雞CALB1基因的SNPs檢測(cè)及其與蛋品質(zhì)的關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時(shí)間:2022-10-08 14:56
蛋殼品質(zhì)是蛋禽的重要經(jīng)濟(jì)性狀。鈣結(jié)合蛋白是機(jī)體內(nèi)調(diào)節(jié)鈣離子轉(zhuǎn)運(yùn)的重要蛋白,CALB1,即Calbindin-D28k,是Ca BP的一種位于胞漿中可溶性蛋白質(zhì),可與Ca2+相結(jié)合,直接調(diào)節(jié)Ca2+轉(zhuǎn)運(yùn),介導(dǎo)調(diào)節(jié)參與Ca2+的多種生理功能。本試驗(yàn)以濟(jì)寧百日雞為試驗(yàn)材料,搜集了43周齡母雞所產(chǎn)雞蛋560枚,測(cè)定了蛋重、蛋形指數(shù)、蛋殼厚度、蛋殼強(qiáng)度、蛋殼重、蛋黃重、蛋白重、蛋白高度、蛋黃顏色、哈氏單位、蛋殼比率、蛋黃比率、蛋白比率等蛋品質(zhì)指標(biāo),檢測(cè)了CALB1基因5’調(diào)控區(qū)SNPs,并將其與蛋品質(zhì)性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。主要研究結(jié)果如下:(1)濟(jì)寧百日雞平均蛋重為44.04±0.15g、蛋殼厚度為0.31±0.03mm、蛋殼強(qiáng)度為38.13±0.29N/cm2、蛋形指數(shù)為1.31±0.00,哈氏單位為61.17±0.30。蛋殼比率、蛋黃比率和蛋白比率分別為9.90%、37.60%和52.52%。蛋形指數(shù)的變異系數(shù)最小,為4.06%;蛋殼強(qiáng)度和蛋白高度的變異系數(shù)最大,均超過(guò)了15%。變異系數(shù)在5%~10%的性狀有蛋重、蛋殼比率、蛋白比率和蛋黃比率。其余性狀的變異系數(shù)在10%~15%之間。蛋重與蛋殼重...
【文章頁(yè)數(shù)】:72 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
1 引言
1.1 濟(jì)寧百日雞及蛋品質(zhì)
1.2 蛋殼品質(zhì)的研究進(jìn)展
1.2.1 蛋殼性狀的評(píng)定指標(biāo)
1.2.2 影響蛋殼品質(zhì)的因素
1.2.3 蛋殼的成分
1.3 鈣結(jié)合蛋白的研究進(jìn)展
1.3.1 鈣結(jié)合蛋白的結(jié)構(gòu)
1.3.2 鈣結(jié)合Calbindin-D28k的分子生物學(xué)特性
1.3.3 鈣結(jié)合Calbindin-D28k的作用
1.4 CALB1基因的研究進(jìn)展
1.4.1 CALB1基因的結(jié)構(gòu)
1.4.2 CALB1基因在雌性生殖系統(tǒng)中的表達(dá)
1.5 單核苷酸多態(tài)性與蛋殼性狀分子遺傳標(biāo)記
1.6 本研究的目的與意義
2 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
2.1.2 數(shù)據(jù)庫(kù)及軟件
2.1.3 主要儀器設(shè)備
2.1.4 主要試劑
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 蛋品質(zhì)指標(biāo)測(cè)量
2.2.2 雞血液DNA的提取
2.2.3 試驗(yàn)引物設(shè)計(jì)
2.2.4 混池測(cè)序篩選CALB1基因的SNPs位點(diǎn)
2.2.5 5'調(diào)控區(qū)各SNPs位點(diǎn)突變前后轉(zhuǎn)錄因子變化預(yù)測(cè)
2.2.6 CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)甲基化預(yù)測(cè)
2.2.7 濟(jì)寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)大群檢測(cè)和基因分型
2.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
2.3.1 濟(jì)寧百日雞蛋品質(zhì)
2.3.2 群體基因頻率、基因型頻率及遺傳多樣性
2.3.3 SNPs與蛋品質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)分析
2.3.4 單倍型效應(yīng)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 濟(jì)寧百日雞蛋品質(zhì)分析
3.2 濟(jì)寧百日雞蛋品質(zhì)性狀相關(guān)性分析
3.3 濟(jì)寧百日雞CALB1基因SNPs位點(diǎn)檢測(cè)及群體遺傳學(xué)分析
3.3.1 目的片段PCR擴(kuò)增結(jié)果
3.3.2 混池測(cè)序結(jié)果
3.3.3 部分SNPs位點(diǎn)突變前后轉(zhuǎn)錄因子比較
3.3.4 CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)的甲基化預(yù)測(cè)結(jié)果
3.3.5 濟(jì)寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)SNPs直接測(cè)序結(jié)果
3.3.6 濟(jì)寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)SNPs位點(diǎn)群體遺傳學(xué)分析
