為了了解云南省獨龍牛環(huán)孢子蟲（Cyclospora）的分子流行病學情況,試驗分四個季節(jié)從云南省怒江流域（鳩門當、古泉村、茨開鎮(zhèn)、亞左洛村）和獨龍江流域（獨龍江鄉(xiāng)）共五個地點采集1 129份獨龍牛糞便樣本,根據環(huán)孢子蟲的18S rRNA基因序列設計引物進行巢式PCR擴增,以限制性內切酶BspEⅠ進行限制性片段長度多態(tài)性（RELP）分析。利用BLAST工具對測得的序列與NCBI上已發(fā)表的環(huán)孢子蟲18S rRNA基因序列進行比對分析,通過生物學軟件MEGA 6.0計算遺傳距離并采用鄰接法（NJ法）構建遺傳進化樹,以統(tǒng)計學軟件SPSS對感染率進行分析。結果表明:從1 129份糞便樣本中共檢測出17份環(huán)孢子蟲陽性樣本,對測得序列進行同源性分析發(fā)現,5份樣本與人環(huán)孢子蟲親緣關系較近（98.5%～99.4%）,11份樣本與廣州牛源環(huán)孢子蟲親緣關系較近（94.4%～98.8%）,1份樣本與其他種類環(huán)孢子蟲親緣關系較遠。獨龍牛環(huán)孢子蟲的總感染率為1.51%（17/1 129）,怒江流域和獨龍江流域的感染率分別為1.00%（9/903）和3.54%（8/226）,兩者比較差異顯著（P<0.05）;五... 

【文章來源】：黑龍江畜牧獸醫(yī). 2020,(23)北大核心

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【部分圖文】：

環(huán)孢子蟲18S rRNA基因PCR擴增結果

經RELP分析,在24份PCR陽性樣本中,有17份樣本為環(huán)孢子蟲陽性,其中怒江流域9份,獨龍江流域8份。電泳結果顯示環(huán)孢子蟲片段被酶切為130 bp和370 bp兩個片段,見圖2(部分結果)。2.3 序列的遺傳進化分析

通過同源性分析結果,在17份陽性樣本中有5份樣本與人環(huán)孢子蟲親緣關系較近,同源性為98.5%～99.4%,11份樣本與廣州牛源環(huán)孢子蟲親緣關系較近,同源性為94.4%～98.8%,1份樣本與其他種類環(huán)孢子蟲親緣關系較遠。序列分析結果顯示,共有7份樣本不同DNA序列,上傳至GenBank中,獲得的序列號分別為MK393852～MK393858,遺傳進化分析結果見圖3。2.4 環(huán)孢子蟲感染情況的統(tǒng)計

【參考文獻】：
期刊論文
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