巴馬香豬FABP4基因的克隆及其組織表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2022-10-09 19:40
為了獲得巴馬香豬脂肪酸結(jié)合蛋白4(FABP4)基因的編碼區(qū)序列(CDS),并探究FABP4基因在巴馬香豬不同器官/組織中的mRNA表達(dá)水平,試驗(yàn)以巴馬香豬背最長(zhǎng)肌為材料,提取總RNA并擴(kuò)增出FABP4基因的CDS,運(yùn)用在線分析系統(tǒng)進(jìn)行生物信息學(xué)分析,并利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)檢測(cè)巴馬香豬心臟、脾臟、肝臟、腎臟、肺臟、背最長(zhǎng)肌和胰腺等器官/組織中FABP4基因的mRNA表達(dá)水平。結(jié)果表明:成功克隆得到巴馬香豬FABP4基因的CDS,長(zhǎng)度為488bp,與GenBank中公布的豬FABP4基因同源性為99.6%,并且存在2個(gè)突變位點(diǎn),第421位點(diǎn)處G→A為同義突變,第462位點(diǎn)處A→G導(dǎo)致賴氨酸突變?yōu)榫彼?巴馬香豬FABP4基因CDS與豬、人、黑猩猩、獼猴、牛和家鼠的同源性分別為99.6%、89.3%、89.3%、88.7%、87.3%和82.8%,且與普通豬的遺傳距離最近,聚類為一支;巴馬香豬FABP4蛋白氨基酸組成中蘇氨酸和纈氨酸含量較高,均占氨基酸總數(shù)的10.6%;FABP4蛋白為親水蛋白,包含一個(gè)Lipocalin超家族結(jié)構(gòu)域;巴馬香豬FABP4蛋白的二、三級(jí)結(jié)構(gòu)包含α-螺旋、延...
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
1.2 主要試劑
2 方法
2.1 引物的設(shè)計(jì)與合成
2.2 FABP4基因的PCR擴(kuò)增及克隆
2.3 生物信息學(xué)分析
2.4 不同器官/組織中FABP4基因表達(dá)的檢測(cè)
3 結(jié)果與分析
3.1 巴馬香豬FABP4基因的克隆
3.2 巴馬香豬FABP4基因序列分析
3.3 巴馬香豬FABP4基因CDS同源性比較及系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
3.4 巴馬香豬FABP4基因氨基酸組成分析
3.5 巴馬香豬FABP4蛋白親疏水性分析
3.6 巴馬香豬FABP4蛋白保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)
3.7 巴馬香豬FABP4蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
3.8 巴馬香豬FABP4蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
3.9 不同器官/組織中FABP4基因表達(dá)的檢測(cè)
4 討論與結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]豬A-FABP基因真核表達(dá)載體的構(gòu)建及其組織表達(dá)[J]. 李曉玲,于光輝,崔小榮,張廷榮,孫金海. 中國(guó)畜牧雜志. 2018(01)
[2]豬A-FABP基因的克隆及其組織差異性表達(dá)[J]. 李曉玲,崔小榮,竇成利,于光輝,張廷榮,孫金海. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2017(15)
[3]絨山羊不同肌肉組織及肌內(nèi)脂肪細(xì)胞的基因表達(dá)分析[J]. 杜琛,李金泉,陳秀娟. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2016(02)
[4]FABP4基因在阿勒泰羊尾脂沉積與代謝模型中的表達(dá)變化規(guī)律[J]. 許瑞霞,高磊,趙偉利,張偉,宋廣超,甘尚權(quán),石國(guó)慶. 遺傳. 2015(02)
[5]綿羊脂肪細(xì)胞型脂肪酸結(jié)合蛋白基因(FABP4)cDNA的克隆、表達(dá)及其結(jié)構(gòu)模擬分析[J]. 徐秋良,張慶莉,陳玉林. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2011(03)
[6]九龍牦牛脂肪細(xì)胞型脂肪酸結(jié)合蛋白基因(A-FABP)的克隆及其表達(dá)譜[J]. 鄺良德,林亞秋,徐亞歐,李玉萍,蔣忠榮,鄭玉才. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2010(06)
博士論文
[1]大熊貓F(tuán)ABP4、FABP5及RPS9基因克隆與表達(dá)研究[D]. 宋波.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
