不同品系雞Tmem9A/9B基因的克隆與表達(dá)分析
發(fā)布時間:2022-12-07 18:45
TMEM9(Transmembrane protein 9 domain family)作為一個跨膜蛋白家族,在從線蟲到人類等不同物種間高度保守。目前,該家族已發(fā)現(xiàn)TMEM9A和TMEM9B兩個成員。人TMEM9A蛋白定位于溶酶體和次級內(nèi)體上,TMEM9B是一種重要糖蛋白,定位于溶酶體膜和初級內(nèi)體膜上。目前,關(guān)于這兩個基因的表達(dá)和功能特性研究報道較少。本研究以雞為實(shí)驗動物,克隆Tmem9A和Tmem9B基因并對其表達(dá)與功能特性進(jìn)行初探,主要研究方法和實(shí)驗結(jié)果如下:首先,本研究克隆了海蘭褐雞、AA+肉雞和三黃雞Tmem9A基因與AA+肉雞和三黃雞Tmem9B基因的全長編碼序列并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明:海蘭褐雞、AA+肉雞和三黃雞Tmem9A基因編碼序列全長均為576bp,Tmem9B基因全長均為570bp,不同品系雞的這兩個基因編碼序列均存在SNP位點(diǎn),但Tmem9A和Tmem9B基因均高度保守。通過對Tmem9A和Tmem9B的核苷酸序列和氨基酸序列比較分析,二者同源性分別為60%與50%左右,表明Tmem9A和T...
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 緒論
1.1 TMEM家族簡介
1.1.1 Tmem9A基因的研究進(jìn)展
1.1.2 Tmem9B基因的研究進(jìn)展
1.2 TMEM9與NF-κB信號通路
1.3 TMEM9與溶酶體
1.3.1 溶酶體跨膜蛋白
1.3.2 TMEM9與溶酶體關(guān)系
1.4 TMEM9與內(nèi)體
1.4.1 內(nèi)體的功能
1.4.2 內(nèi)體膜蛋白
1.4.3 TMEM9與內(nèi)體關(guān)系
1.5 本研究的目的和意義
第2章 不同品系雞Tmem9A和Tmem9B基因的克隆與序列分析
2.1 實(shí)驗材料
2.1.1 實(shí)驗動物
2.1.2 質(zhì)粒與菌種
2.1.3 酶和生化試劑
2.1.4 引物
2.1.5 主要儀器設(shè)備
2.2 實(shí)驗方法
2.2.1 樣品采集
2.2.2 T-A克隆
2.2.3 生物信息學(xué)分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 不同品系雞Tmem9A和Tmem9B基因的克隆
2.3.2 生物信息學(xué)分析
2.4 討論
2.4.1 不同品系雞Tmem9A序列生物信息學(xué)分析
2.4.2 不同品系雞Tmem9B序列生物信息學(xué)分析
2.4.3 不同品系雞Tmem9A序列和Tmem9B序列對比分析
2.5 本章小結(jié)
第3章 不同品系雞Tmem9A和Tmem9B基因的表達(dá)分析
3.1 實(shí)驗材料
3.1.1 實(shí)驗動物
3.1.2 酶和生化試劑
3.1.3 引物
3.1.4 主要儀器設(shè)備
3.2 實(shí)驗方法
3.2.1 樣品采集
3.2.2 不同品系雞Tmem9A基因的表達(dá)譜分析
3.2.3 不同品系雞Tmem9B基因的表達(dá)譜分析
3.2.4 統(tǒng)計分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 Tmem9A基因的表達(dá)特性分析
3.3.2 Tmem9B基因的表達(dá)特性分析
3.4 討論
3.4.1 Tmem9A基因的表達(dá)特性分析
3.4.2 Tmem9B基因的表達(dá)特性分析
3.4.3 Tmem9A和Tmem9B基因表達(dá)的異同
3.5 本章小結(jié)
第4章 Tmem9A和Tmem9B基因在炎癥和免疫反應(yīng)中的表達(dá)特性分析
4.1 實(shí)驗材料
4.1.1 實(shí)驗動物
4.1.2 酶和生化試劑
4.1.3 引物
4.1.4 主要儀器設(shè)備
4.2 實(shí)驗方法
4.2.1 炎癥模型雛雞的制備和驗證