3.4 濟(jì)寧百日雞CALB1基因SNPs與蛋品質(zhì)關(guān)聯(lián)分析
3.4.1 濟(jì)寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)SNPs位點(diǎn)與蛋品質(zhì)關(guān)聯(lián)分析
3.4.2 濟(jì)寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)SNPs位點(diǎn)連鎖不平衡分析
3.4.3 濟(jì)寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)單倍型與聯(lián)合基因型效應(yīng)分析
4 討論
4.1 濟(jì)寧百日雞蛋品質(zhì)特點(diǎn)
4.2 雞CALB15'調(diào)控區(qū)的多態(tài)性
4.3 濟(jì)寧百日雞CALB15'調(diào)控區(qū)SNPs對(duì)蛋殼品質(zhì)的影響
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]懸浮紅細(xì)胞輸注量對(duì)受血者血鈣濃度變化的影響[J]. 王晶晶,劉愛(ài)華. 醫(yī)學(xué)信息. 2020(03)
[2]京粉1號(hào)商品蛋雞蛋品質(zhì)分析[J]. 陳志明. 綠色科技. 2019(13)
[3]影響蛋殼質(zhì)量的因素分析及對(duì)策[J]. 孫豐蘭,趙黎明. 畜牧獸醫(yī)雜志. 2019(02)
[4]不同飼養(yǎng)方式對(duì)雞蛋品質(zhì)及其常規(guī)化學(xué)成分的影響[J]. 劉帥,溫杰鋒,康麗,李顯耀,樊新忠,唐輝. 家禽科學(xué). 2017(07)
[5]雞蛋蛋殼性狀功能基因的鑒定及應(yīng)用[J]. 田小龍,張瑩,張紅亮,張浩,吳常信. 中國(guó)家禽. 2017(13)
[6]鈣結(jié)合蛋白-D28K在神經(jīng)退行性疾病中的作用[J]. 何蓮子,鄧媛媛,高健美,龔其海. 中國(guó)新藥與臨床雜志. 2017(05)
[7]礦物質(zhì)元素和維生素對(duì)雞蛋殼顏色的影響及其可能機(jī)制[J]. 黃選洋,張克英,王建萍,丁雪梅,曾秋鳳,白世平. 動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)學(xué)報(bào). 2016(09)
[8]礦物元素對(duì)雞蛋蛋殼質(zhì)量的營(yíng)養(yǎng)調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 趙必遷,李學(xué)海,錢(qián)文. 廣東飼料. 2016(05)
[9]Expression analysis for candidate genes associated with eggshell mechanical property[J]. SUN Cong-jiao,DUAN Zhong-yi,QU Lu-jiang,ZHENG Jiang-xia,YANG Ning,XU Gui-yun. Journal of Integrative Agriculture. 2016(02)
[10]不同地方雞種蛋品質(zhì)比較和相關(guān)性分析[J]. 董志梅,劉曉曉,龍君江,李永洙,秦四海. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2016(03)
博士論文
[1]雞OC17基因克隆、表達(dá)及其Ser61位點(diǎn)對(duì)碳酸鈣結(jié)晶功能研究[D]. 張權(quán).中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]雞蛋殼品質(zhì)的比較蛋白質(zhì)組研究及離子轉(zhuǎn)運(yùn)基因抑制表達(dá)分析[D]. 孫從佼.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]雞CRBPs基因家族克隆、表達(dá)及其與繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 肖禮華.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]鈣結(jié)合蛋白Calbindin-d28k在女性生殖系統(tǒng)表達(dá)與變化的研究[D]. 許多.暨南大學(xué) 2006
[5]雞鈣代謝調(diào)節(jié)相關(guān)基因的克隆重組與表達(dá)研究[D]. 章世元.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
碩士論文
[1]濟(jì)寧百日雞產(chǎn)蛋曲線擬合及ASMT基因5’調(diào)控區(qū)多態(tài)性分析[D]. 滕軍.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]汶上蘆花雞蛋品質(zhì)及其候選基因遺傳效應(yīng)分析[D]. 夏佳豪.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[3]壽光雞AANAT基因5’調(diào)控區(qū)的多態(tài)性及其與產(chǎn)蛋性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 郝園麗.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[4]雞產(chǎn)蛋相關(guān)基因多態(tài)性檢測(cè)及其與蛋用性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 楊桓.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[5]蛋殼顏色、成分和結(jié)構(gòu)與蛋殼質(zhì)量關(guān)系的研究[D]. 周光玉.揚(yáng)州大學(xué) 2010
