家兔PPARγ和MYF5基因多態(tài)性及其與部分經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)研究
發(fā)布時(shí)間:2023-05-06 23:43
過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體γ (peroxisome proliferator-activatived receptors, PPARγ)在脂肪細(xì)胞分化、脂肪代謝、胰島素敏感性、糖代謝和能量平衡等過(guò)程中起重要的調(diào)節(jié)作用;而生肌因子5(myogenic factor 5, MYF5)調(diào)節(jié)肌肉定型、增殖、分化及生后肌肉生長(zhǎng)。本試驗(yàn)采用直接測(cè)序方法檢測(cè)PPARy和MYF5 2個(gè)基因編碼區(qū)的變異位點(diǎn),并用飛行質(zhì)譜分型技術(shù)對(duì)235只家兔(伊拉兔93只,香檳兔81只,天府黑兔61只)候選SNPs進(jìn)行基因分型,篩選出對(duì)經(jīng)濟(jì)性狀具有遺傳效應(yīng)的SNPs,然后用271只新西蘭兔擴(kuò)大樣本驗(yàn)證關(guān)聯(lián)性,最后通過(guò)定量進(jìn)一步研究PPARy基因的作用機(jī)制,以期篩選出可用于家兔分子育種的遺傳標(biāo)記。試驗(yàn)結(jié)果如下:1.通過(guò)直接測(cè)序在家兔PPARy基因編碼區(qū)檢測(cè)到1個(gè)同義突變(c.207A>C);在MYF5基因編碼區(qū)檢測(cè)到2個(gè)同義突變(c.708C>T、c.66G>A)和1個(gè)非同義突變(c.571T>C),c.571T>C導(dǎo)致氨基酸由絲氨酸變?yōu)楦彼;而c.708C>T位點(diǎn)的|ΔRSCU|...
【文章頁(yè)數(shù)】:69 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 國(guó)內(nèi)外兔業(yè)的發(fā)展現(xiàn)狀
1.2 家兔生長(zhǎng)發(fā)育特點(diǎn)及兔肉的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值
1.3 影響家兔生長(zhǎng)和兔肉質(zhì)量的因素
1.4 PPARγ基因研究進(jìn)展
1.4.1 PPAR家族
1.4.2 PPARγ基因簡(jiǎn)介
1.4.3 PPARγ生物學(xué)功能
1.4.4 PPARγ基因在畜禽中的研究進(jìn)展
1.5 MYF5基因研究進(jìn)展
1.5.1 MYOD基因家族
1.5.2 MYF5基因簡(jiǎn)介
1.5.3 MYF5生物學(xué)功能
1.5.4 MYF5基因在畜禽中的研究進(jìn)展
1.6 Sequenom MassARRAYTMSNP基因分型
1.7 候選基因法在育種中的應(yīng)用
1.8 試驗(yàn)研究目的和主要內(nèi)容
1.8.1 試驗(yàn)?zāi)康?br> 1.8.2 試驗(yàn)主要內(nèi)容
1.8.3 試驗(yàn)技術(shù)方案流程
2 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
2.1.2 耳組織及肝組織采集
2.2 主要試劑與儀器
2.2.1 主要試劑及試劑配制
2.2.2 主要儀器
2.3 試驗(yàn)方法
2.3.1 生長(zhǎng)性狀測(cè)定
2.3.2 全基因組DNA提取及檢測(cè)
2.3.3 肝組織總RNA提取及檢測(cè)
2.3.4 cDNA的合成
2.3.5 目的基因擴(kuò)增
2.3.6 Sequenom MassARRAYTMSNP基因分型
2.3.7 PCR-RFLP基因分型
2.3.8 熒光定量
2.3.9 數(shù)據(jù)處理
3 試驗(yàn)結(jié)果
3.1 全基因組DNA提取以及肝臟組織總RNA提取結(jié)果
3.2 變異位點(diǎn)檢測(cè)
3.3 候選SNP篩選
3.4 質(zhì)譜分型結(jié)果
3.5 酶切分型結(jié)果
3.6 遺傳結(jié)構(gòu)分析結(jié)果
C位點(diǎn)基因型和等位基因頻率"> 3.6.1 PPARγ c.207A>C位點(diǎn)基因型和等位基因頻率
C位點(diǎn)基因型和等位基因頻率"> 3.6.2 MYF5 c.571T>C位點(diǎn)基因型和等位基因頻率
T位點(diǎn)基因型和等位基因頻率"> 3.6.3 MYF5 c.708C>T位點(diǎn)基因型和等位基因頻率
3.7 關(guān)聯(lián)性分析結(jié)果
C與家兔經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)分析"> 3.7.1 PPARγ c.207A>C與家兔經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
C與家兔經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)分析"> 3.7.2 MYF5 c.571T>C與家兔經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
T與家兔經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)分析"> 3.7.3 MYF5 c.708C>T與家兔經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
C位點(diǎn)不同基因型PPARγ基因mRNA相對(duì)表達(dá)量"> 3.8 不同日齡階段和PPARγc.207A>C位點(diǎn)不同基因型PPARγ基因mRNA相對(duì)表達(dá)量
3.8.1 標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)繪制和熔解曲線(xiàn)獲得
3.8.2 不同日齡階段PPARγ基因mRNA表達(dá)量差異
C位點(diǎn)不同基因型mRNA表達(dá)量差異"> 3.8.3 PPARγ c.207A>C位點(diǎn)不同基因型mRNA表達(dá)量差異
