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我國綿羊癢螨(兔亞種)線粒體12S、16S和ATP6基因全序列的遺傳多樣性分析

發(fā)布時間:2023-05-03 19:30
  兔的癢螨病是由綿羊癢螨(兔亞種)寄生于外耳道皮膚的表面,引起兔消瘦,耳內(nèi)充滿紙卷樣痂皮為典型特征的一種慢性接觸性皮膚傳染病,給養(yǎng)兔業(yè)造成巨大的經(jīng)濟損失。線粒體基因因進化速度快,遺傳穩(wěn)定性好等特點常被用做分子標記,可以進行物種的分子鑒定和種群遺傳等研究。目前有關(guān)綿羊癢螨的線粒體基因種群遺傳的研究較少。因此,本研究采用PCR技術(shù)擴增我國五個地區(qū)(華東、華中、華北、西北、西南)不同品種兔(獺兔和肉兔)癢螨蟲株的線粒體12S、16S、ATP6基因全序列,并比較分析種群遺傳變異情況,以揭示我國綿羊癢螨(兔亞種)蟲株的遺傳結(jié)構(gòu)特征,評估癢螨種群對環(huán)境的適應能力。主要研究結(jié)果如下:1.基于線粒體12S和16S基因全序列對我國綿羊癢螨(兔亞種)種群遺傳多樣性的研究為了解我國癢螨種群的遺傳多樣性特點,本研究采用PCR技術(shù)對我國5個地區(qū)(華東、華中、華北、西北、西南)的綿羊癢螨(兔亞種)單個蟲體的線粒體12S和16S基因全序列進行擴增、測序,并基于12S、16S和聯(lián)合12S+16S基因序列分析癢螨種群的遺傳多樣性。共得到89條12S序列(657bp),83條16S序列(1025bp)和63條12S+16S...

【文章頁數(shù)】:59 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一部分 文獻綜述
    1 線粒體基因在動物寄生性蜱螨中的研究進展
        1.1 線粒體基因的組成及特點
        1.2 線粒體基因在動物寄生性蜱螨中的應用
            1.2.1 線粒體16SrRNA、12SrRNA基因及應用
            1.2.2 線粒體COI、COII基因及應用
            1.2.3 線粒體Cytb基因及應用
            1.2.4 線粒體其他基因
    2 研究目的與意義
第二部分 研究內(nèi)容
    第一章 基于線粒體基因12S和16S基因全序列分析綿羊癢螨(兔亞種)的遺傳多樣性
        1 試驗材料和方法
            1.1 試驗材料
                1.1.1 樣品來源
                1.1.2 試驗試劑
                1.1.3 培養(yǎng)基和緩沖液的配制
                1.1.4 主要儀器設備
            1.2 試驗方法
                1.2.1 癢螨的處理
                1.2.2 單個螨蟲基因組DNA的提取
                1.2.3 引物設計
                1.2.5 T-載體克隆與鑒定
                1.2.6 數(shù)據(jù)的處理與分析
        2 試驗結(jié)果
            2.1 序列組成和單倍型分布
            2.2 種群遺傳多樣性
            2.3 種群遺傳距離與核苷酸分歧度
            2.4 種群分化和遺傳結(jié)構(gòu)
            2.5 種群歷史動態(tài)分析
            2.6 系統(tǒng)發(fā)育樹與單倍型網(wǎng)絡圖分析
        3 討論
    第二章 基于線粒體ATP6基因全序列對綿羊癢螨(兔亞種)種群遺傳多樣性的研究
        1 試驗材料和方法
            1.1 試驗材料
                1.1.1 樣品來源
                1.1.2 試驗試劑
                1.1.3 培養(yǎng)基和常用溶液的配制
                1.1.4 主要儀器設備
            1.2 試驗方法
                1.2.1 癢螨的處理
                1.2.2 單個螨蟲基因組DNA的提取
                1.2.3 引物設計
                1.2.4 PCR擴增與產(chǎn)物純化回收
                1.2.5 T-載體克隆與鑒定
        2 試驗結(jié)果
            2.1 序列組成和單倍型分布
            2.2 種群遺傳多樣性
            2.3 種群遺傳距離與核苷酸分歧度
            2.4 種群分化和遺傳結(jié)構(gòu)
            2.5 種群歷史動態(tài)分析
            2.6 系統(tǒng)發(fā)育樹與單倍型網(wǎng)絡圖分析
        3 討論
第三部分 結(jié)論與創(chuàng)新點
    1.結(jié)論
    2.創(chuàng)新點
參考文獻
致謝
作者簡歷



本文編號:3807145

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