四環(huán)素脅迫下小鼠腸道微生物群落變化及代謝毒理效應研究
發(fā)布時間:2021-12-09 10:55
抗生素廣泛應用于人類和動物疾病預防和治療中。此外,抗生素作為生長促進劑廣泛運用于畜牧養(yǎng)殖業(yè),提高飼料利用率,促進畜禽生長。抗生素的使用對腸道微生物群落產生巨大影響,而這些腸道微生物群落結構和功能對畜禽健康、生長起著重要作用。盡管抗生素的使用給畜牧業(yè)帶來明顯的效益,但其引發(fā)的耐藥基因的增加和水平轉移,對人類健康和生態(tài)安全構成了潛在威脅。本文研究旨在探討鹽酸四環(huán)素(tetracycline hydrochloride, TET)對小鼠代謝毒性以及腸道微生物結構與功能的影響,并評估其影響腸道微生物耐藥性潛在風險。肝臟組織切片顯示TET暴露誘發(fā)小鼠肝臟組織嚴重病變,且呈現(xiàn)顯著劑量效應;停止暴露后中高濃度組肝臟組織病變難以徹底恢復;跉滟|譜核磁共振(’Hnuclear magnetic resonance spectroscopy,1H-NMR)的代謝組學實驗及偏最小二乘判別法(partial least squares discriminant analysis, PLS-DA)分析結果顯示不同劑量TET暴露均影響小鼠血清和尿液代謝,染毒組血清和尿液中眾多代謝物質與對照組存在顯著性差異,這些...
【文章來源】:南京大學江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:96 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 緒論
1.1 研究背景
1.1.1 抗生素應用與污染現(xiàn)狀及潛在風險
1.1.2 毒理代謝組學研究進展
1.1.3 腸道微生物學研究進展
1.1.4 宏基因組學和高通量測序技術研究進展
1.2 選題依據(jù)與研究目的
1.3 研究內容和技術路線
參考文獻
第2章 鹽酸四環(huán)素暴露對小鼠代謝的影響
2.1 引言
2.2 材料和方法
2.2.1 小鼠暴露處理和樣品收集
2.2.2 小鼠肝臟組織切片實驗
2.2.3 小鼠尿液和血清代謝分析預處理
2.2.4 小鼠尿液和血清1~H-NMR代謝分析
2.3 試驗結果
2.3.1 鹽酸四環(huán)素暴露對小鼠表型和肝臟病理學的影響
2.3.2 鹽酸四環(huán)素暴露對小鼠血清代謝的影響
2.3.3 鹽酸四環(huán)素暴露對小鼠尿液代謝的影響
2.4 本章小結
參考文獻
第3章 鹽酸四環(huán)素暴露對小鼠胃腸道抗生素耐藥的影響
3.1 引言
3.2 材料和方法
3.2.1 小鼠暴露處理和樣品收集
3.2.2 小鼠胃腸道微生物總DNA提取
3.2.3 耐藥基因PCR和qPCR
3.2.4 Illumina高通量測序及質量控制
3.2.5 耐藥基因blast比對分析
3.2.6 可移動元件blast比對分析
3.3 結果與討論
3.3.1 鹽酸四環(huán)素暴露對小鼠胃腸道耐藥基因豐度和多樣性的影響
3.3.2 鹽酸四環(huán)素暴露對小鼠胃腸道可移動元件的多樣性和豐度的影響
3.4 本章小結
參考文獻
第4章 鹽酸四環(huán)素暴露對小鼠胃腸道菌群結構與功能的影響
4.1 引言
4.2 材料和方法
4.2.1 小鼠暴露處理和樣品收集
4.2.2 小鼠胃腸道微生物總DNA提取
4.2.3 454-焦磷酸測序及質量控制
4.2.4 胃腸道微生物群落結構多樣性分析
4.2.5 Illumina高通量測序及質量控制
4.2.6 COG功能數(shù)據(jù)庫構建及微生物功能分析
4.3 結果與討論
4.3.1 鹽酸四環(huán)素暴露對小鼠胃腸道菌群結構的影響
4.3.2 鹽酸四環(huán)素暴露對小鼠胃腸道菌群功能的影響
4.3.3 小鼠腸道菌群結構和功能與肝臟組織病變和尿液、血清代謝相關性結果
4.3.4 小鼠腸道菌群結構和功能與耐藥基因相關性結果
4.4 本章小結
參考文獻
第5章 結論與展望
5.1 結論
5.2 研究展望
第6章 創(chuàng)新點
項目支持
成果清單
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]抗生素濫用的現(xiàn)狀及解決對策[J]. 李成英,潘凌燕. 北方藥學. 2013(06)
[2]454測序技術在微生物生態(tài)學研究中的應用[J]. 段曌,肖煒,王永霞,賴泳紅,崔曉龍. 微生物學雜志. 2011(05)
[3]肝病患者精氨酸代琥珀酸裂解酶分泌及與肝病相關血清學指標的關系[J]. 唐晚若,陳江,朱益斌,楊國英. 中外醫(yī)學研究. 2011(24)
[4]宏基因組技術及其應用研究進展[J]. 宋培勇,馬莉莉,王慶容,李黛,魏志琴. 貴州農業(yè)科學. 2009(10)
[5]畜禽養(yǎng)殖中抗生素使用的現(xiàn)狀、問題及對策[J]. 李振,王云建. 中國動物保健. 2009(07)
[6]抗生素抗性基因(ARGs)——一種新型環(huán)境污染物[J]. 羅義,周啟星. 環(huán)境科學學報. 2008(08)
