我國鴿（Columba livia）產量僅次于雞（Gallus gallus）、鴨（Anas platyrhynchos）、鵝（Anser cygnoides orientalis）,為名副其實的第四家禽。研究鴿遺傳資源的遺傳多樣性和品種鑒定,對于品種的保護和開發(fā)利用有重要的意義。本研究對白羽王鴿、泰深鴿和銀王鴿3個群體的線粒體DNA （mitochondrial DNA,mtDNA）細胞色素C氧化酶亞基Ⅰ（cytochrome C oxidase subunitⅠ, COI）基因全序列進行PCR擴增和測序。結果表明,鴿mtDNA COI基因全長為1 551 bp,沒有發(fā)現插入和缺失,編碼517個氨基酸。共計檢測到核苷酸變異位點7個,定義了6個單倍型,其中單倍型Hap1和Hap2為3個鴿品種共享,出現頻率分別為26次和15次�？傮w單倍型多樣性、核苷酸多樣性和平均核苷酸差異數分別0.726、0.000 98和1.518,其中銀王鴿最高,白羽王鴿最低。系統(tǒng)發(fā)育分析發(fā)現,家鴿和原鴿可以分為A和B 2個世系分支,中介網絡圖以Hap1為中心節(jié)點,呈星狀發(fā)散分布,經歷過群體擴張。上述結果揭示,鴿C... 

【文章來源】：農業(yè)生物技術學報. 2020,28(09)北大核心CSCD

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【部分圖文】：

鴿COI基因PCR擴增

通過對60條鴿COI基因序列分析表明，T、C、A和G 4種堿基含量分別為25.6%、32.1%、26.1%和16.2%,G含量最低，這種“非G”偏愛特性是后生動物線粒體基因組L-鏈堿基組成的特點。其中A+T含量(51.7%)高于G+C含量(48.3%)，符合大多數動物線粒體DNA的普遍特性。家禽在mtDNA D-loop區(qū)序列存在高度的長度變異(賈曉旭等,2017)，本研究3個品種鴿mtDNA COI基因全長均為1,551 bp，與雞(GenBank No.NC007235)、鵪鶉(GenBank No.AP003195)、鴨(GenBank No.KJ833587)、鵝(GenBank No.KU211647)的序列長度均一致，DNA序列本身不存在插入和缺失，說明線粒體COI基因編碼區(qū)進化速率要遠低于D-loop區(qū)。同時COI基因容易被通用引物擴增，本研究引物除了能擴增鴿COI基因，在雞上也有很好的擴增效果。同時，其還擁有蛋白編碼基因所共有的特征，即密碼子第3位堿基不受自然選擇壓力的影響，可以自由變異。因此作為DNA條形碼在動物物種鑒定中得到廣泛應用(Hebert et al.,2004)。圖3 基于鴿COI單倍型構建的中介網絡圖

圖2 基于mtDNA COI基因序列采用NJ法構建的系統(tǒng)發(fā)育樹本研究中泰深鴿來自法國，屬于歐洲地域品種；白羽王鴿和銀羽王鴿來自美國，屬于北美地域品種。在系統(tǒng)進化分析中沒有呈現出地理分化，也沒有發(fā)現品種特異性單倍型和顯著的遺傳分化，品種間表現弱的遺傳結構，可能跟鴿COI基因序列相對較為保守有關。要想區(qū)分不同的品種，需要結合細胞核內的分子標記，通過重測序尋找品種特異性的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)、微衛(wèi)星(simple Sequence Repeats,SSR)和基因拷貝數變異(copy number variations,CNV)等遺傳標記。

【參考文獻】：
期刊論文
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[3]基于線粒體基因組D-loop區(qū)全序列分析安義瓦灰雞遺傳多樣性及其起源進化關系[J]. 高玉時,賈曉旭,唐修君,唐夢君,樊艷鳳,陸俊賢,顧榮,葛慶聯(lián),蘇一軍.  農業(yè)生物技術學報. 2015(07)
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碩士論文
[1]鴿生長激素（GH）基因多態(tài)性及其與早期體重和屠宰性狀的關聯(lián)分析[D]. 賈曉旭.南京農業(yè)大學 2009



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