初產母豬斷奶后能否正常發(fā)情對養(yǎng)豬生產影響重大,也是初產母豬被淘汰的主要原因。本研究以乏情和發(fā)情初產母豬為研究對象,首次利用RNA-seq技術對其下丘腦-垂體-卵巢軸中的基因間長鏈非編碼RNAs(long intergenic noncoding RNAs, lincRNAs)進行篩選比較,得到lincRNAs的表達圖譜,并對其特征和功能進行了初步分析。結果顯示,在乏情和發(fā)情初產母豬下丘腦–垂體–卵巢軸中鑒定得到3519個lincRNAs,以發(fā)情組為對照共有17個lincRNAs存在差異表達,其中12個表達上調,5個表達下調(FC≥2, P<0.05)。選擇4個差異表達的lincRNAs經qRT-PCR驗證,其表達水平與測序結果基本一致。對這17個差異表達的lincRNAs進行GO分析、KEGG通路分析及l(fā)incRNA-mRNA共表達網絡分析,發(fā)現(xiàn)這些lincRNAs主要與豬卵母細胞減數(shù)分裂成熟、卵巢細胞分化及顆粒細胞凋亡等生殖活動相關。本研究結果豐富了豬lincRNAs數(shù)據資源,為進一步深入研究初產母豬的生殖機能提供了理論依據。

【文章頁數(shù)】：15 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 實驗動物和樣品制備
    1.2 樣品總RNA提取
    1.3 cDNA文庫構建和RNA-seq
    1.4 序列比對和轉錄本構建
    1.5 lincRNAs鑒定
    1.6 差異表達的linc RNAs和差異表達的m RNAs篩選
    1.7 lincRNAs功能預測
    1.8 lincRNA-mRNA共表達網絡分析
    1.9 差異表達lincRNAs qRT-PCR驗證
2 結果與分析
    2.1 轉錄本組裝及l(fā)incRNAs鑒定
    2.2 lincRNAs結構特征分析
    2.3 差異表達lincRNAs和差異表達mRNAs的表達譜
    2.4 差異表達lincRNAs驗證
    2.5 GO富集和KEGG通路分析
    2.6 lincRNA-mRNA共表達網絡分析
3 討論



本文編號：3802451