氣腫疽梭菌NanA基因克隆及生物信息學分析
發(fā)布時間:2022-12-09 00:22
為了對氣腫疽梭菌NanA基因進行克隆及生物信息學分析,試驗根據(jù)GenBank中已發(fā)表的氣腫疽梭菌NanA基因序列設計并合成1對特異性引物,以氣腫疽梭菌總DNA為模板,擴增出NanA目的基因并克隆至pMD18-T載體中,對測序正確的NanA基因進行序列對比分析,對NanA蛋白進行理化性質(zhì)分析與二級結構預測,同時使用在線軟件預測NanA蛋白三級結構。結果表明:成功擴增出氣腫疽梭菌Nan A基因,與參考序列相比,共存在3處核苷酸突變,核苷酸序列和氨基酸序列與NCBI公布的JF4135 NanA基因序列的同源性均為99.8%。NanA蛋白分子質(zhì)量約為71 ku,具有較高的抗原指數(shù),二級結構以β-折疊和無規(guī)則卷曲為主,有多個抗原表位區(qū)域。
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 菌株及主要試劑
1.2 Nana基因引物的設計與合成
1.3 NanA基因的PCR擴增與克隆
1.4 NanA基因序列對比分析
1.5 NanA蛋白理化性質(zhì)分析與二級結構預測
1.6 NanA蛋白三級結構預測
2 結果與分析
2.1 NanA基因PCR擴增與克隆
2.2 NanA基因序列比對分析
2.3 NanA蛋白理化性質(zhì)分析
2.4 NanA蛋白二級結構預測
2.5 NanA蛋白三級結構預測
3 討論與結論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]利用SOE-PCR與TD-PCR技術對氣腫疽梭菌FliA(C)-NanA融合基因擴增方法的構建[J]. 李香春,金鑫,樸春宇,金成德,樸春實. 安徽農(nóng)業(yè)科學. 2013(24)
[2]吉林延邊地區(qū)牛氣腫疽病的診斷報告[J]. 段雪巖,金東春,任春宇,車達,云巾宴,齊強,金鑫. 中國畜牧獸醫(yī). 2015(10)
[3]氣腫疽梭菌PCR檢測方法的建立[J]. 云巾宴,任春宇,車達,段雪巖,司唯,金鑫. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2015(10)
[4]肉牛氣腫疽病的流行與綜合防控措施分析[J]. 武成威. 畜禽業(yè). 2018(07)
碩士論文
[1]延邊株氣腫疽梭菌的分離鑒定及cctA基因的克隆和表達[D]. 云巾宴.延邊大學 2015
本文編號:3714432
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 菌株及主要試劑
1.2 Nana基因引物的設計與合成
1.3 NanA基因的PCR擴增與克隆
1.4 NanA基因序列對比分析
1.5 NanA蛋白理化性質(zhì)分析與二級結構預測
1.6 NanA蛋白三級結構預測
2 結果與分析
2.1 NanA基因PCR擴增與克隆
2.2 NanA基因序列比對分析
2.3 NanA蛋白理化性質(zhì)分析
2.4 NanA蛋白二級結構預測
2.5 NanA蛋白三級結構預測
3 討論與結論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]利用SOE-PCR與TD-PCR技術對氣腫疽梭菌FliA(C)-NanA融合基因擴增方法的構建[J]. 李香春,金鑫,樸春宇,金成德,樸春實. 安徽農(nóng)業(yè)科學. 2013(24)
[2]吉林延邊地區(qū)牛氣腫疽病的診斷報告[J]. 段雪巖,金東春,任春宇,車達,云巾宴,齊強,金鑫. 中國畜牧獸醫(yī). 2015(10)
[3]氣腫疽梭菌PCR檢測方法的建立[J]. 云巾宴,任春宇,車達,段雪巖,司唯,金鑫. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2015(10)
[4]肉牛氣腫疽病的流行與綜合防控措施分析[J]. 武成威. 畜禽業(yè). 2018(07)
碩士論文
[1]延邊株氣腫疽梭菌的分離鑒定及cctA基因的克隆和表達[D]. 云巾宴.延邊大學 2015
本文編號:3714432
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