碩士論文
[1]阿勒泰大尾羊FABP4、ADIPOQ和CFD基因分子克隆及其組織差異性表達(dá)的研究[D]. 許瑞霞.石河子大學(xué) 2015
[2]北京鴨A-FABP基因組織表達(dá)特征及表達(dá)效應(yīng)[D]. 榮光輝.揚(yáng)州大學(xué) 2014
[3]脂肪因子Lipocalin-2與2型糖尿病及肥胖的相關(guān)性研究[D]. 陳旖婷.蘇州大學(xué) 2011
[4]牛A-FABP多克隆抗血清制備及組織表達(dá)分析[D]. 季舒涵.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2010
本文編號(hào):3689238
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
1.2 主要試劑
2 方法
2.1 引物的設(shè)計(jì)與合成
2.2 FABP4基因的PCR擴(kuò)增及克隆
2.3 生物信息學(xué)分析
2.4 不同器官/組織中FABP4基因表達(dá)的檢測(cè)
3 結(jié)果與分析
3.1 巴馬香豬FABP4基因的克隆
3.2 巴馬香豬FABP4基因序列分析
3.3 巴馬香豬FABP4基因CDS同源性比較及系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
3.4 巴馬香豬FABP4基因氨基酸組成分析
3.5 巴馬香豬FABP4蛋白親疏水性分析
3.6 巴馬香豬FABP4蛋白保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)
3.7 巴馬香豬FABP4蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
3.8 巴馬香豬FABP4蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
3.9 不同器官/組織中FABP4基因表達(dá)的檢測(cè)
4 討論與結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]豬A-FABP基因真核表達(dá)載體的構(gòu)建及其組織表達(dá)[J]. 李曉玲,于光輝,崔小榮,張廷榮,孫金海. 中國(guó)畜牧雜志. 2018(01)
[2]豬A-FABP基因的克隆及其組織差異性表達(dá)[J]. 李曉玲,崔小榮,竇成利,于光輝,張廷榮,孫金海. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2017(15)
[3]絨山羊不同肌肉組織及肌內(nèi)脂肪細(xì)胞的基因表達(dá)分析[J]. 杜琛,李金泉,陳秀娟. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2016(02)
[4]FABP4基因在阿勒泰羊尾脂沉積與代謝模型中的表達(dá)變化規(guī)律[J]. 許瑞霞,高磊,趙偉利,張偉,宋廣超,甘尚權(quán),石國(guó)慶. 遺傳. 2015(02)
[5]綿羊脂肪細(xì)胞型脂肪酸結(jié)合蛋白基因(FABP4)cDNA的克隆、表達(dá)及其結(jié)構(gòu)模擬分析[J]. 徐秋良,張慶莉,陳玉林. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2011(03)
[6]九龍牦牛脂肪細(xì)胞型脂肪酸結(jié)合蛋白基因(A-FABP)的克隆及其表達(dá)譜[J]. 鄺良德,林亞秋,徐亞歐,李玉萍,蔣忠榮,鄭玉才. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2010(06)
博士論文
[1]大熊貓F(tuán)ABP4、FABP5及RPS9基因克隆與表達(dá)研究[D]. 宋波.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
碩士論文
[1]阿勒泰大尾羊FABP4、ADIPOQ和CFD基因分子克隆及其組織差異性表達(dá)的研究[D]. 許瑞霞.石河子大學(xué) 2015
[2]北京鴨A-FABP基因組織表達(dá)特征及表達(dá)效應(yīng)[D]. 榮光輝.揚(yáng)州大學(xué) 2014
[3]脂肪因子Lipocalin-2與2型糖尿病及肥胖的相關(guān)性研究[D]. 陳旖婷.蘇州大學(xué) 2011
[4]牛A-FABP多克隆抗血清制備及組織表達(dá)分析[D]. 季舒涵.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2010
本文編號(hào):3689238
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