4.2.2 疫苗免疫模型雛雞的制備和驗證
4.2.3 樣品采集
4.2.4 炎癥模型中Tmem9A基因和Tmem9B基因的表達(dá)特性分析
4.2.5 疫苗免疫模型中Tmem9A基因和Tmem9B基因的表達(dá)特性分析
4.2.6 統(tǒng)計分析
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 炎癥模型中Tmem9A基因和Tmem9B基因的表達(dá)特性分析
4.3.2 疫苗免疫模型中Tmem9A基因和Tmem9B基因的表達(dá)特性分析
4.4 討論
4.4.1 炎癥模型中Tmem9A基因和Tmem9B基因的表達(dá)特性分析
4.4.2 疫苗免疫模型中Tmem9A基因和Tmem9B基因的表達(dá)特性分析
4.5 本章小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表學(xué)的術(shù)論文
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]LPS誘導(dǎo)不同品系雛雞炎癥反應(yīng)相關(guān)基因的差異表達(dá)分析[J]. 穆衛(wèi)濤,常楊,趙冬雪,滿朝來. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2016(06)
[2]TMEM家族成員免疫功能的研究進(jìn)展[J]. 魏晶,陳紀(jì)飛,王冰,王世儀,喬鋆,田飛,李芳. 中國免疫學(xué)雜志. 2016(01)
[3]雞Tmem9B同源基因的克隆與序列分析[J]. 李宗恩,滿朝來. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報. 2011(08)
[4]細(xì)胞水平篩選鑒定激活核因子κB通路的新基因TMEM9B[J]. 劉宇明,彭智,鄧唯唯,石太平,馬大龍. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2009(11)
[5]溶酶體相關(guān)細(xì)胞器生物發(fā)生復(fù)合體相互作用組構(gòu)成胞內(nèi)體運(yùn)輸網(wǎng)絡(luò)(英文)[J]. 李巍,馮雅琴,郝嬋娟,郭小黎,崔艷艷,賀敏,何新. 遺傳學(xué)報. 2007(08)
碩士論文
[1]雞不同疫苗免疫反應(yīng)中幾個免疫相關(guān)基因的表達(dá)特性研究[D]. 趙冬雪.哈爾濱師范大學(xué) 2017
[2]LPS誘導(dǎo)雞幾個炎癥反應(yīng)相關(guān)基因的表達(dá)調(diào)控研究[D]. 穆衛(wèi)濤.哈爾濱師范大學(xué) 2016
本文編號:3712646
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 緒論
1.1 TMEM家族簡介
1.1.1 Tmem9A基因的研究進(jìn)展
1.1.2 Tmem9B基因的研究進(jìn)展
1.2 TMEM9與NF-κB信號通路
1.3 TMEM9與溶酶體
1.3.1 溶酶體跨膜蛋白
1.3.2 TMEM9與溶酶體關(guān)系
1.4 TMEM9與內(nèi)體
1.4.1 內(nèi)體的功能
1.4.2 內(nèi)體膜蛋白
1.4.3 TMEM9與內(nèi)體關(guān)系
1.5 本研究的目的和意義
第2章 不同品系雞Tmem9A和Tmem9B基因的克隆與序列分析
2.1 實(shí)驗材料
2.1.1 實(shí)驗動物
2.1.2 質(zhì)粒與菌種
2.1.3 酶和生化試劑
2.1.4 引物
2.1.5 主要儀器設(shè)備
2.2 實(shí)驗方法
2.2.1 樣品采集
2.2.2 T-A克隆
2.2.3 生物信息學(xué)分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 不同品系雞Tmem9A和Tmem9B基因的克隆
2.3.2 生物信息學(xué)分析
2.4 討論
2.4.1 不同品系雞Tmem9A序列生物信息學(xué)分析
2.4.2 不同品系雞Tmem9B序列生物信息學(xué)分析
