.23、0.12、0.13,且肌肉黃度b^*變異系數(shù)較大(26.18%)。通過相關性分析可知,肌肉黃度與紅度存在較強正表型相關(r=0.52),肌纖維直徑與肌肉黃度存在弱負相關性(r=-0.16)。利用混合線性模型進行GWAS,發(fā)現(xiàn)了1個SNP與肌肉黃度b^*潛在顯著關聯(lián)(-log₁₀P=8.28)。對最高效應SNP進行連鎖不平衡檢驗,發(fā)現(xiàn)42個SNPs與最高點SNP...

【文章頁數(shù)】：8 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗動物及表型采集
    1.2 DNA、RNA提取及質(zhì)控
        1.2.1 DNA提取及質(zhì)控
        1.2.2 RNA提取及質(zhì)控
    1.3 統(tǒng)計分析
        1.3.1 相關性分析和基因表達熱圖
        1.3.2 遺傳力計算
        1.3.3 GWAS分析
        1.3.4 表達量分析
2 結(jié) 果
    2.1 表型值統(tǒng)計及遺傳力計算
    2.2 相關性分析
    2.3 GWAS分析
    2.4 候選基因分析
3 討 論
4 結(jié) 論



本文編號：3863788