旨在克隆山羊載脂蛋白E（Apolipoprotein E,APOE）基因序列并進行生物信息學(xué)分析,明確APOE基因在山羊各組織及分化前后脂肪細胞中的表達模式,利用RT-PCR及3′RACE方法克隆山羊APOE基因序列,利用實時熒光定量PCR（Real-time quantitative PCR,qPCR）方法檢測該基因在山羊心、肝、脾、肺、腎、肌肉、脂肪等13個組織中的表達水平以及在皮下前體脂肪細胞成脂分化過程中的表達變化情況。結(jié)果表明,RT-PCR方法獲得山羊APOE基因序列970 bp,其中ORF 951 bp,5′UTR 7 bp,3′UTR 12 bp（GenBank登錄號:MN049956）;3′RACE法獲得3′UTR 152 bp（登錄號:MN049957）;Targetscan和Mirbase預(yù)測得知miR-22-3p可能靶標(biāo)山羊APOE基因;蛋白預(yù)測顯示山羊APOE編碼316個氨基酸,是一個具有信號肽、無跨膜結(jié)構(gòu)域的不穩(wěn)定酸性蛋白;亞細胞定位結(jié)果發(fā)現(xiàn)APOE在細胞外、細胞質(zhì)、液泡、細胞核以及內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中均發(fā)揮生物學(xué)作用;進化樹顯示該基因在各物種的同源性較高,與綿羊、藏羚羊... 

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【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 試驗材料
        1.1.1 試驗樣品采集
        1.1.2 試驗材料
    1.2 試驗方法
        1.2.1 山羊APOE基因克隆
        1.2.2 山羊APOE的生物信息學(xué)分析
        1.2.3 山羊APOE基因組織表達模式分析
        1.2.4 APOE基因在山羊皮下脂肪細胞分化過程中的表達模式
        1.2.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 山羊APOE基因克隆
    2.2 生物信息學(xué)分析
        2.2.1 基本理化性質(zhì)分析
        2.2.2 蛋白結(jié)構(gòu)特征互作及靶標(biāo)miRNA預(yù)測
    2.3 APOE系統(tǒng)進化樹構(gòu)建
    2.4 山羊APOE基因組織表達譜構(gòu)建
    2.5 山羊APOE基因細胞時序表達譜構(gòu)建
3 討論與結(jié)論



本文編號：3736032