本研究旨在挖掘玫瑰冠雞與科寶雞胚胎期胸肌組織中差異表達(dá)基因,探討2種雞肌肉發(fā)育及肌內(nèi)脂肪（IMF）沉積的分子遺傳機(jī)理。本研究利用RNA-Seq技術(shù)對(duì)玫瑰冠雞和科寶雞胚胎期胸肌組織中差異表達(dá)基因（Differentially expressed genes, DEGs）進(jìn)行篩選,通過GO富集和KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)DEGs的功能進(jìn)行注釋與分析。結(jié)果顯示:4個(gè)文庫(kù)共鑒定到4 643個(gè)差異表達(dá)基因,其中玫瑰冠公雞胸肌和科寶公雞胸肌中有1 909個(gè)顯著表達(dá)的基因,以科寶雞為參照,929個(gè)上調(diào),980個(gè)下調(diào);玫瑰冠母雞胸肌和科寶母雞胸肌中有2 734個(gè)顯著表達(dá)的基因,其中1 444個(gè)上調(diào),1 290個(gè)下調(diào)。經(jīng)熒光定量PCR驗(yàn)證,選取的12個(gè)差異基因的表達(dá)趨勢(shì)與測(cè)序結(jié)果一致。GO富集結(jié)果表明,MYL2調(diào)控骨骼肌的生長(zhǎng)發(fā)育,MYOG參與肌細(xì)胞的形成與分化;ACACA、ACOX2和ACOX3參與脂肪酸代謝過程;Notch1參與了胚胎發(fā)育及脂肪分化相關(guān)過程。此外,KEGG通路分析結(jié)果顯示,能量代謝相關(guān)的信號(hào)通路（mTOR）與肌肉發(fā)育相關(guān)的信號(hào)通路相互作用影響肌纖維的發(fā)育。細(xì)胞連接相關(guān)通路（局部粘附、ECM-受... 

【文章來源】：江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020,36(05)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：10 頁(yè)

【部分圖文】：

樣品間相關(guān)性分析

差異表達(dá)基因火山圖

差異表達(dá)基因維恩圖及聚類圖


本文編號(hào)：3517611