[6]D28k鈣結(jié)合蛋白基因真核表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建及其表達(dá)效果的研究[D]. 李燕舞.揚(yáng)州大學(xué) 2004
本文編號(hào):3687916
【文章頁(yè)數(shù)】:72 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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中文摘要
Abstract
1 引言
1.1 濟(jì)寧百日雞及蛋品質(zhì)
1.2 蛋殼品質(zhì)的研究進(jìn)展
1.2.1 蛋殼性狀的評(píng)定指標(biāo)
1.2.2 影響蛋殼品質(zhì)的因素
1.2.3 蛋殼的成分
1.3 鈣結(jié)合蛋白的研究進(jìn)展
1.3.1 鈣結(jié)合蛋白的結(jié)構(gòu)
1.3.2 鈣結(jié)合Calbindin-D28k的分子生物學(xué)特性
1.3.3 鈣結(jié)合Calbindin-D28k的作用
1.4 CALB1基因的研究進(jìn)展
1.4.1 CALB1基因的結(jié)構(gòu)
1.4.2 CALB1基因在雌性生殖系統(tǒng)中的表達(dá)
1.5 單核苷酸多態(tài)性與蛋殼性狀分子遺傳標(biāo)記
1.6 本研究的目的與意義
2 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
2.1.2 數(shù)據(jù)庫(kù)及軟件
2.1.3 主要儀器設(shè)備
2.1.4 主要試劑
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 蛋品質(zhì)指標(biāo)測(cè)量
2.2.2 雞血液DNA的提取
2.2.3 試驗(yàn)引物設(shè)計(jì)
2.2.4 混池測(cè)序篩選CALB1基因的SNPs位點(diǎn)
2.2.5 5'調(diào)控區(qū)各SNPs位點(diǎn)突變前后轉(zhuǎn)錄因子變化預(yù)測(cè)
2.2.6 CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)甲基化預(yù)測(cè)
2.2.7 濟(jì)寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)大群檢測(cè)和基因分型
2.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
2.3.1 濟(jì)寧百日雞蛋品質(zhì)
2.3.2 群體基因頻率、基因型頻率及遺傳多樣性
2.3.3 SNPs與蛋品質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)分析
2.3.4 單倍型效應(yīng)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 濟(jì)寧百日雞蛋品質(zhì)分析
3.2 濟(jì)寧百日雞蛋品質(zhì)性狀相關(guān)性分析
3.3 濟(jì)寧百日雞CALB1基因SNPs位點(diǎn)檢測(cè)及群體遺傳學(xué)分析
3.3.1 目的片段PCR擴(kuò)增結(jié)果
3.3.2 混池測(cè)序結(jié)果
3.3.3 部分SNPs位點(diǎn)突變前后轉(zhuǎn)錄因子比較
3.3.4 CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)的甲基化預(yù)測(cè)結(jié)果
3.3.5 濟(jì)寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)SNPs直接測(cè)序結(jié)果
3.3.6 濟(jì)寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)SNPs位點(diǎn)群體遺傳學(xué)分析
3.4 濟(jì)寧百日雞CALB1基因SNPs與蛋品質(zhì)關(guān)聯(lián)分析
3.4.1 濟(jì)寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)SNPs位點(diǎn)與蛋品質(zhì)關(guān)聯(lián)分析
3.4.2 濟(jì)寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)SNPs位點(diǎn)連鎖不平衡分析
3.4.3 濟(jì)寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)單倍型與聯(lián)合基因型效應(yīng)分析
4 討論
4.1 濟(jì)寧百日雞蛋品質(zhì)特點(diǎn)
4.2 雞CALB15'調(diào)控區(qū)的多態(tài)性
4.3 濟(jì)寧百日雞CALB15'調(diào)控區(qū)SNPs對(duì)蛋殼品質(zhì)的影響