2.4.3 不同品系雞Tmem9A序列和Tmem9B序列對比分析
2.5 本章小結(jié)
第3章 不同品系雞Tmem9A和Tmem9B基因的表達(dá)分析
3.1 實(shí)驗材料
3.1.1 實(shí)驗動物
3.1.2 酶和生化試劑
3.1.3 引物
3.1.4 主要儀器設(shè)備
3.2 實(shí)驗方法
3.2.1 樣品采集
3.2.2 不同品系雞Tmem9A基因的表達(dá)譜分析
3.2.3 不同品系雞Tmem9B基因的表達(dá)譜分析
3.2.4 統(tǒng)計分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 Tmem9A基因的表達(dá)特性分析
3.3.2 Tmem9B基因的表達(dá)特性分析
3.4 討論
3.4.1 Tmem9A基因的表達(dá)特性分析
3.4.2 Tmem9B基因的表達(dá)特性分析
3.4.3 Tmem9A和Tmem9B基因表達(dá)的異同
3.5 本章小結(jié)
第4章 Tmem9A和Tmem9B基因在炎癥和免疫反應(yīng)中的表達(dá)特性分析
4.1 實(shí)驗材料
4.1.1 實(shí)驗動物
4.1.2 酶和生化試劑
4.1.3 引物
4.1.4 主要儀器設(shè)備
4.2 實(shí)驗方法
4.2.1 炎癥模型雛雞的制備和驗證
4.2.2 疫苗免疫模型雛雞的制備和驗證
4.2.3 樣品采集
4.2.4 炎癥模型中Tmem9A基因和Tmem9B基因的表達(dá)特性分析
4.2.5 疫苗免疫模型中Tmem9A基因和Tmem9B基因的表達(dá)特性分析
4.2.6 統(tǒng)計分析
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 炎癥模型中Tmem9A基因和Tmem9B基因的表達(dá)特性分析
4.3.2 疫苗免疫模型中Tmem9A基因和Tmem9B基因的表達(dá)特性分析
4.4 討論
4.4.1 炎癥模型中Tmem9A基因和Tmem9B基因的表達(dá)特性分析
4.4.2 疫苗免疫模型中Tmem9A基因和Tmem9B基因的表達(dá)特性分析
4.5 本章小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表學(xué)的術(shù)論文
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]LPS誘導(dǎo)不同品系雛雞炎癥反應(yīng)相關(guān)基因的差異表達(dá)分析[J]. 穆衛(wèi)濤,常楊,趙冬雪,滿朝來. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2016(06)
[2]TMEM家族成員免疫功能的研究進(jìn)展[J]. 魏晶,陳紀(jì)飛,王冰,王世儀,喬鋆,田飛,李芳. 中國免疫學(xué)雜志. 2016(01)
[3]雞Tmem9B同源基因的克隆與序列分析[J]. 李宗恩,滿朝來. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報. 2011(08)
[4]細(xì)胞水平篩選鑒定激活核因子κB通路的新基因TMEM9B[J]. 劉宇明,彭智,鄧唯唯,石太平,馬大龍. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2009(11)
[5]溶酶體相關(guān)細(xì)胞器生物發(fā)生復(fù)合體相互作用組構(gòu)成胞內(nèi)體運(yùn)輸網(wǎng)絡(luò)(英文)[J]. 李巍,馮雅琴,郝嬋娟,郭小黎,崔艷艷,賀敏,何新. 遺傳學(xué)報. 2007(08)
碩士論文
[1]雞不同疫苗免疫反應(yīng)中幾個免疫相關(guān)基因的表達(dá)特性研究[D]. 趙冬雪.哈爾濱師范大學(xué) 2017
[2]LPS誘導(dǎo)雞幾個炎癥反應(yīng)相關(guān)基因的表達(dá)調(diào)控研究[D]. 穆衛(wèi)濤.哈爾濱師范大學(xué) 2016
本文編號:3712646
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