[7]宏基因組學(Metagenomics)的研究現(xiàn)狀和發(fā)展趨勢[J]. 賀紀正,張麗梅,沈菊培,朱永官. 環(huán)境科學學報. 2008(02)
[8]獸用抗生素在土壤環(huán)境中的行為及其生態(tài)毒理效應研究進展[J]. 李兆君,姚志鵬,張杰,梁永超. 生態(tài)毒理學報. 2008(01)
[9]環(huán)境中抗生素殘留潛在風險及其研究進展[J]. 王冰,孫成,胡冠九. 環(huán)境科學與技術. 2007(03)
[10]土壤宏基因組學技術及其應用[J]. 沈菊培,張麗梅,鄭袁明,朱永官,賀紀正. 應用生態(tài)學報. 2007(01)
本文編號:3530516
【文章來源】:南京大學江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:96 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 緒論
1.1 研究背景
1.1.1 抗生素應用與污染現(xiàn)狀及潛在風險
1.1.2 毒理代謝組學研究進展
1.1.3 腸道微生物學研究進展
1.1.4 宏基因組學和高通量測序技術研究進展
1.2 選題依據(jù)與研究目的
1.3 研究內容和技術路線
參考文獻
第2章 鹽酸四環(huán)素暴露對小鼠代謝的影響
2.1 引言
2.2 材料和方法
2.2.1 小鼠暴露處理和樣品收集
2.2.2 小鼠肝臟組織切片實驗
2.2.3 小鼠尿液和血清代謝分析預處理
2.2.4 小鼠尿液和血清1~H-NMR代謝分析
2.3 試驗結果
2.3.1 鹽酸四環(huán)素暴露對小鼠表型和肝臟病理學的影響
2.3.2 鹽酸四環(huán)素暴露對小鼠血清代謝的影響
2.3.3 鹽酸四環(huán)素暴露對小鼠尿液代謝的影響
2.4 本章小結
參考文獻
第3章 鹽酸四環(huán)素暴露對小鼠胃腸道抗生素耐藥的影響
3.1 引言
3.2 材料和方法
3.2.1 小鼠暴露處理和樣品收集
3.2.2 小鼠胃腸道微生物總DNA提取
3.2.3 耐藥基因PCR和qPCR
3.2.4 Illumina高通量測序及質量控制
3.2.5 耐藥基因blast比對分析
3.2.6 可移動元件blast比對分析
3.3 結果與討論
3.3.1 鹽酸四環(huán)素暴露對小鼠胃腸道耐藥基因豐度和多樣性的影響
3.3.2 鹽酸四環(huán)素暴露對小鼠胃腸道可移動元件的多樣性和豐度的影響
3.4 本章小結
參考文獻
第4章 鹽酸四環(huán)素暴露對小鼠胃腸道菌群結構與功能的影響
4.1 引言
4.2 材料和方法
4.2.1 小鼠暴露處理和樣品收集
4.2.2 小鼠胃腸道微生物總DNA提取
4.2.3 454-焦磷酸測序及質量控制
4.2.4 胃腸道微生物群落結構多樣性分析
4.2.5 Illumina高通量測序及質量控制
4.2.6 COG功能數(shù)據(jù)庫構建及微生物功能分析
4.3 結果與討論
4.3.1 鹽酸四環(huán)素暴露對小鼠胃腸道菌群結構的影響
4.3.2 鹽酸四環(huán)素暴露對小鼠胃腸道菌群功能的影響
4.3.3 小鼠腸道菌群結構和功能與肝臟組織病變和尿液、血清代謝相關性結果
4.3.4 小鼠腸道菌群結構和功能與耐藥基因相關性結果
4.4 本章小結
參考文獻
第5章 結論與展望
5.1 結論
5.2 研究展望
第6章 創(chuàng)新點
項目支持
成果清單
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]抗生素濫用的現(xiàn)狀及解決對策[J]. 李成英,潘凌燕. 北方藥學. 2013(06)
[2]454測序技術在微生物生態(tài)學研究中的應用[J]. 段曌,肖煒,王永霞,賴泳紅,崔曉龍. 微生物學雜志. 2011(05)
[3]肝病患者精氨酸代琥珀酸裂解酶分泌及與肝病相關血清學指標的關系[J]. 唐晚若,陳江,朱益斌,楊國英. 中外醫(yī)學研究. 2011(24)
[4]宏基因組技術及其應用研究進展[J]. 宋培勇,馬莉莉,王慶容,李黛,魏志琴. 貴州農業(yè)科學. 2009(10)
[5]畜禽養(yǎng)殖中抗生素使用的現(xiàn)狀、問題及對策[J]. 李振,王云建. 中國動物保健. 2009(07)
[6]抗生素抗性基因(ARGs)——一種新型環(huán)境污染物[J]. 羅義,周啟星. 環(huán)境科學學報. 2008(08)
[7]宏基因組學(Metagenomics)的研究現(xiàn)狀和發(fā)展趨勢[J]. 賀紀正,張麗梅,沈菊培,朱永官. 環(huán)境科學學報. 2008(02)
[8]獸用抗生素在土壤環(huán)境中的行為及其生態(tài)毒理效應研究進展[J]. 李兆君,姚志鵬,張杰,梁永超. 生態(tài)毒理學報. 2008(01)
[9]環(huán)境中抗生素殘留潛在風險及其研究進展[J]. 王冰,孫成,胡冠九. 環(huán)境科學與技術. 2007(03)
[10]土壤宏基因組學技術及其應用[J]. 沈菊培,張麗梅,鄭袁明,朱永官,賀紀正. 應用生態(tài)學報. 2007(01)
本文編號:3530516
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