4 討論
4.1 候選基因選擇
4.2 基因多態(tài)性與家兔經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)
4.2.1 PPARγ基因多態(tài)性與家兔經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)
4.2.2 MYF5基因多態(tài)性與家兔經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)
4.3 PPARγ基因mRNA表達(dá)量的變化
5 結(jié)論
6 展望
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀碩士期間發(fā)表文章情況
本文編號(hào):3809826
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摘要
Abstract
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 國(guó)內(nèi)外兔業(yè)的發(fā)展現(xiàn)狀
1.2 家兔生長(zhǎng)發(fā)育特點(diǎn)及兔肉的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值
1.3 影響家兔生長(zhǎng)和兔肉質(zhì)量的因素
1.4 PPARγ基因研究進(jìn)展
1.4.1 PPAR家族
1.4.2 PPARγ基因簡(jiǎn)介
1.4.3 PPARγ生物學(xué)功能
1.4.4 PPARγ基因在畜禽中的研究進(jìn)展
1.5 MYF5基因研究進(jìn)展
1.5.1 MYOD基因家族
1.5.2 MYF5基因簡(jiǎn)介
1.5.3 MYF5生物學(xué)功能
1.5.4 MYF5基因在畜禽中的研究進(jìn)展
1.6 Sequenom MassARRAYTMSNP基因分型
1.7 候選基因法在育種中的應(yīng)用
1.8 試驗(yàn)研究目的和主要內(nèi)容
1.8.1 試驗(yàn)?zāi)康?br> 1.8.2 試驗(yàn)主要內(nèi)容
1.8.3 試驗(yàn)技術(shù)方案流程
2 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
2.1.2 耳組織及肝組織采集
2.2 主要試劑與儀器
2.2.1 主要試劑及試劑配制
2.2.2 主要儀器
2.3 試驗(yàn)方法
2.3.1 生長(zhǎng)性狀測(cè)定
2.3.2 全基因組DNA提取及檢測(cè)
2.3.3 肝組織總RNA提取及檢測(cè)
2.3.4 cDNA的合成
2.3.5 目的基因擴(kuò)增
2.3.6 Sequenom MassARRAYTMSNP基因分型
2.3.7 PCR-RFLP基因分型
2.3.8 熒光定量
2.3.9 數(shù)據(jù)處理
3 試驗(yàn)結(jié)果
3.1 全基因組DNA提取以及肝臟組織總RNA提取結(jié)果
3.2 變異位點(diǎn)檢測(cè)
3.3 候選SNP篩選
3.4 質(zhì)譜分型結(jié)果
3.5 酶切分型結(jié)果
3.6 遺傳結(jié)構(gòu)分析結(jié)果
C位點(diǎn)基因型和等位基因頻率"> 3.6.1 PPARγ c.207A>C位點(diǎn)基因型和等位基因頻率
C位點(diǎn)基因型和等位基因頻率"> 3.6.2 MYF5 c.571T>C位點(diǎn)基因型和等位基因頻率
T位點(diǎn)基因型和等位基因頻率"> 3.6.3 MYF5 c.708C>T位點(diǎn)基因型和等位基因頻率
3.7 關(guān)聯(lián)性分析結(jié)果
C與家兔經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)分析"> 3.7.1 PPARγ c.207A>C與家兔經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
C與家兔經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)分析"> 3.7.2 MYF5 c.571T>C與家兔經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
T與家兔經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)分析"> 3.7.3 MYF5 c.708C>T與家兔經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
C位點(diǎn)不同基因型PPARγ基因mRNA相對(duì)表達(dá)量"> 3.8 不同日齡階段和PPARγc.207A>C位點(diǎn)不同基因型PPARγ基因mRNA相對(duì)表達(dá)量
3.8.1 標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)繪制和熔解曲線(xiàn)獲得
3.8.2 不同日齡階段PPARγ基因mRNA表達(dá)量差異
C位點(diǎn)不同基因型mRNA表達(dá)量差異"> 3.8.3 PPARγ c.207A>C位點(diǎn)不同基因型mRNA表達(dá)量差異
4 討論
4.1 候選基因選擇
4.2 基因多態(tài)性與家兔經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)
4.2.1 PPARγ基因多態(tài)性與家兔經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)
4.2.2 MYF5基因多態(tài)性與家兔經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)
4.3 PPARγ基因mRNA表達(dá)量的變化
5 結(jié)論
6 展望
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀碩士期間發(fā)表文章情況
本文編號(hào):3809826
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