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
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期刊論文
[1]懸浮紅細(xì)胞輸注量對(duì)受血者血鈣濃度變化的影響[J]. 王晶晶,劉愛(ài)華. 醫(yī)學(xué)信息. 2020(03)
[2]京粉1號(hào)商品蛋雞蛋品質(zhì)分析[J]. 陳志明. 綠色科技. 2019(13)
[3]影響蛋殼質(zhì)量的因素分析及對(duì)策[J]. 孫豐蘭,趙黎明. 畜牧獸醫(yī)雜志. 2019(02)
[4]不同飼養(yǎng)方式對(duì)雞蛋品質(zhì)及其常規(guī)化學(xué)成分的影響[J]. 劉帥,溫杰鋒,康麗,李顯耀,樊新忠,唐輝. 家禽科學(xué). 2017(07)
[5]雞蛋蛋殼性狀功能基因的鑒定及應(yīng)用[J]. 田小龍,張瑩,張紅亮,張浩,吳常信. 中國(guó)家禽. 2017(13)
[6]鈣結(jié)合蛋白-D28K在神經(jīng)退行性疾病中的作用[J]. 何蓮子,鄧媛媛,高健美,龔其海. 中國(guó)新藥與臨床雜志. 2017(05)
[7]礦物質(zhì)元素和維生素對(duì)雞蛋殼顏色的影響及其可能機(jī)制[J]. 黃選洋,張克英,王建萍,丁雪梅,曾秋鳳,白世平. 動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)學(xué)報(bào). 2016(09)
[8]礦物元素對(duì)雞蛋蛋殼質(zhì)量的營(yíng)養(yǎng)調(diào)控研究進(jìn)展[J]. 趙必遷,李學(xué)海,錢(qián)文. 廣東飼料. 2016(05)
[9]Expression analysis for candidate genes associated with eggshell mechanical property[J]. SUN Cong-jiao,DUAN Zhong-yi,QU Lu-jiang,ZHENG Jiang-xia,YANG Ning,XU Gui-yun. Journal of Integrative Agriculture. 2016(02)
[10]不同地方雞種蛋品質(zhì)比較和相關(guān)性分析[J]. 董志梅,劉曉曉,龍君江,李永洙,秦四海. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2016(03)
博士論文
[1]雞OC17基因克隆、表達(dá)及其Ser61位點(diǎn)對(duì)碳酸鈣結(jié)晶功能研究[D]. 張權(quán).中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]雞蛋殼品質(zhì)的比較蛋白質(zhì)組研究及離子轉(zhuǎn)運(yùn)基因抑制表達(dá)分析[D]. 孫從佼.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]雞CRBPs基因家族克隆、表達(dá)及其與繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 肖禮華.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]鈣結(jié)合蛋白Calbindin-d28k在女性生殖系統(tǒng)表達(dá)與變化的研究[D]. 許多.暨南大學(xué) 2006
[5]雞鈣代謝調(diào)節(jié)相關(guān)基因的克隆重組與表達(dá)研究[D]. 章世元.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
碩士論文
[1]濟(jì)寧百日雞產(chǎn)蛋曲線擬合及ASMT基因5’調(diào)控區(qū)多態(tài)性分析[D]. 滕軍.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]汶上蘆花雞蛋品質(zhì)及其候選基因遺傳效應(yīng)分析[D]. 夏佳豪.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[3]壽光雞AANAT基因5’調(diào)控區(qū)的多態(tài)性及其與產(chǎn)蛋性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 郝園麗.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[4]雞產(chǎn)蛋相關(guān)基因多態(tài)性檢測(cè)及其與蛋用性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 楊桓.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[5]蛋殼顏色、成分和結(jié)構(gòu)與蛋殼質(zhì)量關(guān)系的研究[D]. 周光玉.揚(yáng)州大學(xué) 2010
[6]D28k鈣結(jié)合蛋白基因真核表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建及其表達(dá)效果的研究[D]. 李燕舞.揚(yáng)州大學(xué) 2004
本文編號(hào):3687916
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